SAMPL-seq 技术揭示人体肠道微生物组的微米级空间枢纽，开启肠道微生态研究新视野

目前，人们对人体肠道微生物组在微米尺度的空间组织了解有限。研究人员开展了关于 Split-And-pool Metagenomic Plot-sampling sequencing（SAMPL-seq）技术的研究。该研究识别出共定位微生物及 “空间枢纽”，发现饮食干预下肠道微生物组会发生空间重排，为深入了解微生物组提供了新视角。

　　微生物的局部排列会对群落组装、功能和稳定性产生深远影响。然而，我们对人体肠道微生物组在微米尺度的空间组织的认知十分有限。在此，有一种名为 Split-And-pool Metagenomic Plot-sampling sequencing（SAMPL-seq）的高通量简化方法，可用于捕捉复杂微生物群落中的空间共定位情况。该方法通过分割 - 合并条形码技术获取微米尺度亚群落的微生物组成。

对健康人体肠道微生物组进行 SAMPL-seq 分析后，研究人员识别出在不同时间以及多个个体中都持续共同出现的细菌类群对。这些共定位的微生物会组织成由拟杆菌科（Bacteroidaceae）、瘤胃球菌科（Ruminococcaceae）和毛螺菌科（Lachnospiraceae）主导的空间上不同的群体，即 “空间枢纽”。

以菊粉作为饮食干扰因素进行研究时，研究人员观察到肠道微生物组发生了可逆的空间重排，特定的分类群形成了新的局部伙伴关系。利用 SAMPL-seq 进行空间宏基因组学研究，有助于从微米尺度深入了解微生物组。