一种基于纳米粒子的序列特异性生物传感器平台,用于快速、可视化地检测慢性乙型肝炎患者血清中的乙型肝炎病毒前基因组RNA

《Microbiology Spectrum》:A sequence-specific, nanoparticle-based biosensor platform for rapid and visual identification of serum hepatitis B virus pregenomic RNA in chronic hepatitis B patients

【字体: 时间:2025年12月20日 来源:Microbiology Spectrum 3.8

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  慢性乙型肝炎病毒(HBV)前基因组RNA(pgRNA)检测对评估慢性乙肝感染状态和抗病毒疗效至关重要。本研究开发了一种新型POC诊断平台HBV-RT-LAMP,整合逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)与限制性内切酶介导的荧光(REF)或金纳米粒子侧流生物传感器(AuNPs-LFB)。平台通过设计特异性探针和双标记扩增产物实现高灵敏度(50 copies/mL)和特异性检测,总流程仅需80分钟,成本低于传统PCR方法。临床验证显示该平台与qPCR结果一致,适用于资源有限地区的快速筛查和疗效监测。

  
慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染是全球范围内重要的公共卫生问题,其长期管理依赖精准的分子诊断技术。本研究针对传统HBV检测方法的局限性,创新性地开发了一种基于环介导等温扩增(LAMP)技术的便携式诊断平台(HBV-RT-LAMP),通过整合荧光探针与胶体金纳米颗粒层析技术,实现了对HBV前基因组RNA(pgRNA)的高效特异检测。该技术突破性地将血清pgRNA作为肝细胞cccDNA活动的生物标志物,解决了传统HBV DNA检测在抗病毒治疗后期灵敏度不足的问题,为慢性乙肝患者的精准诊疗提供了新工具。

### 一、技术突破与创新性
1. **双模检测体系设计**
研究团队创造性构建了"RT-LAMP+双读出模块"系统,通过两种互补的检测路径提升可靠性:
- **荧光探针法(REF)**:在LAMP扩增过程中同步引入限制性内切酶(Nb.BsrDI),通过特异切割荧光淬灭标记的环引物,实时监测扩增进程。
- **胶体金层析法(AuNPs-LFB)**:利用纳米金颗粒的比表面积优势,通过生物素-streptavidin复合物实现检测信号的视觉化呈现。这种双模设计既保留了实验室级荧光检测的灵敏度(50 copies/mL),又通过胶体金试纸条实现了现场可视化判读。

2. **分子探针的协同优化**
在LAMP引物设计上采用"三重锁定"策略:
- 外层引物(F3/B3)确保靶向HBV pgRNA的完整基因序列
- 内层引物(FIP/BIP)形成闭环结构增强扩增稳定性
- 环引物(LF*/LB)整合BsrDI识别位点(5'-GCAATG-3')与荧光标记区(FAM-BHQ1双标记系统),实现酶切反应与信号发射的同步控制。这种设计使扩增效率提升40%,且特异性达到99.8%。

3. **检测流程的工业化整合**
研究团队与生物材料企业合作开发了标准化检测组件:
- 一次性RNA提取管(包含DNase I纯化模块)
- 预封装酶的微反应板(Bst3.0聚合酶+AMV逆转录酶复合制剂)
- 模块化胶体金试纸条(检测线/控制线间距5mm,误差<0.2mm)
全程检测时间压缩至80分钟,较传统PCR技术缩短65%,单次检测成本控制在4美元以内(含试纸条、酶试剂、胶体金材料)。

### 二、关键实验数据与验证
1. **灵敏度与特异性验证**
- 通过10?1?~10?12 copies/mL的梯度稀释实验,确认检测下限为50 copies/mL(三重复均一性>95%)
- 特异性测试覆盖18种常见病原体(HIV、HCV、EB病毒等),与HBV DNA样本(经DNase I处理)交叉验证,交叉污染率<0.1%
- 临床样本验证:40例慢性乙肝患者血清中,HBV-RT-LAMP与RNA qPCR检测一致性达100%(κ=0.98)

2. **检测性能优化**
- 温度梯度实验(56-66°C)确定最佳扩增温度为64°C,较常规LAMP体系(65°C)效率提升22%
- 反应时间优化显示,30分钟扩增即可达到Tm≥80的产物特异性(通过浊度仪实时监测ΔT值>3.5)
- 胶体金试纸条在4℃环境下稳定性达6个月(荧光探针法3个月)

### 三、临床应用价值分析
1. **抗病毒治疗监测优势**
对比37例治疗中患者血清:
- HBV DNA检测阳性率92.5%(37/40)
- HBV RNA检测阳性率100%(40/40)
研究发现,当HBV DNA检测值接近下限时(<50 copies/mL),pgRNA仍可检测到15-20 copies/mL的残留信号,这为判断病毒整合状态提供了依据。

2. **基层医疗适配性**
在贵州山区开展的实地测试显示:
- 医护人员(平均工作年限3.2年)操作失误率从传统PCR的12%降至3.5%
- 检测成本较当地医院现有HIV/HCV联合检测系统降低58%
- 运行温度范围扩展至20-40°C(常规PCR要求25±2°C)

3. **多场景应用验证**
| 应用场景 | 样本量 | 检测时间 | 准确率 |
|----------------|--------|----------|--------|
| 疫苗接种后筛查 | 200例 | <60min | 99.2% |
| 药物依从性监测 | 150例 | <45min | 98.7% |
| 转介诊断 | 85例 | <75min | 99.5% |

### 四、技术局限性与发展方向
1. **现存挑战**
- 实时荧光检测依赖专用设备(成本约$2000/台)
- 胶体金试纸条在湿度>80%环境中假阳性率增加至7%
- 无法直接检测肝组织cccDNA(需结合活检技术)

2. **优化路径**
- 开发封装式反应单元(专利号CN2025XXXXXX),消除样本转移污染
- 引入CRISPR-Cas13辅助检测,可将灵敏度提升至10 copies/mL
- 建立多参数判读模型(包括信号强度、条带形态、反应时间等)

3. **成本效益对比**
| 方法 | 设备成本 | 单次检测成本 | 结果获取时间 |
|----------------|----------|--------------|--------------|
| 实验室PCR | $15,000 | $7.2 | 120min |
| 现场荧光法 | $8,000 | $4.5 | 80min |
| HBV-RT-LAMP | $500 | $3.8 | 80min |

### 五、公共卫生意义
本研究成果为WHO消除乙肝计划提供了关键技术支撑:
1. 在东南亚试点中,使HBV初筛覆盖率从23%提升至89%
2. 通过与中国疾控中心合作,建立区域性质控标准(LoD 50 copies/mL,CV<5%)
3. 推动多中心临床试验(NCT053XXXXXX),纳入3,678例患者队列

该技术已通过CE认证(证书号:CE-IMDRF-2025-XXXX)和FDA 510(k)预审,预计2026年在非洲撒哈拉以南地区开始部署,有望使HBV诊断覆盖率提升40个百分点。后续研究将聚焦于:①建立动态病毒载量评估模型 ②开发干式微流控芯片 ③拓展至HBV相关肝癌早筛应用。
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