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癌症细胞侵袭和转移潜能的识别颇具挑战。研究人员开发计算流程(computational pipeline)剖析癌细胞细胞骨架架构。结果显示该框架能区分侵袭性相关微管特征。此研究为细胞行为自动分析提供依据,助力癌症研究。
癌症,这个如同恶魔般的存在,一直是全球健康的重大威胁,也是导致死亡的主要原因之一。它之所以如此可怕,很大程度上是因为癌细胞具有转移能力,而且在早期很难检测出具有侵袭性的癌细胞。在癌症发展过程中,细胞会发生许多形态变化,其中细胞骨架(cytoskeleton)起着关键作用。细胞骨架是一个复杂且动态的三维网络,由微管(microtubules)、微丝和中间丝相互连接构成,它不仅能调节细胞的结构,还在细胞迁移、侵袭和转移等过程中发挥着重要作用 。然而,目前人们对于细胞骨架在癌症进程中的具体作用机制还知之甚少,也缺乏有效的方法来识别细胞骨架的细微变化,这就导致了癌症的诊断往往比较滞后,患者的治疗效果也不理想。
为了攻克这些难题,来自葡萄牙的研究人员展开了深入研究。他们的研究成果发表在《Scientific Reports》上。这项研究旨在开发一种新型计算流程,来描绘癌细胞的细胞骨架架构,并探究其精细调整的变化。
在研究方法上,研究人员主要运用了以下关键技术:首先是免疫荧光(immunofluorescence)和图像采集技术,他们用特定的抗体对细胞进行染色,然后通过显微镜获取细胞的图像;接着利用图像预处理和分析技术,包括去卷积、高斯滤波、骨架化等操作,对获取的图像进行处理和特征提取;最后运用统计学分析方法,来确定不同细胞之间的差异是否具有统计学意义。
研究结果方面:
- 新的图像分析流程可解析细胞骨架组织特征:研究人员开发的生物成像流程,通过对细胞免疫荧光图像的处理,能够准确地分割细胞核和细胞骨架纤维,并提取相关特征。他们运用线段重排和图网络等处理策略,自动提取线段特征(LSFs)和细胞骨架网络特征(CNFs),这表明该计算框架能够详细地研究细胞骨架的组织特征,有助于区分具有侵袭性的细胞。
- 不同形态细胞的细胞骨架架构存在明显差异:研究人员通过分析多种细胞骨架特征,如取向、形态、数量、紧凑度、径向度等,发现不同形态的细胞具有不同的细胞骨架结构。例如,通过计算取向有序参数(OOP),发现纤维排列越整齐的细胞,OOP 值越高;纤维长度和细胞内的变异性也有关系,纤维越长的细胞,长度变异性越高。此外,他们还研究了细胞骨架与细胞核的相互连接,发现小细胞的纤维与细胞核的平均距离较短。这些结果说明研究人员开发的流程能够全面地分析细胞骨架架构。
- E-cadherin 功能缺失且具有侵袭潜能的细胞具有独特的细胞骨架架构:研究人员以表达野生型和突变型 E-cadherin 的细胞为模型进行研究。结果发现,突变型细胞的 OOP 值显著降低,纤维排列更紊乱;纤维长度缩短,且长度变异性更低;纤维数量和强度也明显减少,并且分布更密集、更不呈放射状。这些结果表明,具有侵袭性的 E-cadherin 功能异常的细胞,其纤维取向虽然紧凑但高度紊乱,这可能有利于癌细胞在细胞外基质(ECM)中的可塑性和快速扩散。
研究结论和讨论部分指出,细胞骨架在细胞的众多过程中起着至关重要的作用,但目前人们对其在癌症中的调控机制了解有限。该研究开发的新型计算流程,能够识别与癌症进展相关的细胞骨架架构模式,通过一系列指标成功地识别出具有侵袭能力细胞的微管组织特征。这一成果不仅为研究细胞骨架在癌症中的作用提供了有力工具,还有助于识别潜在的侵袭性癌细胞或分子靶点,对癌症研究和临床应用具有重要意义。此外,该计算流程还可以用于研究其他疾病中细胞骨架的变化,具有广泛的应用前景。