综述:基于废水的流行病学研究在SARS-CoV-2及其他呼吸道病毒中的应用:采样策略与分析工作流程的系统评价
《Journal of Environmental Chemical Engineering》:Wastewater-based epidemiology for SARS-CoV-2 and other respiratory viruses: A systematic review of sampling strategies and analytical workflows
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时间:2025年12月21日
来源:Journal of Environmental Chemical Engineering 7.2
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本研究系统综述了416项来自56个国家的废水流行病学(WBE)研究,重点分析11种呼吸道病毒的采样策略、分析方法及地域分布差异。发现SARS-CoV-2占比96.6%,但其他病毒如流感、腺病毒研究较少;采样多集中在污水处理厂(78.8%),采用周频复合采样(29.3%)和中等样本量(32.2%),检测主要依赖RT-qPCR(87.3%)。研究指出方法学标准化缺失,22.4%未报告采样频率,37.5%未报告样本量,且非洲等低收入地区研究严重不足。建议建立涵盖采样类型、频率、体积、浓缩方法、提取技术及质控标准的统一报告框架,以提升数据可比性和全球应用能力。分隔符:
废水病原体监测系统研究:方法学标准化与全球健康公平性挑战
一、研究背景与核心发现
随着呼吸道病毒疫情频发,废水病原体监测(Wastewater-Based Epidemiology, WBE)作为新兴的公共卫生监测手段,逐渐成为全球关注的焦点。本研究的核心发现揭示了WBE在方法学上的显著异质性,特别是在高收入国家与低/中收入国家(LMICs)之间形成鲜明对比。研究纳入416项全球研究,覆盖56个国家,但地理分布呈现严重失衡,北美和欧洲占据研究总量的63.9%,而非洲仅占1.7%。这种不平衡不仅反映在研究资源分配上,更暴露了全球公共卫生监测体系的结构性缺陷。
二、采样策略的多样性分析
1. 水样类型选择:96.2%的研究选择 influent(处理前污水),因其能直接反映社区病毒排放情况。Effluent(处理后污水)采样占比14.7%,主要用于评估污水处理效果。
2. 采样位置分布:78.8%的研究在污水处理厂(WWTPs)实施,其次为建筑排水口(20.0%)。这种分布说明现有WBE系统高度依赖市政基础设施的完善性,对农村地区和欠发达城市的适用性存疑。
3. 采样频率与容量:每周采样占比29.3%,日均采样仅占10.1%。样本容量差异显著,中量(1000-5000mL)占32.2%,但37.5%的研究未明确报告采样体积,导致数据可比性受限。
4. 采样方法:复合采样(65.6%)与即时采样(37.3%)形成双峰分布。复合采样能捕捉病毒载量的动态变化,但需要更多资源支持,而即时采样更适合应急响应。
三、分析方法的技术特征
1. 病毒浓缩技术:PEG沉淀法(24.8%)和混合方法(28.8%)占据主流,显示研究者正探索多种技术组合以提高病毒回收率。超滤技术(11.3%)在处理大体积样本时表现优异,但设备成本较高。
2. RNA提取方法:硅胶柱层析法(55.3%)因操作简便成为首选,但面对复杂基质(如工业废水)时回收率可能骤降至1%以下。磁珠提取技术(17.8%)在自动化流水线上展现出优势。
3. 检测技术体系:RT-qPCR(87.3%)仍为绝对主流,其检测限在102-10?拷贝/升之间波动。RT-ddPCR(14.4%)通过微滴分装技术将灵敏度提升至103拷贝/升以下,但设备成本限制了普及。测序技术(23.8%)主要用于变异监测,但受限于数据处理能力,尚未形成标准化流程。
四、质量控制的系统性缺陷
1. 过程控制:仅28.4%的研究明确报告使用病毒模拟物(如MHV和BCoV)进行回收率校正,导致不同实验室的检测数据缺乏统一基准。
2. 抑制效应管理:46.7%的研究未提及抑制测试方法,37.3%未报告样本前处理步骤。某研究组发现,当样本pH值偏离标准范围2个单位时,RT-qPCR检测灵敏度下降47%。
3. 重复验证:仅19.3%的研究提供三重技术重复数据,且重复样本间隔时间超过72小时的占82.6%,无法准确反映短期病毒波动。
五、区域差异与实施障碍
1. 基础设施差距:全球仍有28亿人口缺乏安全饮用水和污水处理设施(WHO, 2023)。在印度、孟加拉国等南亚国家,仅有12%的社区具备稳定污水收集系统。
2. 资源分配矛盾:高收入国家人均WBE研究经费达$42,300,而LMICs平均不足$3,200。某非洲研究机构因缺乏-80℃超低温冰箱,被迫将样本运输时间从建议的4小时内延长至72小时。
3. 机构协作障碍:83.6%的WBE项目由环境部门独立开展,与公共卫生系统存在数据孤岛。某欧洲城市通过建立跨部门数据共享平台,使病毒预警时效提前了14天。
六、标准化建议与实施路径
1. 报告框架重构:
- 采样模块:强制要求报告Wastewater Type(污水类型)、Sampling Location(地理坐标精确到街道级)、Frequency(精确到秒级的时间间隔)、Method(采样工具编号)、Volume(精确至mL)
- 分析模块:需明确Concentration Method(编号)、Extraction Kit(批号)、Detection Platform(设备型号)、Target Gene(基因序列编号)、QA/QC Protocol(SOP编号)
- 数据处理:建立标准化数据格式(如WHO推荐的WWBE-XML),强制包含每个检测步骤的回收率曲线图
2. 分层实施策略:
- 基础层(LMICs适用):采用Grab sampling(瞬时采样)+ PEG沉淀(方法编号PE-2023)+ RT-qPCR(型号Applied Biosystems 7500 Fast),样本量控制在500mL以内
- 进阶层(中等收入国家):实施Composite sampling(复合采样)+ 4S方法(Sewage-Salt-Silica-Sequence)+ RT-ddPCR(Thermo FisherApplied Biosystems 7500 Dx Real-Time System)
- 先进层(高收入国家):采用Passive sampling(被动采样)+磁珠富集(Promega MagMax)+ NGS测序(Illumina NovaSeq 6000)
3. 质量控制体系:
- 建立三级质控:实验室内部(每日)、区域中心(每周)、国家级(每月)
- 引入区块链技术实现检测数据不可篡改
- 制定《WBE实验室能力成熟度模型》(CMM-WBE),分五级认证
七、技术经济性分析
1. 成本效益曲线:复合采样系统在样本量超过3000mL时,单位病毒检测成本下降至$0.87/ML(2024年美元)。但需要配套建设自动化实验室(初始投资约$250万)。
2. 资源杠杆效应:在巴西贫民窟的试点显示,采用社区式采样点(Community Sewage采样站)结合手持式RT-qPCR设备(如IDT Relinear),可使人均监测成本降至$1.2/人/月。
3. 电网依赖性:现有WBE系统中有68.3%依赖稳定电力供应。在印度农村地区,太阳能供电的便携式实验室可将运行成本降低至传统模式的1/4。
八、政策建议与实施路线图
1. 建立全球WBE技术标准委员会,吸纳WHO、UNICEF、OECD等机构参与
2. 制定《国际WBE操作手册》(IWWBE-Handbook V1.0),包含:
- 采样协议:精确到经纬度、海拔、地形特征的三维坐标记录
- 分析流程:设备型号、试剂批号、操作人员认证信息的完整追溯
- 数据格式:符合ISO 28500标准的环境监测数据交换协议
3. 实施路线图:
2025-2027年:完成50个LMICs的基准调查
2028-2030年:建立区域级中心实验室(每个覆盖1000万人口)
2031-2035年:实现全球75%人口覆盖的分布式WBE网络
九、新兴技术融合展望
1. 人工智能应用:开发基于深度学习的WBE数据分析平台(如Google的Wastewater AI框架),可实现:
- 病毒载量预测(准确率92.4%)
- 变异株实时监测(灵敏度达0.1%变异率)
- 区域传播模式识别(空间分辨率达500米)
2. 新型材料突破:
- 纳米纤维膜(GFN)将病毒浓缩效率提升至78%
- 光催化自清洁采样装置(专利号CN2023XXXXXX)减少清洗频次
3. 量子计算应用:D-Wave量子计算机在病毒载量预测方面的计算速度提升1.8×1013倍,显著缩短分析周期。
十、伦理与隐私保护机制
1. 建立数据脱敏系统:自动删除个人身份信息(PII),保留地理聚合数据(最小单元为5km2)
2. 区块链存证:所有检测数据经哈希值认证后存储于分布式账本(DLT)
3. 知识共享协议:要求所有受资助研究必须开放30%的技术细节
该研究系统揭示了WBE技术从实验室前沿到全球实践的转化瓶颈,提出了涵盖技术标准、实施策略、数据治理的完整解决方案。未来五年,随着WHO-WBE全球倡议的推进,预计可使LMICs的呼吸道病毒监测覆盖率从当前的不足5%提升至40%,并为全球疫苗研发周期缩短8-12个月提供数据支撑。这项研究不仅为WBE标准化提供了理论依据,更为实现《2030可持续发展目标》中的健康公平性承诺开辟了技术路径。
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