sdRNA-D43:调控骨关节炎进程的新 “钥匙”

【字体: 时间:2025年02月12日 来源:Cell Communication and Signaling 8.2

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  为探究 sdRNAs 在骨关节炎(OA)中的作用,中山大学附属第一医院研究人员研究 sdRNA-D43,发现其通过抑制 PINK1/Parkin 通路促进 OA,为 OA 治疗提供新方向。

  骨关节炎(Osteoarthritis,OA),作为关节炎中最为常见的类型,就像关节健康的 “隐形杀手”,悄无声息地影响着无数人的生活。随着全球老龄化进程的加速,OA 患者的数量与日俱增,预计到 2030 年,它将成为导致世界高致残率的重要疾病之一。想象一下,那些深受 OA 困扰的患者,日常活动中的简单动作,如行走、上下楼梯,都可能伴随着钻心的疼痛,严重影响了他们的生活质量。
目前,虽然我们知道细胞衰老与 OA 的发展紧密相关,尤其是软骨细胞衰老,它被认为是 OA 进展的 “助推器”。但遗憾的是,调控软骨细胞衰老的分子机制却如同迷雾,让科研人员难以看清。此外,线粒体功能障碍在 OA 中扮演着重要角色,它会促使软骨细胞衰老,而线粒体自噬(mitophagy)作为清除受损线粒体、维持细胞健康的关键过程,如何有效改善软骨细胞线粒体自噬来抑制 OA 进展,也亟待解决。同时,非编码 RNA 在 OA 研究中逐渐崭露头角,可小核仁 RNA 衍生片段(snoRNA-derived fragments,sdRNAs)在 OA 中的作用却依旧是个未解之谜。

为了揭开这些谜团,中山大学附属第一医院的研究人员勇敢地踏上了探索之旅。他们围绕 sdRNA-D43 在 OA 中的作用及机制展开深入研究,试图找到治疗 OA 的新突破口。该研究成果为 OA 的治疗提供了潜在的新靶点和方向,有望为众多 OA 患者带来新的希望,相关研究发表在《Cell Death and Disease》期刊上。

在这场科研探索中,研究人员运用了多种关键技术方法。他们收集了 36 例膝关节 OA 患者的关节组织样本,将其分为未受损和受损区域,这一样本队列成为研究的重要基础。通过 sdRNA 阵列分析筛选差异表达的 sdRNAs;采用定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)、蛋白质免疫印迹(Western blot)等技术检测基因和蛋白表达水平;利用转染技术改变细胞中 sdRNA-D43、NRF1 和 WIPI2 的表达;借助免疫荧光、RNA 荧光原位杂交(FISH)等实验进行细胞内定位和相关蛋白检测;构建单碘乙酸钠(MIA)诱导的大鼠 OA 模型,在体内验证研究结果。

研究结果如下:

  1. sdRNA-D43 在 OA 软骨受损区域高表达且与衰老相关:研究人员通过对膝关节 OA 患者软骨样本的分析发现,与未受损区域相比,受损区域的软骨出现了明显的裂缝和损伤。利用 sdRNA 阵列分析,他们筛选出多个差异表达的 sdRNAs,其中 sdRNA-D43 在受损区域表达显著上调。进一步研究发现,sdRNA-D43 的表达与衰老标记物 CDKN2A 和 CDKN1A 的表达呈正相关,且其主要在软骨细胞的细胞质中表达。这表明 sdRNA-D43 可能在软骨细胞衰老和 OA 进展中发挥重要作用。
  2. 生物信息学分析预测 sdRNA-D43 潜在靶基因:通过生物信息学工具预测,研究人员发现 sdRNA-D43 的潜在靶基因与线粒体自噬相关,且功能富集和通路分析显示其可能参与调控线粒体自噬。这一发现为后续研究指明了方向,暗示 sdRNA-D43 可能通过影响线粒体自噬来调控 OA 进程。
  3. sdRNA-D43 调控线粒体自噬和软骨细胞衰老:研究人员通过转染 sdRNA-D43 抑制剂和模拟物,发现 sdRNA-D43 可抑制软骨细胞的线粒体自噬。转染抑制剂后,线粒体向溶酶体的运输增加,线粒体膜电位升高,活性氧(ROS)水平降低,ATP 生成增加;而转染模拟物则出现相反的结果。同时,sdRNA-D43 可促进软骨细胞衰老,转染抑制剂可减少衰老细胞的比例,转染模拟物则增加衰老细胞的比例。这一系列实验结果表明,sdRNA-D43 在软骨细胞中具有抑制线粒体自噬、促进衰老的作用。
  4. 确定 sdRNA-D43 的线粒体自噬相关靶基因:利用生物信息学工具预测并通过实验验证,研究人员确定 NRF1 和 WIPI2 是 sdRNA-D43 的靶基因。转染 sdRNA-D43 抑制剂可上调 NRF1 和 WIPI2 的表达,转染模拟物则下调其表达。双荧光素酶报告基因实验证实,sdRNA-D43 可直接结合 NRF1 和 WIPI2 的 3′-UTR,抑制其表达。因此,NRF1 和 WIPI2 被选定为 sdRNA-D43 的下游靶基因进行后续研究。
  5. NRF1 和 WIPI2 与软骨细胞衰老和 OA 进展密切相关:研究发现,NRF1 和 WIPI2 在 OA 患者软骨受损区域的表达显著降低,且与 sdRNA-D43 的表达呈负相关。随着软骨细胞衰老和 OA 严重程度的增加,NRF1 和 WIPI2 的表达逐渐减少。这进一步表明,NRF1 和 WIPI2 在软骨细胞衰老和 OA 进展中可能发挥着重要的抑制作用。
  6. NRF1 和 WIPI2 促进线粒体自噬并抑制软骨细胞衰老和 OA 进展:通过转染 NRF1 和 WIPI2 的小干扰 RNA(siRNA)或过表达载体,研究人员发现 NRF1 和 WIPI2 可增强 PINK1/Parkin 介导的线粒体自噬,抑制软骨细胞衰老。敲低 NRF1 或 WIPI2 会导致线粒体自噬减少,细胞衰老相关蛋白表达增加;而过表达 NRF1 或 WIPI2 则促进线粒体自噬,减少细胞衰老相关蛋白的表达。这充分证明了 NRF1 和 WIPI2 在改善线粒体自噬、抑制软骨细胞衰老和 OA 进展方面的重要作用。
  7. sdRNA-D43 通过 NRF1、WIPI2 及 PINK1/Parkin 通路调控软骨细胞衰老:研究证实,sdRNA-D43 通过下调 NRF1 和 WIPI2 的表达,抑制 PINK1/Parkin 介导的线粒体自噬,从而促进软骨细胞衰老。RNA 免疫沉淀(RIP)实验表明,sdRNA-D43 可与 Ago2 结合,以 Ago2 依赖的方式发挥作用。敲低 NRF1 或 WIPI2 可部分逆转 sdRNA-D43 抑制剂对线粒体自噬和细胞衰老的影响。这揭示了 sdRNA-D43 调控软骨细胞衰老的具体分子机制。
  8. 敲低 sdRNA-D43 可缓解 OA 进展:研究人员构建了 MIA 诱导的大鼠 OA 模型,并向关节腔内注射 sh-rat-sdRNA-D43 腺相关病毒(AAV)。结果发现,敲低 sdRNA-D43 可减轻大鼠 OA 的进展,改善软骨损伤,抑制软骨细胞衰老,促进线粒体自噬。这一结果在体内实验中进一步验证了 sdRNA-D43 在 OA 中的重要作用,为 OA 的治疗提供了潜在的靶点。

综上所述,研究人员发现 sdRNA-D43 通过双靶向 NRF1 和 WIPI2,以 Ago2 依赖的方式负向调控 PINK1/Parkin 介导的线粒体自噬通路,从而调节软骨细胞衰老和 OA 进展。这一研究首次全面揭示了 sdRNA-D43 在 OA 中的作用机制,为 OA 的诊断、预后评估提供了潜在的生物标志物,也为 OA 的治疗提供了新的靶点,有望拓宽人类衰老相关 OA 的治疗选择,为攻克这一顽疾带来新的曙光。不过,该研究也存在一定的局限性,如未探究 sdRNA-D43 对其他信号通路的调节作用,后续还需进一步深入研究。
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