《ACS Omega》:ATR-FTIR Spectroscopy for Detection of Anti-interferon-Gamma Autoantibodies
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本研究首次将衰减全反射-傅里叶变换红外(ATR-FTIR)光谱技术结合机器学习算法,应用于抗干扰素-γ自身抗体(AIGA)的快速检测。该技术通过分析血浆样本的分子指纹,实现了对AIGA阳性患者的高精度区分(准确率95%,特异性100%),为成人发病免疫缺陷症(AOID)的筛查提供了一种快速、低成本的辅助诊断新策略。
研究背景与临床需求
成人发病免疫缺陷症(Adult-onset immunodeficiency, AOID)是一种与人类免疫缺陷病毒(HIV)无关的获得性免疫缺陷疾病,其发病机制与体内产生抗干扰素-γ自身抗体(Anti-interferon-gamma autoantibodies, AIGA)密切相关。AIGA会中和干扰素-γ(IFN-γ),破坏细胞免疫,导致患者对非结核分枝杆菌(NTM)等机会性病原体高度易感,甚至危及生命。因此,AIGA的检测对于AOID的诊断、监测和预后判断至关重要。
目前,检测AIGA的“金标准”方法是抑制性酶联免疫吸附试验(Inhibitory ELISA)。然而,该方法存在耗时长、需要批量处理样本、成本较高等局限性,难以满足临床快速筛查的需求。因此,开发一种快速、简便、低成本的AIGA检测方法具有重要的临床意义。
技术原理与创新点
衰减全反射-傅里叶变换红外(Attenuated total reflectance-Fourier transform infrared, ATR-FTIR)光谱技术是一种基于分子振动原理的分析技术。当红外光照射到样本时,样本中的化学键会吸收特定波长的光,产生独特的“分子指纹”光谱。通过分析这些光谱,可以获取样本的化学组成和结构信息。
本研究创新性地将ATR-FTIR技术应用于AIGA的检测。该技术具有样本用量少(仅需5 μL)、分析速度快、无需标记、成本低廉等优势。研究团队进一步结合主成分分析(Principal Component Analysis, PCA)和偏最小二乘判别分析(Partial Least-Squares-Discriminant Analysis, PLS-DA)等机器学习算法,对光谱数据进行深度挖掘,旨在建立一种能够快速、准确区分AIGA阳性患者的新方法。
样本来源与实验设计
研究共纳入75名受试者,分为三组:
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AIGA阳性组(AIGA POS):45名患者。
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AIGA阴性组(AIGA NEG):15名患者。
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健康对照组(Healthy Control, HC):15名健康个体。
所有样本均为肝素化血浆或血清。AIGA的浓度通过抑制性ELISA进行测定,作为参考标准。研究采用ATR-FTIR光谱仪对样本进行检测,每个样本重复测量三次以确保可重复性。随后,利用PCA和PLS-DA等算法对光谱数据进行分析,以区分不同组别的样本。
关键发现与结果分析
1. 样本类型无显著影响
研究首先比较了肝素化血浆和血清样本的ATR-FTIR光谱。结果显示,两种样本的平均光谱模式几乎完全相同,PCA分析也显示数据点高度重叠。这表明,样本类型(血浆或血清)对ATR-FTIR分析结果没有显著影响,增强了该方法的临床适用性。
2. AIGA患者光谱特征显著改变
与健康对照组相比,AIGA阳性患者的光谱在指纹区(1800–800 cm–1)表现出显著差异。研究共鉴定出9个差异峰位,其中3个峰位的吸光度差异具有统计学意义:
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1632 cm–1:与β-折叠结构(β-sheet structure)相关。
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1073 cm–1:与脱氧核糖/核糖(DNA/RNA)相关。
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1033 cm–1:与胶原蛋白和β-异构体的C-O伸缩振动相关。
PCA分析显示,AIGA阳性患者与健康对照组在指纹区和酰胺区(1700–1500 cm–1)均能实现有效分离,表明AIGA阳性患者的血浆样本在分子水平上存在独特的化学特征。
3. 蛋白质二级结构发生改变
为了深入探究蛋白质结构的变化,研究人员计算了酰胺I区(1700–1600 cm–1)与酰胺I+II+III区(1700–1000 cm–1)的吸光度面积比值(Aamide I/Aamide I+II+III)。结果显示,AIGA阳性患者的该比值显著低于AIGA阴性组和健康对照组,表明其蛋白质组成发生了显著重排。
进一步分析发现,AIGA阳性患者的光谱在1649 cm–1(α-螺旋结构)处的峰强度降低,而在1632 cm–1(β-折叠结构)处的峰强度升高。这表明AIGA阳性患者的蛋白质二级结构发生了从α-螺旋向β-折叠的构象转变。此外,在1560–1464 cm–1区域(与免疫球蛋白G,IgG相关)的吸光度强度也显著增加,这与AIGA作为自身抗体的本质相符。
4. 机器学习模型实现高精度预测
研究团队利用PLS-DA算法,基于酰胺区的光谱数据建立了一个预测模型,用于区分AIGA阳性患者和AIGA阴性患者。该模型在训练集上表现出良好的分离效果。
在独立测试集(15名AIGA阳性患者和5名AIGA阴性患者)上进行验证时,该模型取得了优异的性能:
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准确率(Accuracy):95%
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灵敏度(Sensitivity):93.3%
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特异性(Specificity):100%
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阳性预测值(Positive Predictive Value, PPV):100%
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阴性预测值(Negative Predictive Value, NPV):83.3%
在比较了多种机器学习算法(包括支持向量机、随机森林、神经网络和k-近邻算法)后,PLS-DA和k-近邻算法(k-Nearest Neighbor, kNN)表现出了最高的分类性能。
研究结论与临床意义
本研究成功开发并验证了一种基于ATR-FTIR光谱技术结合机器学习算法的AIGA检测新方法。该方法能够通过分析血浆样本的分子指纹,快速、准确地识别AIGA阳性患者,其诊断性能达到了临床可接受的水平。
该技术作为一种无标记、非破坏性、低成本的筛查工具,有望成为现有ELISA方法的有效补充。在临床实践中,ATR-FTIR可用于对疑似AOID的患者进行快速初筛,从而优先对高风险样本进行确证性检测,优化医疗资源分配,缩短诊断时间。
研究局限性与未来展望
尽管研究结果令人鼓舞,但仍存在一些局限性。首先,样本量相对较小,且主要来自单一中心,未来需要在更大规模、多中心的人群中进行外部验证。其次,ATR-FTIR技术对环境因素(如晶体温度和压力)较为敏感,需要建立标准化的操作流程以控制潜在干扰。此外,模型在区分AIGA阳性患者与某些临床表现相似的AIGA阴性患者时,仍需进一步提高其灵敏度和特异性。
未来的研究方向包括:优化光谱预处理和特征选择算法,提高模型的鲁棒性;将该技术应用于其他自身免疫性疾病的诊断;以及探索其在疾病纵向监测和疗效评估中的潜在价值。