编辑推荐:
为解决多重耐药(MDR)细菌病原体快速出现及新型抗生素研发停滞的问题,研究人员开展了以 G - 四链体(G4)结合配体为新型抗生素的研究。结果发现 N - 甲基中卟啉 IX(NMM)抗菌活性最强,能靶向 mraZ 启动子的 G4 基序。这为新型抗生素开发提供了新方向。
在当今医疗领域,细菌耐药性问题愈发严峻,如同一场没有硝烟的战争,严重威胁着全球人类的健康。多重耐药(MDR)细菌病原体迅速崛起,而新型抗生素的研发却陷入僵局,难以跟上耐药菌出现的步伐。这使得临床治疗面临巨大挑战,许多由耐药菌引起的感染难以得到有效控制。例如,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)中的 USA300 菌株(SAUSA300),它能引发从皮肤感染到肺炎、脑膜炎等多种严重疾病 ,并且对大多数现有抗生素产生了耐药性。在这种困境下,寻找新型抗生素靶点迫在眉睫。
来自韩国成均馆大学医学院等机构的研究人员积极投入到这场 “战斗” 中,开展了一项具有重要意义的研究。他们将目光聚焦于 G - 四链体(G4),一种在 DNA/RNA 中由富含鸟嘌呤的重复序列形成的特殊二级结构。研究人员大胆假设,G4 结合配体或许可以作为新型抗生素,通过与基因组中的 G4 结合,调节相关基因的表达,从而抑制细菌的生长和存活。
该研究成果发表在《Journal of Biomedical Science》上,为解决细菌耐药性问题带来了新的曙光。研究人员发现,在众多被测试的 G4 结合配体中,N - 甲基中卟啉 IX(NMM)展现出了最为强大的抗菌活性。它对 SAUSA300 的最低抑菌浓度(MIC)仅为 5 μM,在抑制细菌生长方面表现卓越。
在研究过程中,研究人员运用了多种关键技术方法。他们通过微生物药敏试验,测定不同 G4 结合配体对 SAUSA300 的最低抑菌浓度(MIC),以此筛选出抗菌活性强的配体。利用定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)分析相关基因的表达变化;采用圆二色谱(CD)、核磁共振(NMR)等生物物理技术,研究 G4 结构及其与 NMM 的相互作用;构建报告菌株和进行体外转录 / 翻译(IVT)实验,探究基因调控机制;使用细胞活力检测和动物感染模型,评估 NMM 的抗菌效果和安全性。
下面来看具体的研究结果:
- G4 结合配体的抗菌活性筛选:研究人员对 10 种代表性 G4 结合配体进行初步筛选,发现 NMM 对 SAUSA300 的生长抑制效果最为显著,其 MIC 为 5 μM。进一步验证实验,包括测定光密度(OD)、菌落形成单位(CFU)/mL、50% 抑制浓度(IC50)以及药物内化实验等,均表明 NMM 在测试的 G4 配体中抗菌活性最强,且生物利用度高。
- NMM 对 SAUSA300 细胞的作用机制:通过共聚焦显微镜和扫描电子显微镜观察发现,NMM 能够内化进入 SAUSA300 细胞,破坏细胞形态,影响细胞分裂和细胞壁完整性。研究人员推测这可能与 NMM 和细菌基因组中 G4 基序的相互作用有关,进而影响相关基因的表达。
- SAUSA300 中 dcw 基因簇的 G4 基序分析:研究发现 SAUSA300 的 dcw 基因簇中,mraZ 基因的启动子区域存在 G4 基序。对该区域基因表达的定量分析显示,NMM 处理后,mraZ、mraW、ftsL 和 ftsA 等基因的表达下调,表明 NMM 可能通过与 mraZ 启动子的 G4 基序相互作用,影响下游基因表达,抑制细菌细胞分裂和细胞壁生物合成。
- PmraZ_G4_3 基序与 NMM 的相互作用:通过多种生物物理实验,如 CD 光谱、热差光谱(TDS)、1D 1H NMR 光谱、稳态荧光滴定和荧光嵌入剂置换(FID)等,证实了 PmraZ_G4_3 基序能形成稳定的 G4 结构,并与 NMM 特异性结合。分子动力学(MD)模拟也显示 NMM 与 PmraZ_G4_3 的结合模式和能量,解释了 NMM 具有高结合亲和力和抗菌活性的原因。
- G4 基序在 PmraZ启动子中的作用验证:构建含有不同 PmraZ启动子的报告菌株,结果表明野生型 PmraZ启动子(含 PmraZ_G4_3 基序)能抑制报告基因 mCherry 的表达,NMM 处理后抑制作用增强;而突变型启动子(PmraZ_ΔG4_3d)的抑制作用减弱。这说明 G4 基序在 PmraZ启动子的基因调控中起重要作用,NMM 通过稳定 G4 基序抑制基因表达。
- NMM 对转录 / 翻译的影响:构建不同的质粒,在体内和体外实验中,均发现 NMM 能抑制含野生型 PmraZ_G4_3 基序模板的转录和翻译,且呈剂量依赖性,进一步证明 NMM 通过稳定 G4 结构抑制基因表达。
- NMM 的体内外抗菌活性验证:细胞实验和动物实验表明,NMM 对 RAW264.7 细胞的细胞毒性低,能有效抑制 SAUSA300 对 RAW264.7 细胞的感染,清除感染细胞内的细菌。在蜡虫感染模型中,NMM 的抗菌效果优于万古霉素,能显著提高感染 SAUSA300 或大肠杆菌 CFT073 的蜡虫存活率。此外,NMM 与多粘菌素 B 九肽(PMBN)联合使用,可有效杀死革兰氏阴性的大肠杆菌 CFT073。
研究结论和讨论部分指出,NMM 作为一种高效的抗生素,在实验室条件下表现出比万古霉素更强的抗菌活性,其作用机制主要是靶向 dcw 基因簇中 mraZ 启动子的 G4 基序,影响细胞分裂和细胞壁生物合成相关基因的表达。同时,NMM 对革兰氏阴性菌的外膜具有不透性,与 PMBN 联合使用可克服这一问题。此外,NMM 可能通过调节其他靶点发挥抗菌作用,且耐药性发展较慢。这项研究不仅为新型抗生素的开发提供了新的靶点和方向,也加深了人们对 G4 介导的细胞调控机制的理解,对未来对抗耐药菌感染具有重要的理论和实践意义,有望为临床治疗耐药菌感染带来新的突破。