摘要
背景
线粒体通透性转换(MPT)驱动的坏死是一种新近发现的程序性细胞死亡形式,对肿瘤进展、治疗反应和预后有显著影响。然而,关于肝细胞癌(HCC)中与线粒体通透性转换驱动的坏死相关的长链非编码RNA(MPTDNRlncRNAs)的研究仍然有限。
方法
在本研究中,我们旨在构建一个MPTDNRlncRNA特征谱,以预测HCC患者的生存情况并进行分类。RNA测序和临床数据来自Cancer Genome Atlas数据库,而与MPT驱动的坏死相关的基因则来自Gene Set Enrichment Analysis数据库。我们鉴定了HCC肿瘤组织中的MPTDNRlncRNAs,并使用最小绝对收缩量和选择算子-Cox分析方法构建了一个预测性lncRNA特征谱。我们分析了高风险组和低风险组之间的免疫细胞浸润差异。通过统计方法评估了MPTDNRlncRNA特征谱的性能,并利用生物信息学方法研究了不同风险组之间的功能差异和通路差异。
结果
我们开发了一个特定的HCC相关lncRNA特征谱,并通过生存分析、时间依赖性接收者操作特征曲线和Cox回归分析对其预测准确性进行了系统评估。相关性分析显示,该lncRNA特征谱与免疫细胞浸润及多个免疫检查点靶标之间存在强烈关联,并且对HCC患者的预后具有显著价值。此外,LINC02313在体外被证实是一个关键lncRNA,其在促进细胞增殖和肿瘤转移中发挥作用。最后,我们使用肝癌类器官模型验证了LINC02313的功能。
结论
成功构建的与MPT驱动的坏死相关的预后模型凸显了其独立预测HCC患者预后的潜力。这些发现不仅加深了我们对MPT驱动的坏死机制的理解,还为开发更有效的治疗策略提供了新的理论基础。LINC02313基因已被确定为促进HCC增殖和侵袭的因子,表明其作为HCC治疗靶点的潜力。
1 引言
在全球范围内,原发性肝癌是癌症相关死亡的第四大原因,其组织学和生物学特性具有明显的异质性[1]。肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝癌类型,占所有原发性肝癌的90%以上[2]。尽管近年来HCC的治疗方法(包括手术、靶向免疫疗法和介入治疗[3)有所改进,但由于诊断效率低以及肿瘤转移的发生,总体生存率仍然较低[4。


