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LncRNA PVT1连接雌激素受体α和多梳抑制复合体2在激素反应性乳腺癌中抑制促凋亡基因
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年02月10日 来源:Cell Death & Disease 8.1
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在乳腺癌研究领域,雌激素受体 α(ERα)是管腔样激素反应性乳腺癌亚型的关键标志。传统观点认为,雌激素刺激下,ERα 与众多转录共调节因子结合到染色质特定靶点,调节基因表达。近年来研究发现,ERα 还具备非经典 RNA 结合蛋白(RBP)功能,可与多种 RNA 相互作用,其中非编码 RNA(ncRNA)可能发挥重要作用,这为乳腺癌研究开辟了新方向。
意大利萨勒诺大学 “斯库奥拉?梅迪卡?萨勒尼塔纳” 医学、外科和牙科学院分子医学与基因组学实验室的研究人员 Viola Melone、Domenico Palumbo 等人,在《Cell Death and Disease》期刊发表了题为 “LncRNA PVT1 links estrogen receptor alpha and the polycomb repressive complex 2 in suppression of pro-apoptotic genes in hormone-responsive breast cancer” 的论文。该研究发现长链非编码 RNA(lncRNA)PVT1 在激素反应性乳腺癌中,作为雌激素受体 α(ERα)与多梳抑制复合物 2(PRC2)的桥梁,抑制促凋亡基因,为乳腺癌治疗提供了新的潜在靶点与治疗思路,有望改善患者预后。
在乳腺癌研究领域,雌激素受体 α(ERα)是管腔样激素反应性乳腺癌亚型的关键标志。传统观点认为,雌激素刺激下,ERα 与众多转录共调节因子结合到染色质特定靶点,调节基因表达。近年来研究发现,ERα 还具备非经典 RNA 结合蛋白(RBP)功能,可与多种 RNA 相互作用,其中非编码 RNA(ncRNA)可能发挥重要作用,这为乳腺癌研究开辟了新方向。
RNA 疗法近年来发展迅速,从理论走向临床,为多种疾病治疗提供了新途径。通过小分子直接作用于特定 RNA 或蛋白质,可调控异常基因表达。在乳腺癌治疗中,众多失调的 ncRNA 成为潜在 “可成药” 靶点,尤其是长链非编码 RNA(lncRNA)。lncRNA 参与多种细胞生理和病理过程,在表观遗传、转录及转录后调控中发挥功能,有望提升癌症治疗效果。
然而,乳腺癌治疗面临诸多挑战。长期以来,通过选择性雌激素受体调节剂(SERMs)、选择性雌激素受体下调剂(SERDs)或芳香化酶抑制剂(AIs)抑制雌激素信号,是 ERα 阳性乳腺癌激素治疗的一线方案,但约 30% 的患者会产生耐药性,这成为患者死亡的主要原因。因此,寻找新的治疗靶点迫在眉睫。
以抗 ERα 抗体或抗 IgG 同型对照与磁珠结合,从 MCF - 7 细胞提取细胞核蛋白,超声破碎后与结合抗体的磁珠孵育,洗涤后提取 RNA,用于分析与 ERα 结合的 RNA。
采用特定试剂盒构建转录组文库,根据不同实验需求,在不同测序平台上对 RIP - Seq、总 RNA - Seq 和新生 RNA - Seq 文库进行测序。
选用受精鸡卵,在特定发育阶段处理后接种经 ASO 转染的 MCF - 7 细胞,孵育后测量肿瘤重量和面积,评估肿瘤生长情况。
运用多种生物信息学工具对测序数据进行处理,包括数据质量检测、接头去除、序列比对、计数和差异表达分析等。同时,利用多个在线平台和工具进行数据可视化与生存分析等。
研究人员首先通过 RIP - Seq 技术筛选与 ERα 相互作用的 lncRNA,接着分析筛选出的 lncRNA 的表达特征、细胞定位及其与雌激素信号的关系。随后,运用基因沉默实验探究这些 lncRNA 对基因转录、细胞增殖及 ERα 转录活性的影响。针对关键 lncRNA PVT1,深入研究其对乳腺癌多个关键特征的作用机制,并在体外细胞模型和体内 CAM 模型中验证。最后,以肿瘤抑制基因 BTG2 为例,验证 PVT1、PRC2 和 ERα 在调控靶基因表达中的协同作用。
通过对 MCF - 7 细胞进行 RIP - Seq,研究人员鉴定出 2212 种与 ERα 相互作用的 RNA,其中 141 种为非编码 RNA,107 种为 lncRNA。结合前人研究,筛选出 FGD5 - AS1、EPB41L4A - AS1 和 PVT1 这 3 种与乳腺癌生长密切相关的 lncRNA 进行后续研究。RIP 联合 RT - qPCR 实验证实了这 3 种 lncRNA 与 ERα 的相互作用。
分析发现,FGD5 - AS1 在正常与癌组织及多种细胞系中表达无显著差异;EPB41L4A - AS1 在肿瘤组织和细胞中表达下调;PVT1 则呈现过表达。细胞定位显示,EPB41L4A - AS1 和 FGD5 - AS1 主要分布于细胞质,PVT1 主要在细胞核。雌激素刺激实验表明,EPB41L4A - AS1 表达下降,PVT1 表达上升。ERα 基因敲低实验显示,PVT1 和 FGD5 - AS1 水平下降,而 EPB41L4A - AS1 不受影响。CARIP 联合 RT - qPCR 证实这 3 种 lncRNA 均与染色质相关。
基因沉默实验发现,敲低 3 种 lncRNA 会导致大量基因差异表达,部分差异表达基因与 ERα 结合位点相关,且涉及乳腺癌进展和侵袭相关通路。同时,lncRNA 沉默抑制了 ERα 阳性乳腺癌细胞增殖,降低了 ERα 蛋白水平,影响了 ERα 转录激活效率,其中 PVT1 的作用最为显著。
研究表明,PVT1 与 ERα 在细胞质中也存在直接关联,且这种关联依赖于 ERα 的 RNA 结合结构域。生存分析显示,PVT1 高表达与乳腺癌患者预后不良相关。转录组分析发现,PVT1 沉默影响了众多与乳腺癌进展、缺氧反应和细胞死亡相关的基因。
进一步研究发现,PVT1 沉默降低了 HIF - 1α 和 Bcl - xL 蛋白水平,增加了 BAX mRNA 水平,抑制了细胞迁移。体内 CAM 实验也证实,PVT1 沉默抑制了肿瘤生长,调节了细胞凋亡和缺氧相关蛋白水平,降低了 ERα 蛋白表达。
研究人员以肿瘤抑制基因 BTG2 为研究对象,发现其受雌激素刺激后表达下调,且其基因区域存在丰富的 H3K27Me3 标记。PVT1 沉默、EZH2 或 ERα 抑制均会导致 BTG2 转录上调。在表达外源 Flag - ERα 的 MCF - 7 细胞克隆中,PVT1 沉默减少了 Flag - ERα 在 BTG2 基因上的募集,增加了 H3K4Me3 的富集。由此,研究人员提出了一个 E2 依赖的 BTG2 转录抑制模型,即 ERα 招募 PRC2,PVT1 作为桥梁因子促进两者协同抑制 BTG2 表达。
本研究表明,PVT1 在激素反应性乳腺癌中,作为 ERα 与 PRC2 之间的关键桥梁分子,参与抑制促凋亡基因表达,在雌激素信号传导和肿瘤发展进程中发挥着核心作用。通过对 PVT1 的深入研究,揭示了其在乳腺癌中的多重功能,为乳腺癌的发病机制提供了新的见解。
目前,乳腺癌治疗面临着耐药性等挑战,而 PVT1 的发现为解决这些问题提供了新的方向。由于 PVT1 在乳腺癌进展中的关键作用,且其与治疗耐药相关,抑制 PVT1 有望成为克服抗雌激素耐药细胞增殖的有效策略。反义寡核苷酸(ASO)技术的应用,使得 PVT1 沉默具有可行性,可单独或与标准疗法联合用于 ERα 阳性乳腺癌的治疗,为乳腺癌治疗开辟了新的途径。
此外,该研究也为后续深入探究 lncRNA 在乳腺癌中的作用机制奠定了基础,有助于发现更多潜在的治疗靶点和生物标志物,推动乳腺癌精准治疗的发展,对改善乳腺癌患者的预后具有重要的临床意义。
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