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本研究聚焦于缺血性卒中(IS)中铁死亡相关生物标志物的鉴定及其对免疫浸润的影响,揭示了Nfe2l2/HO-1通路在抑制铁死亡和炎症中的关键作用,为IS治疗提供了新靶点
缺血性卒中(IS)是全球致死和致残的主要原因之一,目前治疗选择有限。铁死亡是一种铁依赖性、非凋亡的细胞死亡方式,与多种神经系统疾病相关,但在IS中的作用尚不明确。哈尔滨医科大学第四附属医院的研究人员通过生物信息学分析、动物模型验证和多种实验技术,鉴定出5个铁死亡相关差异表达基因(DEFRGs),并发现Nfe2l2/HO-1通路在抑制铁死亡和炎症中发挥重要作用,为IS的早期诊断和治疗提供了新思路。该研究发表在《BMC Medical Genomics》上。
研究背景:
缺血性卒中(IS)是全球致死和致残的主要原因之一,其病理机制复杂,涉及兴奋性氨基酸毒性、炎症反应、自由基损伤、神经元死亡和线粒体能量代谢紊乱等。目前,溶栓和血管内取栓是急性缺血性卒中(AIS)的主要再灌注策略,但由于时间窗限制,仅对少数患者有效。铁死亡是一种新发现的细胞死亡方式,其特征是铁依赖性脂质活性氧(ROS)的积累,与阿尔茨海默病、帕金森病、脑出血和创伤性脑损伤等多种神经系统疾病相关,但在IS中的作用尚不清楚。此外,目前缺乏用于早期识别IS的铁死亡相关生物标志物。
研究方法:
研究人员从基因表达数据库(GEO)中获取IS转录组数据集,筛选出差异表达基因(DEGs)并与铁死亡相关基因进行交集分析,获得IS相关的铁死亡相关差异表达基因(DEFRGs)。通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,筛选出5个关键DEFRGs,包括Rela、Jun、Myc、Stat3和Nfe2l2。利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析,全面绘制细胞群体图谱,并结合基因集富集分析(GSEA)、miRNA预测等方法,深入分析这些基因的功能和通路。此外,研究人员构建了短暂性大脑中动脉闭塞(tMCAO)小鼠模型,采用多种实验技术,如Western blot、线粒体变化分析、苏木精-伊红(H&E)染色、尼氏(Nissl)染色、ROS荧光染色、免疫组化分析和实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)等,验证了铁死亡在IS进展中的作用。
研究结果:
铁死亡相关基因鉴定:研究人员从619个铁死亡相关基因中筛选出66个与IS相关的DEFRGs,并通过PPI网络分析和功能富集分析,确定了5个关键DEFRGs,其中Nfe2l2(核因子E2相关因子2类似物)被认为是最有潜力的IS诊断生物标志物。
Nfe2l2/HO-1通路的调控作用:通过GSEA分析发现,Nfe2l2与铁死亡、TNF-α、IL-17和MAPK信号通路密切相关。实验结果表明,激活Nfe2l2可以抑制铁死亡标志物COX2和TFR1的表达,同时上调铁蛋白重链(FTH1)的表达,减少ROS的产生,并减轻脑组织的氧化损伤。
免疫浸润分析:研究人员发现,在IS组中,树突状细胞(DCs)、M2型巨噬细胞和单核细胞的比例显著增加,且与铁死亡相关基因密切相关,提示免疫细胞浸润在IS中的重要作用。
动物模型验证:在tMCAO小鼠模型中,激活Nfe2l2可以显著减轻脑组织损伤,改善神经功能缺损,并减少炎症因子TNF-α和IL-17的表达。此外,Nfe2l2激活还可以通过上调HO-1的表达来抑制铁死亡,保护脑组织免受缺血再灌注损伤。
研究结论:
本研究通过生物信息学分析和动物模型验证,揭示了铁死亡在缺血性卒中中的重要作用,并发现Nfe2l2/HO-1通路是抑制铁死亡和炎症的关键机制。Nfe2l2作为潜在的生物标志物和治疗靶点,为IS的早期诊断和治疗提供了新的方向。未来的研究可以进一步探索Nfe2l2/HO-1通路在其他神经系统疾病中的作用,并开发针对该通路的药物,以改善IS患者的预后。