利用邻近标记技术绘制ER+乳腺癌细胞中的FOXA1相互作用组，发现其与孤儿核受体NR2C2的新相互作用 可购买

《Molecular Cancer Research》：Mapping the FOXA1 Interactome in ER+ Breast Cancer Cells Using Proximity Labeling Reveals Novel Interactions with the Orphan Nuclear Receptor NR2C2 Available to Purchase

FOXA1通过调控染色质可及性和核受体结合影响乳腺癌治疗抵抗，本研究利用miniTurbo标签和质谱技术系统鉴定其相互作用网络，发现157个新蛋白，其中42个（如NR2C2）与患者复发风险显著相关，多组学验证显示FOXA1与NR2C2共定位调控肿瘤进展相关基因表达。分隔符：

　　

摘要

FOXA1是一种先驱性的转录因子，在激素驱动的癌症中对于染色质的可及性和转录调控至关重要。在乳腺癌中，FOXA1在促进核受体结合、重新编程增强子结构以及促进与治疗耐药性相关的转录变化方面起着核心作用。尽管FOXA1的功能主要在雌激素受体-α（ER）的背景下进行研究，但其更广泛的蛋白质相互作用网络仍不完整。在这项研究中，我们使用基于邻近性的生物素标记（miniTurbo）结合定量LC-MS/MS蛋白质组学方法，系统地绘制了ER阳性乳腺癌细胞中与FOXA1相互作用的蛋白质图谱。我们改造了MCF-7细胞系，使其在N端或C端稳定表达带有miniTurbo标签的FOXA1，以确保全面覆盖所有相互作用界面。这种方法不仅发现了已知的FOXA1相互作用蛋白（如AR、MLL3、YAP1和GATA3），还识别出157个之前未报道的FOXA1相互作用蛋白。值得注意的是，其中42个新发现的相互作用蛋白（包括NR2C2）与ER阳性乳腺癌患者的无复发生存率显著相关。为了展示这一资源的实用性，我们深入研究了FOXA1与NR2C2之间的相互作用。通过结合染色质免疫沉淀测序和RNA测序，我们发现FOXA1和NR2C2共同占据了一部分基因组区域，并共同驱动与肿瘤进展相关的转录程序。我们的研究揭示了FOXA1更广泛的相互作用网络，并为其在乳腺癌中的功能提供了新的见解，为进一步探索这些蛋白质作为生物标志物或治疗靶点提供了候选对象。

意义：

这些发现扩展了FOXA1在乳腺癌中的相互作用网络，并发现了具有潜在生物标志物和治疗靶点价值的新候选蛋白质。