《JOURNAL OF CLINICAL LABORATORY ANALYSIS》：The Application Value of Bronchoalveolar Lavage Fluid Metagenomic Next-Generation Sequencing in Moderate-to-Severe Bronchiectasis
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本文系统评价了支气管肺泡灌洗液（BALF）宏基因组二代测序（mNGS）在中重度支气管扩张病原学诊断中的价值。研究表明，相较于传统检测方法，BALF-mNGS具有更高敏感性（100% vs 34%, p<0.01）和混合感染检出率（48.08% vs 7.69%），能显著提升抗感染治疗精准度，缩短住院时间（7.85天 vs 9.36天）并降低医疗成本。该技术为呼吸道感染病原体快速鉴定提供了新策略。
研究背景与意义
支气管扩张作为第三大慢性气道疾病，其全球患病率持续上升，对医疗系统造成沉重负担。感染是导致病情急性加重的主要因素，快速准确的病原学诊断成为治疗关键。传统病原学检测方法（涂片、培养）存在耗时长、阳性率低等局限，而基于支气管肺泡灌洗液（BALF）的宏基因组二代测序（mNGS）技术能够无偏倚地检测样本中全部微生物核酸，在罕见病原体和混合感染诊断中展现独特优势。
研究方法设计
本研究纳入2022年5月至2024年3月佛山市中医院收治的52例中重度支气管扩张患者，所有患者均同步进行BALF-mNGS和传统病原学检测（细菌培养、真菌培养、抗酸杆菌涂片）。疾病严重程度根据支气管扩张严重指数（BSI）评分系统分级，涵盖年龄、体重指数（BMI）、FEV1占预计值百分比等8项指标。通过纤维支气管镜采集BALF样本后，分别进行mNGS检测（包括核酸提取、高通量测序和生物信息学分析）和常规检测。
核心发现与数据分析
病原体检出率对比显示，mNGS阳性率显著高于传统方法（96.15% vs 32.69%, χ2=31.03, p<0.001）。在52例患者中，mNGS共检测到102株病原体，包括76株细菌、8株真菌、6株DNA病毒、5株RNA病毒和7株分枝杆菌，而传统方法仅检出22株病原体。两种方法均以细菌检测为主，铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）均为最常见细菌，烟曲霉（Aspergillus fumigatus）为最常见真菌。但mNGS在病毒检测方面具有明显优势，检测到EB病毒、鼻病毒等5种病毒。
混合感染检测能力方面，mNGS检出25例（48.08%）混合感染，包括10例多重细菌感染、5例细菌-病毒混合感染等复杂类型；而传统方法仅检出4例（7.69%）混合感染，差异具有高度统计学意义（p<0.01）。在单一病原体感染中，mNGS以流感嗜血杆菌（Haemophilus influenzae）为主（38.10%），而传统方法以铜绿假单胞菌为主（46.15%）。
诊断效能与临床价值
以临床综合诊断为金标准，mNGS灵敏度达100%，较传统方法（34%）提升66%（p<0.01）。在17例双阳性病例中，两种方法完全一致率为41.18%。mNGS指导的抗感染治疗显著改善患者临床症状，平均住院时间（7.85天 vs 9.36天）和住院费用（9932.56元 vs 11548.67元）均显著降低（p<0.05）。样本量效能验证表明，当前52例样本量足以检测30%以上的灵敏度差异和混合感染率差异。
技术优势与局限讨论
mNGS技术优势体现在：不受前期抗生素使用影响；能检测难培养病原体（如诺卡菌、非结核分枝杆菌）；单次检测覆盖范围广。但需注意排除定植菌污染，本研究设置序列数阈值（50条）并结合临床进行综合判读。局限性包括缺乏标准化结果解读标准、检测成本较高、样本量有限等。
结论与展望
BALF-mNGS作为补充诊断工具，显著提升中重度支气管扩张病原诊断精度，尤其适用于混合感染和疑难病例。未来需开展多中心研究验证其临床价值，并探索耐药基因检测等延伸应用。随着技术进步和成本降低，该技术有望在呼吸道感染诊疗中发挥更重要作用。
