参数化重置模型揭示小鼠生物钟剂量依赖性同步化的简单法则

【字体: 时间:2025年02月07日 来源:Nature Communications 14.7

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  本研究通过建立参数化重置模型,成功量化了小鼠昼夜节律钟对不同浓度刺激的相位响应特性。研究人员创新性地利用奇异点响应(SR)参数将复杂的相位响应曲线(PRC)转化为可计算的振幅与相位参数,发现SR振幅遵循希尔方程(Hill equation),并揭示了多重刺激联合作用的叠加法则。该研究为理解生物钟在复杂环境下的同步机制提供了普适性量化工具,对昼夜节律紊乱疾病的治疗策略开发具有重要指导意义。

  

在生命科学领域,生物钟如何精确同步环境变化始终是未解之谜。传统相位响应曲线(PRC)分析面临两大困境:一是测量耗时,需在不同时间点多次刺激;二是曲线形态会随刺激强度发生"拓扑变形",从连续型(type-1)突变为不连续型(type-0),使得不同强度PRC难以直接比较。更棘手的是,多重刺激组合或背景浓度变化时,相位响应呈现复杂非线性特征,至今缺乏普适性量化模型。

日本筑波大学的研究团队在《Nature Communications》发表突破性研究,通过建立参数化重置模型,将复杂PRC转化为两个核心参数——奇异点响应(SR)的振幅和相位。研究人员发现SR振幅随刺激浓度变化完美符合希尔方程,而多重刺激效应可通过SR参数的矢量叠加预测。这项研究不仅揭示了生物钟同步化的简单数学法则,更开发出仅需单次测量即可量化PRC的高效方法。

关键技术包括:1) 利用PER2::LUC报告基因小鼠的胚胎成纤维细胞(MEF)和组织切片进行生物发光监测;2) 开发基于圆形极限环模型的PRC重建算法;3) 通过梯度下降法优化希尔方程参数;4) 采用Kronos HT自动化监测设备实现高通量数据采集。

PRC变形与SR参数

研究发现传统PRC分析存在固有缺陷:当刺激强度超过临界值时,最大相位位移会突然锁定在12小时(图1c),而SR振幅则呈现连续单调增长。这种特性使SR参数能统一量化type-1和type-0型PRC。通过圆形极限环模型验证,证实SR相位恒定指向节律被重置的目标相位(图1d),为建立普适性模型奠定基础。

多种刺激的剂量响应

分析锂盐(LiCl)、forskolin(FK)和皮质酮的SR参数发现,所有刺激的剂量-响应关系均符合希尔方程(图2a)。特别值得注意的是,SR相位与振幅呈线性相关(图2b),使得任意浓度PRC都可通过四个参数(EC50、n、相位斜率及截距)精确预测。以FK为例,基于SR参数重建的PRC与实验测量结果高度吻合(图2c)。

组合刺激效应预测

研究提出两种预测模型:对于不同通路刺激(如DEX与FK),SR参数服从矢量叠加法则(图3a);而对同类刺激(如两种糖皮质激素),需先将浓度转换为"等效剂量"再求和(图3d)。实验证实,当预测SR振幅<0.8时,矢量叠加模型误差<10%(图3b),而等效浓度模型对同类刺激预测更精准(图3e)。重建的组合刺激PRC与实测结果高度一致(图3f)。

背景效应机制

预刺激(背景)会显著减弱后续刺激响应,这种衰减程度可通过"背景SR参数减法"准确预测(图4a)。实验显示,地塞米松(DEX)背景存在时,后续DEX刺激响应随背景浓度升高呈渐进式衰减(图4d-f)。有趣的是,背景衰减速率因刺激而异:FK在培养基中代谢较快,而DEX更稳定,暗示临床需考虑药物代谢差异对生物钟调节的影响。

直接SR测量验证

在MEF细胞中直接测量SR参数,证实DEX的EC50比皮质酮低10倍(图5b),反映其更强同步化能力。拮抗剂米非司酮(MF)实验显示,SR参数可量化抑制效应——高浓度DEX背景下,MF诱导的SR相位与DEX相反(图5o),振幅恰等于DEX响应的抑制量(图5n),完美验证"响应抵消"假说。

组织特异性研究

肺、脂肪等组织切片显示,SR参数变化规律与细胞培养一致(图6a-d),但肾脏表现出独特相位延迟。值得注意的是,下丘脑视交叉上核(SCN)的SR响应呈现非典型双相曲线(补充图12b),提示中枢生物钟可能存在特殊调控机制。

这项研究建立了生物钟研究的范式转变:将复杂PRC简化为SR参数,揭示剂量依赖性和组合效应的普适性数学法则。临床价值在于:1) 为联合用药方案设计提供理论指导;2) 发现高背景浓度会削弱生物钟可塑性,解释慢性压力导致节律紊乱的机制;3) 证实拮抗剂在药物过量时可"逆向"重置生物钟,为时差综合征等疾病提供新治疗思路。该模型还可拓展到其他生物振荡系统研究,为理解生命节律同步机制开辟新途径。

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