解析狼蛛毒素肽 Protoxin-I 抑制人 NaV1.8 的结构基础:为新型镇痛药研发点亮曙光

【字体: 时间:2025年02月08日 来源:Nature Communications

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  为解决 NaV1.8 作为镇痛药靶点,其选择性抑制剂作用机制不明的问题,研究人员开展人 NaV1.8 与 Protoxin-I 结合的结构研究。结果获得两者结构,揭示抑制机制。这为设计靶向 NaV1.8 的镇痛药提供关键依据。

  
在人体的微观世界里,离子通道如同精密的分子机器,掌控着细胞的电活动。其中,电压门控钠通道(Voltage-gated sodium channels,NaVs)尤为关键,它能选择性地让钠离子穿过细胞膜,在可兴奋细胞中负责传播动作电位。人类有九种 NaV亚型,它们虽然在序列上差异细微,但却各自承担着独特的生理功能。

NaV1.8 作为其中一员,是三种对河豚毒素有抗性的 NaV之一。它有着与众不同的 “个性”:激活和失活的电压依赖性相对去极化,失活动力学较慢,还有持续增强的电流。这些特性使它在动作电位上升阶段成为主要的内向电流 “推动者”,也在背根神经节(DRG)神经元的过度兴奋和重复放电中 “发挥作用”,并且它在低温环境下仍能坚守 “岗位”,维持自身的门控特性。

更重要的是,NaV1.8 与疼痛紧密相连。一些患者因 NaV1.8 功能获得性突变,导致 DRG 神经元兴奋性增加,进而引发周围神经病变疼痛;而功能丧失性突变的患者则痛感降低。此外,它还参与了炎症性疼痛的过程。就像沙漠蝗虫小鼠对亚利桑那树皮蝎毒液不敏感,就是因为其 NaV1.8 通道发生了突变。这些发现让 NaV1.8 成为镇痛药研发的热门靶点,而从动物毒液中提取的肽类物质作为 NaV活动的调节剂,备受关注。

狼蛛毒液中的 Protoxin-I(ProTx-I)就是这样一种肽,它是门控修饰肽,能改变 NaV1.8 的激活电压阈值,阻止通道开放。然而,此前它抑制 NaV1.8 的结构基础一直是个谜。为了解开这个谜团,美国加利福尼亚大学欧文分校(University of California Irvine)的研究人员 Bryan Neumann、Stephen McCarthy 和 Shane Gonen 开展了深入研究。他们的研究成果发表在《Nature Communications》上,为理解 ProTx-I 的作用机制以及开发靶向 NaV1.8 的镇痛药提供了重要线索。

研究人员采用了一系列先进的技术方法。他们利用哺乳动物 HEK293 细胞表达全长人 NaV1.8,通过优化表达和纯化条件,结合单层石墨烯网格技术,提高了样本质量和数据收集效率。随后,运用单颗粒冷冻电镜(cryoEM)技术,分别获得了 apo-hNaV1.8(无 ProTx-I 结合的人 NaV1.8)和 hNaV1.8-ProTx-I 复合物的高分辨率结构。

apo-hNaV1.8 的结构


研究人员在 HEK293 细胞中共表达人 NaV1.8 的 α 亚基和 β4 亚基,尽管 β4 亚基理论上有助于稳定蛋白、提高表达水平,但纯化后仅观察到 α 亚基。为提高 hNaV1.8 产量,研究人员筛选了多个参数,并优化了从溶解到纯化的时间。在制备冷冻电镜样本时,他们尝试了多种网格类型,最终发现单层石墨烯网格效果最佳,仅用少量细胞培养物就能获得高质量的重构结构。

通过冷冻电镜,研究人员获得了分辨率为 3.1 ? 的 apo-hNaV1.8 结构。该结构呈现出失活通道的特征,如电压敏感结构域(VSD)上的门控电荷残基呈 “向上” 构象,IFM 快速失活基序隐藏在其结合位点中。同时,他们还观察到多个 N - 连接糖基化位点以及可能的胆固醇、脂质和去污剂分子结合位点。但令人意外的是,VSD 的密度在二维和三维分类以及最终重构中几乎完全缺失。进一步分析发现,VSD 的 S4 - S5 连接子存在两种不同的重定位状态,这可能是导致 VSD 难以解析的原因,并且这种运动与通道的激活阈值变化有关。

ProTx-I 结合复合物的结构


制备 hNaV1.8 - ProTx-I 复合物时,研究人员先将 ProTx-I 溶液与纯化的 apo-hNaV1.8 孵育,再用高分子量截止滤器去除未结合的肽,最终获得了分辨率为 2.8 ? 的结构。在该结构中,除 ProTx-I 结合区域外,hNaV1.8 的结构与 apo-hNaV1.8 相似,但 VSD 和细胞外环有轻微的刚性位移和小的运动。

ProTx-I 的密度在结构中清晰可见,它结合在 VSDII的 S3 - S4 连接子上,部分嵌入洗涤剂胶束(模拟细胞膜脂质双层)中,通过一组芳香族和脂肪族残基形成的 “疏水补丁” 与膜相互作用。结合 ProTx-I 后,VSDII的 S3 - S4 连接子发生向内移动,导致其部分重新定位在 S4II螺旋顶部,阻碍了 S4II螺旋在激活过程中的移动,这就解释了 ProTx-I 作为门控修饰肽的作用机制。

研究人员还发现,ProTx-I 与 hNaV1.8 的结合存在一些有趣的现象。虽然之前的诱变实验表明 ProTx-I 也能结合 hNaV1.7 的 VSDIV,但在 hNaV1.8 - ProTx-I 结构中,并未观察到 ProTx-I 在 VSDIV上方的密度,这可能与 hNaV1.7 和 hNaV1.8 中 VSDIV的 S1 - S2 和 S3 - S4 连接子区域序列差异有关。

研究结论与讨论


这项研究成功解析了 apo-hNaV1.8 和 hNaV1.8 - ProTx-I 复合物的冷冻电镜结构,揭示了 ProTx-I 抑制 NaV1.8 的结构基础。ProTx-I 通过与 VSDII的 S3 - S4 连接子结合,改变其构象,阻碍 S4II螺旋的移动,从而抑制通道激活。

研究中使用的单层石墨烯网格技术为未来研究其他 hNaVs 和类似复杂蛋白质的结构提供了有效的方法。这些结果对于开发靶向 hNaV1.8 的镇痛药具有重要意义,有助于设计出更高效、更具选择性的药物,为疼痛患者带来新的希望。同时,研究还发现了 NaV1.8 中 VSD 的独特运动模式,为进一步理解电压门控钠通道的功能和调节机制提供了新的视角。

总的来说,这项研究在离子通道结构与功能、镇痛药研发等领域取得了重要突破,为后续研究奠定了坚实基础,有望推动相关领域的进一步发展。

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