揭示 Mettl3/Eed/Ythdc1 调控轴:解锁子宫内膜容受性与功能的关键密码

【字体: 时间:2025年02月13日 来源:Communications Biology 5.2

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  为探究 N6- 甲基腺苷(m6A)RNA 甲基化与组蛋白修饰在子宫内膜容受性中的调控机制,研究人员开展相关研究。结果发现 Mettl3/Eed/Ythdc1 调控轴影响子宫内膜功能,该研究为不孕症相关表观遗传学提供新见解。

  在生育的神秘领域中,子宫内膜容受性就像一把神奇的钥匙,它决定着胚胎能否顺利在子宫内 “扎根”、生长,进而影响着新生命的诞生。然而,目前关于 N6- 甲基腺苷(m6A)RNA 甲基化与组蛋白修饰在子宫内膜容受性中的调控机制,科学家们还知之甚少。复发性植入失败(RIF)如同生育路上的 “拦路虎”,让许多渴望成为父母的人望而却步,其背后的分子机制亟待揭示。为了攻克这些难题,南京医科大学附属苏州医院等机构的研究人员踏上了探索之旅,相关研究成果发表在《Communications Biology》上。
研究人员为了深入了解这一复杂的调控网络,采用了多种关键技术方法。他们收集了体外受精 / 卵胞浆内单精子注射(IVF/ICSI)患者的子宫内膜样本,分为 RIF 患者和生育控制患者。同时构建了 Mettl3 条件性敲除小鼠模型,并运用 m6A-RIP 测序、CUT&Tag 测序、ATAC 测序等技术,从多个层面解析分子机制。

低 m6A 水平导致 RIF


研究人员通过免疫荧光、dot blot、m6A - RIP - seq 等实验发现,RIF 患者子宫内膜组织中,子宫内膜功能基因(如 LIF、HOXA10 等)的阳性细胞减少,m6A 水平受到抑制。同时,m6A 修饰的基因和峰值数量下降,转录水平却有所上升。进一步分析发现,这些 m6A 修饰差异基因与重要生物学功能及组蛋白调控相关,这表明 m6A 水平的降低与子宫内膜功能基因表达变化存在关联,暗示着一种潜在的表观遗传调控机制。

METTL3 敲低影响子宫内膜功能


为验证 METTL3 对子宫内膜功能的影响,研究人员构建了 METTL3 敲低(METTL3KD)的 Ishikawa 细胞系。实验结果显示,METTL3KD导致 METTL3 和 METTL14 蛋白水平下降,m6A 水平降低,BeWo 细胞球与 METTL3KD细胞的黏附率也随之降低。此外,细胞凋亡水平增加,增殖水平下降。m6A - RIP - seq 分析表明,METTL3KD减少了 m6A 修饰基因和峰值数量,同时影响了组蛋白修饰,抑制了 H3K27me3,升高了 H3K27ac 水平,这说明 METTL3 敲低通过改变 m6A 修饰和组蛋白标记,破坏了子宫内膜功能。

Mettl3 条件性敲除小鼠模型影响子宫内膜功能


研究人员通过将 PgrCre 转基因小鼠与 Mettl3f/f小鼠杂交,建立了 Mettl3 条件性敲除(Mettl3d/d)小鼠模型。对该模型的研究发现,Mettl3d/d小鼠子宫内膜组织变小、变薄,子宫重量减轻,产仔数显著减少。子宫内膜功能检测显示,Lif、Hoxa10 等功能基因的阳性细胞百分比降低,促凋亡基因阳性细胞增多,抗凋亡基因阳性细胞减少,且加速了子宫内膜衰老,这充分证明了 Mettl3 在维持子宫内膜结构和功能、促进生育方面起着关键作用。

m6A RIP - seq 分析及对组蛋白修饰的影响


对 Mettl3 缺陷的子宫内膜组织进行 m6A RIP - seq 分析发现,存在 835 个上调和 13 个下调的 m6A 修饰基因。这些差异基因富集在上皮形态发生、细胞增殖和组蛋白修饰信号通路等。同时,Mettl3d/d后,差异基因的 m6A 和 mRNA 水平均显著降低。免疫荧光实验表明,RIF 和 Mettl3d/d子宫内膜组织中 H3K27me3 阳性细胞减少,H3K27ac 阳性细胞增加,这表明 Mettl3 缺失改变了关键基因的 m6A 和 mRNA 水平,通过影响组蛋白修饰来调节子宫内膜容受性。

Mettl3d/d影响转录水平和染色质可及性


通过对 Mettl3d/d子宫内膜组织进行 CUT&Tag - seq 和 ATAC - seq 分析,研究人员发现 H3K27me3 富集的差异位点分为增加和减少两组,Mettl3 缺失后转录水平加快。相关分析表明,上调的通路与上皮细胞增殖等相关,下调的通路包括自噬等。ATAC - seq 分析显示,染色质关闭位点降低了 Esr1 的 mRNA 水平,开放位点则提高了 Lifr 的转录水平,这说明 Mettl3 缺失破坏了 H3K27me3 修饰和染色质可及性,导致基因表达改变,进而损害子宫内膜功能。

Mettl3/Eed/Ythdc1 调控轴影响子宫内膜功能


免疫荧光实验发现,RIF 样本和 Mettl3d/d子宫内膜组织中 EED、SUZ12 和 EZH2 阳性细胞数量减少。Co - IP 实验证实 Mettl3 与 Eed 直接相互作用,Eed 还与 Ezh2、Suz12、Mettl3 和 Ythdc1 相互作用,Ythdc1 也与 Eed 直接相互作用。过表达 EED 可挽救 METTL3KD细胞中的 m6A 水平,恢复子宫内膜功能基因的蛋白水平,升高 H3K27me3 水平,这表明 Mettl3/Eed/Ythdc1 轴通过协调调节 m6A 修饰和 H3K27me3 组蛋白修饰,调控子宫内膜功能。

METTL3 介导的 m6A 影响 EED 和 H3K27me3 修饰


研究发现 METTL3 缺失通过 m6A 修饰降低 EED 和 H3K27me3 水平,而过表达 YTHDC1 可挽救这些影响。实验表明,YTHDC1OE显著提高了 METTL3KD细胞中 EED 的蛋白水平,恢复了子宫内膜功能基因的表达,升高了 H3K27me3 水平,增加了 m6A 修饰水平。此外,突变 METTL3 功能域会抑制 m6A 水平,逆转 METTL3 过表达对 EED 和 H3K27me3 的影响,这进一步证明了 m6A 在调节子宫内膜功能中的重要作用。

抑制 EED 影响 H3K27me3 和子宫内膜容受性


用 EED 抑制剂(MAK683)处理子宫内膜上皮细胞发现,40 nM 的 MAK683 显著降低 EED、SUZ12 和 EZH2 的蛋白水平,改变子宫内膜容受性基因的表达,降低 H3K27me3 水平,增加 H3K27ac 修饰。体内实验也表明,MAK683 处理减少了子宫内膜上皮厚度,改变了相关蛋白阳性细胞数量,这说明 METTL3 与 Eed 的相互作用构成了一个新的调控轴,影响子宫内膜容受性。

在讨论部分,研究人员指出,他们首次发现 METTL3 招募 EED 并与 YTHDC1 相互作用,识别 EED 的 m6A 修饰,抑制 EED 转录,最终影响子宫内膜容受性导致生育力下降。METTL3 对抑制性和激活性组蛋白都有调节作用,未来还需进一步研究 H3K27ac 在子宫内膜功能中的上下游机制。YTHDC1 在子宫内膜中的作用机制还需深入探究,建立 YTHDC1 敲除模型将有助于揭示相关表观遗传机制。此外,转座元件(TEs)在子宫内膜功能中具有重要作用,组蛋白修饰和 m6A 甲基化在 TEs 上的双重修饰对子宫内膜功能的影响也有待进一步探索。

总的来说,这项研究揭示了 Mettl3/Eed/Ythdc1 调控轴在调节子宫内膜容受性中的关键作用,为改善子宫内膜容受性、治疗 RIF 提供了新的潜在治疗策略。它不仅为不孕症相关表观遗传学研究开辟了新方向,还为未来探索 RNA 修饰和组蛋白修饰在生殖健康中的复杂相互作用奠定了基础,有望推动个性化治疗不孕症及相关疾病的发展。

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