多组学分析表明,细胞黏附分子是免疫细胞浸润和不良结局的关键调控因子;同时,CLDN16在胰腺腺癌中的体外验证结果也证实了这一点

《Cellular and Molecular Life Sciences》:Multi-omics analysis reveals cell adhesion molecules as key regulators of immune cell infiltration and adverse outcomes and in vitro validation of CLDN16 in pancreatic adenocarcinoma

【字体: 时间:2025年12月19日 来源:Cellular and Molecular Life Sciences 6.2

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  胰腺腺癌(PAAD)的细胞粘附分子(CAM)异常影响肿瘤进展和耐药性,本研究整合TCGA和ICGC bulk RNA-seq及单细胞测序数据,通过共识聚类识别22个预后相关CAM基因并划分三个分子亚型。构建的11基因CAM风险模型(CDH3, CLDN16等)显示强预后价值,并有效预测化疗和免疫治疗反应。高危患者呈现基质激活、免疫逃逸及PD-1/PD-L1阻断耐药特征,单细胞分析揭示恶性与上皮性微环境中CAM表达差异,功能验证确认CLDN16促癌作用。

  

摘要

胰腺腺癌(PAAD)的特点是细胞粘附分子(CAMs)发生复杂的分子改变,这些改变会影响肿瘤的进展和治疗耐药性。识别具有临床意义的CAM特征有助于改善患者的分层和治疗策略。在这项研究中,我们将TCGA和ICGC的大规模RNA-seq数据与单细胞RNA-seq数据相结合,利用共识聚类方法识别与生存相关的CAM基因并定义分子亚型。我们发现了22个与预后相关的CAM基因,并确定了三个具有不同临床和免疫特征的分子亚组。基于11个基因的CAM风险模型(CDH3、CLDN16、CLDN3、CLDN15、ITGB1、NCAM1、SDC1、CD99L2、SLITRK2、LRRC4B、CD58)在各个队列中表现出良好的预后预测能力,并能有效预测化疗和免疫治疗的反应。高风险患者表现出细胞外基质激活、免疫逃逸以及对PD-1/PD-L1阻断治疗的反应较差。单细胞分析显示,CAM基因在恶性细胞和上皮细胞中的表达模式存在差异。功能验证证实CLDN16是一种促肿瘤因子,能够增强肿瘤侵袭性并降低细胞凋亡。这些发现凸显了基于CAM的特征在分类PAAD亚型、预测预后和制定个性化治疗策略方面的潜力。

图形摘要

胰腺腺癌(PAAD)的特点是细胞粘附分子(CAMs)发生复杂的分子改变,这些改变会影响肿瘤的进展和治疗耐药性。识别具有临床意义的CAM特征有助于改善患者的分层和治疗策略。在这项研究中,我们将TCGA和ICGC的大规模RNA-seq数据与单细胞RNA-seq数据相结合,利用共识聚类方法识别与生存相关的CAM基因并定义分子亚型。我们发现了22个与预后相关的CAM基因,并确定了三个具有不同临床和免疫特征的分子亚组。基于11个基因的CAM风险模型(CDH3、CLDN16、CLDN3、CLDN15、ITGB1、NCAM1、SDC1、CD99L2、SLITRK2、LRRC4B、CD58)在各个队列中表现出良好的预后预测能力,并能有效预测化疗和免疫治疗的反应。高风险患者表现出细胞外基质激活、免疫逃逸以及对PD-1/PD-L1阻断治疗的反应较差。单细胞分析显示,CAM基因在恶性细胞和上皮细胞中的表达模式存在差异。功能验证证实CLDN16是一种促肿瘤因子,能够增强肿瘤侵袭性并降低细胞凋亡。这些发现凸显了基于CAM的特征在分类PAAD亚型、预测预后和制定个性化治疗策略方面的潜力。

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