整合的单核与空间转录组学技术揭示了顶盖室管膜瘤的异质性及缺氧驱动的组织结构 现已上市销售

《Cancer Research》：Integrated Single-Nucleus and Spatial Transcriptomics Elucidate Heterogeneity and Hypoxia-Driven Organization of Supratentorial Ependymoma Available to Purchase

脑膜瘤分子异质性研究揭示单细胞与空间转录组特征，发现ZFTA融合相关新调控程序，并建立缺氧驱动的空间架构模型。

　　

摘要

顶盖室管膜瘤（ST-EPN）是一种常常危及生命的脑肿瘤，其特点是分子异质性显著。缺氧会加剧这种异质性，但这种关系的程度和本质仍不清楚。这给有效的治疗策略带来了挑战，需要更全面和深入地理解其生物学机制。在本研究中，我们利用单核（n = 63）和空间（n = 30）转录组学方法来描绘ST-EPN的细胞和空间特征。通过对这种肿瘤转录组模式的分析，我们发现了两个先前未被描述的转录程序，这些程序与细胞外基质的重塑以及ZFTA融合蛋白的生成有关。这些程序与不良预后相关，并且仅存在于ZFTA融合阳性的肿瘤中。通过开发一套能够识别混合转录组信号的空间评分算法，我们发现了缺氧作为潜在空间组织驱动因素的作用。结合程序之间的重复空间关联，我们构建了一个描述其高级结构的一般模型。该模型中功能性和空间性定义的区域显示出不同的免疫细胞分布，其中缺氧区域的免疫细胞密度最高。这些结果为了解ST-EPN的分子异质性和空间组织提供了新的见解，可能有助于未来针对该肿瘤的靶向治疗策略的开发。

意义：

对顶盖室管膜瘤转录和空间异质性的研究为探索针对不同微环境中肿瘤细胞的潜在治疗靶点提供了重要依据。

图形摘要

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