解析环状排列 II 型内含子自剪接的结构基础:开启 circRNA 研究与治疗新视野
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时间:2025年02月01日
来源:Nature Structural & Molecular Biology 12.5
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目前,环状排列 II 型内含子(CP 内含子)生成环状 RNA(circRNA)的结构和机制尚不明确。研究人员开展了 CP 内含子在反向剪接不同状态下的研究,解析出其冷冻电镜结构。该研究阐释了 CP 内含子反向剪接动态机制,对 circRNA 研究和治疗有重要意义。
环状排列 II 型内含子(CP 内含子)由重排的结构域组成,这些结构域被两个相连的外显子隔开,通过反向剪接产生分支状内含子和环状外显子。目前,对于 CP 内含子生成环状 RNA(circRNA)的结构和机制仍知之甚少。研究人员解析了一种天然 CP 内含子在反向剪接不同状态下的冷冻电镜(cryo-EM)结构,分辨率达到 2.5 - 2.9 ?。分支形成后,结构域 6(D6)发生 65° 的构象变化,以促进 3'- 外显子的识别和环化。此前未被发现的三级相互作用使催化三联体和 D6 紧密结合,从而实现无蛋白质参与的剪接过程;同时,在剪接过程中还观察到一种金属离子 M35,它能够稳定 5'- 外显子。这些独特特征在经典的 II 型内含子和剪接体中并未被观察到,但在 CP 内含子中却很常见,通过比较基因组分析发现的另一种 CP 内含子的冷冻电镜结构也证实了这一点。研究结果揭示了 CP 内含子反向剪接动态变化的机制,在 circRNA 研究和治疗领域具有潜在的应用价值。
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