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这篇综述聚焦于碱性亮氨酸拉链转录因子(BATF),阐述其在免疫细胞分化和功能调节中的关键作用,以及在多种自身免疫性疾病(如炎症性肠病、多发性硬化症等)发展中的影响,为理解疾病发病机制和开发新疗法提供重要参考。
BATF 家族及其功能
BATF 的表达
BATF 最初从受 Epstein-Barr 病毒(EBV)刺激的人 B 细胞基因文库中分离出来。早期研究发现,EBV 感染后人 B 细胞中 BATF 表达显著增加,表明其参与病毒感染的早期反应。BATF 基因位于人 14 号染色体 14q24,由三个外显子组成,编码 304 个核苷酸(包括起始密码子和完整的 DNA 结合结构域 DBD)以及 530 个核苷酸(涵盖 bZIP 结构域的第一个亮氨酸及其他 C 末端残基)。与 AP-1 家族其他成员不同,BATF 缺乏额外的反式激活结构域,但它的 bZIP 结构域能与 Jun/Fos 等其他 AP-1 因子形成同源或异源二聚体,通过结合 TRE(12-O - 十四烷酰佛波醇 - 13 - 乙酸酯反应元件)或 CRE(cAMP 反应元件),竞争性抑制 Jun/Fos 二聚体的活性,从而调节靶基因的表达。此外,BATF2 具有类似 Fos 的额外 C 末端结构,但其功能尚不清楚。BATF、BATF2 和 BATF3 在免疫系统中具有独特的表达模式和功能,主要表达于各种免疫细胞及其前体,包括造血干细胞、淋巴细胞和髓细胞等。在造血干细胞中,G-CSF/STAT3 信号诱导 BATF 表达,限制细胞更新并促进淋巴样分化;在 CD4+T 细胞中,IL-6/STAT3 信号激活 BATF,促进 Th17 和 Tfh 细胞分化;BATF 还可通过 TLA1/STAT6 信号通路促进 Th9 细胞分化和 IL-9 产生。此外,BATF 在 Treg 细胞分化和功能、效应 CD8+T 细胞分化以及 B 细胞分化、抗体产生等过程中都发挥着重要作用。BATF3 则促进 CD8+T 细胞增殖和记忆细胞分化。BATF2 在 M1 巨噬细胞和 Th1 细胞中表达,可增强巨噬细胞中促炎因子的表达,有助于抵御肺炎克雷伯菌感染。
BATF 的结合与修饰
BATF 作为 bZIP 家族成员,能与 AP-1 及其成员(如 c-Jun 和 Fos)形成异源二聚体,共同调节多种免疫相关基因的表达。BATF-AP-1 复合物在免疫细胞功能调节中起核心作用,它与 IRF 家族的合作进一步扩展了其在免疫细胞分化和功能中的作用。IRF 家族是另一类重要的转录因子,主要调节免疫反应、抗病毒反应和炎症反应。IRF4 和 IRF8 可与 BATF 家族转录因子形成复合物,通过直接相互作用、与特定基因调控区域共结合或影响彼此的转录活性来发挥作用。BATF/Jun 异源二聚体可与 IRF4 或 IRF8 形成三聚体复合物,结合到称为 AICE 的共享序列上,在免疫反应激活、细胞命运决定、免疫耐受和抗肿瘤免疫等过程中发挥重要作用。除了与 AP-1 和 IRF 家族的相互作用外,BATF 的磷酸化修饰在调节其功能方面也起着重要作用。丝氨酸 - 43 磷酸化影响 BATF 与 DNA 的结合和基因调控,虽然 Ser43 磷酸化会阻止 DNA 结合,但 BATF 抑制 AP-1 介导的基因转录的功能不受影响,且磷酸化的 BATF (S43D) 异源二聚体对核定位或与 Jun 的二聚化没有显著影响。研究还发现,40% 的 bZIP 蛋白含有与丝氨酸 - 43 类似的潜在磷酸化位点,表明存在类似的调控机制。
BATF 家族的补偿机制
BATF 家族成员(包括 BATF、BATF2 和 BATF3)在调节免疫系统功能方面发挥着关键作用,尤其是在免疫细胞的分化、激活和免疫反应中。尽管这三种蛋白质在结构和功能上存在一定冗余,但它们在不同细胞类型中的作用有所不同。当某个成员出现缺陷或功能障碍时,家族成员之间的补偿机制可以部分或完全恢复免疫功能。在树突状细胞(DCs)中,BATF、BATF2 和 BATF3 的功能密切相关。BATF3 对 CD103+和 CD8α+树突状细胞的发育至关重要,BATF3 缺陷的小鼠树突状细胞功能显著受损,导致 T 细胞免疫反应减弱。然而,BATF 可以部分补偿 BATF3 的缺失,恢复树突状细胞的功能。BATF2 和 BATF3 在免疫细胞分化,特别是树突状细胞的免疫反应中存在功能重叠。在弓形虫感染或 IL-12 诱导的情况下,BATF2 缺陷的小鼠肺部 CD103+DC 数量减少,树突状细胞的免疫耐受减弱,而 BATF2 可以部分补偿 BATF3 缺陷导致的 CD103+DC 缺陷。此外,BATF3 可以在 BATF 缺失的情况下恢复某些功能,如 Th17 细胞产生 IL-17、Th2 细胞产生 CTLA-3 和 IL-10 等。在黏膜炎症中,BATF 敲除小鼠 Th9 细胞分化缺陷和 IL-9 产生不足可由 TL1A 补偿。在 B 细胞类别转换重组(CSR)过程中,BATF 和 BATF3 也具有重叠功能,BATF 缺失时,BATF3 的存在可部分恢复 B 细胞功能。
BATF 调节免疫细胞的分化和功能
先天免疫细胞
- 固有淋巴细胞(ILCs):ILCs 根据表达的转录因子分为 ILC1、ILC2 和 ILC3,分别与 Th1、Th2 和 Th17 细胞相对应。BATF 在 ILCs 的发育和分化中起关键调节作用。IL-7 信号通过 STAT3/6 途径诱导 ILC 祖细胞中 BATF 的表达,BATF 在骨髓 ILC 祖细胞和小肠成熟 ILC 亚群中表达尤为突出。BATF 支持 ILCs 的造血,促进从共同淋巴祖细胞(CLPs)向 ILC 祖细胞的转变,对大多数 ILC 群体(包括 ILC1、ILC2 和 ILC3)的正常发育至关重要,同时对周围 ILC 的增殖和效应细胞因子的产生也必不可少。
- ILC1 细胞主要产生干扰素 -γ(IFN-γ),BATF 缺陷的小鼠肝脏和小肠中 ILC1 和 NK 细胞的 IFN-γ 表达显著降低,表明 BATF 对调节 ILC1 细胞的活性和功能至关重要,影响机体对微生物入侵的免疫反应。
- ILC2 细胞在 IL-33、IL-25 和胸腺基质淋巴细胞生成素(TSLP)的激活下产生 IL-4、IL-5 和 IL-13 等细胞因子,参与过敏反应和抗寄生虫感染。BATF 缺陷会损害 ILC2 细胞分化,减弱免疫保护,加重疾病严重程度,同时导致 ILC2 细胞因子产生减少。在蠕虫感染模型中,BATF 缺陷会损害 iILC2 细胞的产生,而在 2 型呼吸道疾病中,BATF 在 CD45RA+ILC2 细胞向 CD45RO+ILC2 细胞的转变中起关键作用。
- ILC3 细胞在 IL-7、IL-23 和 IL-18 的诱导下产生 IL-22、IL-17A、GM-CSE 和 IFN-γ 等细胞因子,帮助对抗真菌和细胞外微生物。BATF 与 c-Maf 在 NCR(自然细胞毒性触发受体)阳性 ILC3 中协同调节 RORγT 表达,促进 ILC3 表型。在艰难梭菌感染的小鼠模型中,BATF 缺陷会减少小肠中 RORγT 阳性 ILC3 细胞的数量,降低 IL-22 的产生。
- 树突状细胞(DCs):DCs 是连接先天免疫和适应性免疫反应的造血细胞,其前体迁移到各种组织和淋巴器官,分化为不同亚型。研究发现,BATF 在激活的浆细胞样 DC(pDCs)中高表达,在激活过程中,BATF 重塑 pDCs 的染色质景观,重编程基因转录,并通过直接结合 Zfp366 基因区域,诱导转录调节因子 DC-SCRIPT 的表达,从而抑制 pDCs 中 IFN I 基因的转录。BATF3 是 CD8α+DCs 发育的关键因子,其缺失会导致 CD8α+DC 形成受损,影响感染期间的交叉呈递能力,使小鼠对病毒感染和肿瘤的 CD8+T 细胞反应减弱。在感染利什曼原虫的小鼠模型中,BATF3 缺陷会严重损害 CD8α+DC 和 CD103+DC 亚型的形成,导致皮肤病变加重、寄生虫负荷增加和疾病抵抗力下降。
淋巴细胞
- Th17 细胞:Th17 细胞的分化由 IL-6、IL-21 和 TGF-β 刺激引发,导致 RORγT 和 RORα 上调,进而产生 IL-17A、IL-17F 和 IL-22 等细胞因子,在多种炎症和自身免疫性疾病的发病机制中起关键作用。研究表明,在 Th17 极化条件下,BATF 通过直接结合 IL-21 等基因的启动子和基因间区域并招募 CTCF,介导 Th17 细胞分化。BATF 缺陷的小鼠 Th17 细胞分化显著受损,关键分化因子 RORγT 和 IL-21 无法检测到,即使在体外添加 IL-21 或过表达 RORγT,也无法恢复 IL-17 的表达。此外,BATF 缺陷的小鼠 Th17 细胞中 IL-23 受体(IL-23R)表达降低,影响其增殖和存活。
- 在 Th17 细胞分化过程中,BATF 主要与 JunB 形成异源二聚体,结合到 IL-17A 的启动子和基因间区域发挥作用。T 细胞受体(TCR)刺激可增强 BATF 与 IRF4 在顺式调控区域的结合,加强 BATF 与其他关键转录因子的相互作用。
- 从代谢角度来看,线粒体呼吸在 Th17 细胞发育过程中增加,线粒体氧化磷酸化促进 BATF 表达,抑制线粒体 ATP 合酶会损害 Th17 细胞发育和功能,但 BATF 过表达可抵消这种影响。
- Tfh 细胞:Tfh 细胞的分化主要由 IL-21 激活 STAT3 调节,Bcl-6 是主要的转录因子。在自身免疫性疾病中,Tfh 细胞促进 B 细胞增殖和自身抗体产生。BATF 在 Tfh 细胞中高表达,直接结合 Bcl-6 等 Tfh 相关基因的启动子区域,缺失 BATF 会损害 Tfh 细胞分化。BATF 与 IRF4 形成复合物,与 STAT3 和 STAT6 相互作用,结合到 IL-4 基因的非编码序列 2(CNS2)区域,促进 IL-4 产生。IL-6/STAT3 和 IL-4/STAT6 信号通路也参与调节 Tfh 细胞中 BATF 的表达,增强 IL-4 产生。
- 在过敏性哮喘模型中,BATF 缺陷的小鼠哮喘症状减轻,肺部嗜酸性粒细胞和淋巴细胞减少,IL-4、IL-5 和 IL-13 等细胞因子显著降低。在肝移植中,Tfh 细胞通过分泌 IL-21 促进 B 细胞激活和抗体产生,导致移植排斥,而他克莫司治疗可减少 BATF/Jun/IRF4 复合物的形成,降低 IL-21 产生,减少 Tfh 细胞比例,降低 Bcl-6 和 IL-6 表达,提高移植肝的存活率,减轻移植排斥。
- Th2 细胞:Th2 细胞分化由 IL-4/STAT6 和 IL-2/STAT5 信号通路驱动,产生 IL-5、IL-9、IL-13 和 IL-24 等细胞因子,在抗细胞外寄生虫免疫和过敏性疾病中起关键作用。BATF 在调节 Th2 细胞中 II 型细胞因子(尤其是 IL-4)的产生方面起关键作用。在蠕虫感染的小鼠模型中,BATF 缺陷会导致 Tfh 和 Th2 细胞产生受损,CD4+T 细胞中 IL-4 和 IL-13 等细胞因子产生减少。BATF 与 Th2 细胞中 II 型细胞因子基因座的 AP-1 位点调节区域密切相关,BACH2 与 BATF 形成的复合物与 IRF4BATF 复合物存在功能拮抗,影响 Th2 细胞分化和细胞因子产生。
- Th9 细胞:Th9 细胞在 TGF-β 和 IL-4 的联合刺激下从初始 T 细胞分化而来,主要功能是产生 IL-9。BATF 对 Th9 细胞的功能至关重要,在过敏性哮喘中发挥重要作用。BATF 与 IRF4 形成复合物激活 IL-9 基因的表达,BATF 缺失会显著降低 Th9 细胞相关基因的表达,增加 BATF 表达可部分恢复 IL-9 水平。IRF8 与 BATF 协同进一步增强 IL-9 转录。TL1A 可诱导 Th9 细胞分化,增加 BATF 和 BATF3 的表达,促进 IL-9 产生。1,25 - 二羟基维生素 D3 通过抑制 AhR 减少 BATF 表达,降低 Th9 细胞中 IL-9 的产生。Toll 样受体 2(TLR2)通过上调 BATF 转录促进 Th9 细胞分化。
- Treg 细胞:调节性 T(Treg)细胞主要维持自身免疫耐受,参与自身免疫性疾病、肿瘤等疾病的发病机制。BATF 在效应 Treg(eTreg)细胞的分化和维持中起关键作用,BATF 缺陷会影响其生成和增殖。在黑色素瘤患者中,T 细胞在 FOXP3 和 BATF 等转录因子的影响下表达大量 Treg 免疫抑制和稳定性维持分子,促进 Treg 细胞极化。BATF 是 Treg 细胞迁移到非淋巴组织所必需的,它与 IRF4 直接或间接调节 Treg 细胞的分化、免疫抑制功能以及组织驻留 Treg 细胞的分化和发育。在肺癌肿瘤微环境(TME)中,BATF 是 Treg 细胞的关键分化相关转录因子,高表达 BATF 与癌症预后不良相关。而 BATF3 被认为是 Treg 细胞分化的转录抑制剂,BATF3 和 IRF4 结合到 FOXP3 基因座抑制 FOXP3 表达和 FOXP3+Tregs(iTregs)的产生。
- 影响 CD8+T 细胞分化:BATF 在 CD8+T 细胞的功能中起关键作用,对效应 CD8+T 细胞的早期分化至关重要。在感染淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(LCMV)后,效应 CD8+T 细胞中 BATF 表达显著增加,并在记忆 CD8+T 细胞中持续存在。缺乏 BATF 的初始 CD8+T 细胞无法正常分化为效应 CD8+T 细胞。
- BATF 在效应 CD8+T 细胞中通过与 c-Jun、JunB 和 JunD 等分子形成异源二聚体发挥作用,这些异源二聚体主要与 IRF4 结合,集中在 AICE 序列区域。BATF 可以结合并促进多种与效应分化相关的转录因子(如 T-bet、Blimp-1 和 Runx3)以及细胞因子受体和信号分子(如 IL-2R 和 STATs)的表达,同时抑制这些转录因子和细胞因子信号通路的下游分子(如 IFN-γ 和颗粒酶 B),这种现象被称为 “相干前馈回路”,有助于稳定效应细胞的分化。
- 在慢性感染中,CD4+T 细胞分泌的 IL-21 对维持 CD8+T 细胞的抗病毒活性至关重要,IL-21 促进 BATF 在 CD8+T 细胞中的持续表达,与 IRF4 结合维持 Blimp-1 的表达,使 CD8+T 细胞继续发挥功能。
- 在慢性感染中,CD8+T 细胞分为 Ly108+Tcf-1+祖细胞、Ly108?CX3CR1?终末耗竭细胞和 CX3CR1+细胞毒性效应细胞三个亚群。BATF 在移植排斥和癌症治疗中也发挥着重要作用,缺乏 BATF 的 CD8+T 细胞无法有效浸润移植物,不产生攻击移植物所需的细胞因子和效应分子,而表达 BATF 和 IRF4 的 CAR T 细胞具有增强的抗肿瘤功能和增殖能力。然而,BATF 和 IRF4 在耗竭的 CD8+T 细胞中表达也会升高,BATF 通过与 AP-1 家族成员合作调节免疫检查点基因(如 PD-1 和 LAG-3)的表达,IRF4 进一步促进 CD8+T 细胞的耗竭状态。
- 调节 B 细胞功能:B 细胞在自身免疫性疾病(如 SLE 和 pSS)中起关键作用,其功能受 Tfh 细胞分泌的细胞因子调节。BATF 在 B 细胞中至关重要,BATF 缺陷的小鼠在抗原刺激后无法形成生发中心,抗体类别转换受阻。虽然 B 细胞增殖正常,但 μ 种系转录本(GLT)水平与正常小鼠相似,IgM 水平略有降低,其他类型的 GLT 显著减少,其他免疫球蛋白类型几乎检测不到