整合应激反应中细胞自主、非配体依赖且由 DR5 驱动的凋亡开关新发现

【字体: 时间:2025年02月17日 来源:Cell Death & Disease 8.1

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  为探究 ISR 细胞死亡调控机制,美国加州大学圣巴巴拉分校的研究人员开展了相关研究。他们发现 ISR 通过细胞内非配体依赖的 DR5 激活诱导凋亡。该成果为理解细胞应激反应提供新思路,推荐科研读者阅读。

  

美国加利福尼亚大学圣巴巴拉分校(University of California, Santa Barbara)的 Francesca Zappa、Nerea L. Muniozguren 等研究人员在《Cell Death and Disease》期刊上发表了题为 “The integrated stress response engages a cell-autonomous, ligand-independent, DR5-driven apoptosis switch” 的论文。这篇论文在细胞应激反应和细胞死亡调控领域意义重大,为深入理解细胞如何应对压力并决定自身命运提供了关键线索,有望为相关疾病的治疗和干预开辟新的思路。


摘要解读


论文的摘要指出,整合应激反应(Integrated Stress Response,ISR)是细胞应对各种压力、恢复体内平衡的重要信号网络。当细胞无法恢复平衡时,ISR 会促使细胞死亡,清除受损严重的细胞。以往研究表明,在内质网(Endoplasmic Reticulum,ER)持续应激时,ISR 激酶 PERK 的持续激活会诱导死亡受体 5(Death Receptor 5,DR5)下游的细胞凋亡。本研究通过化学遗传学方法,发现 DR5 从高尔基体发出的信号是 ISR 的重要组成部分,且不局限于 ER 应激。此外,DR5 的激活仅需其表达增加,并不依赖其胞外结构域(Ectodomain,ED)。这些发现揭示了一种由 ISR 控制的通用细胞死亡机制,能清除不可逆损伤的细胞。


研究背景


ISR 是细胞内重要的信号网络,由 GCN2、HRI、PKR 和 PERK 这四种传感器激酶(sensor kinases)调控。不同的应激源会激活相应的激酶,如氨基酸短缺和核糖体碰撞激活 GCN2,血红素缺乏、氧化和线粒体应激激活 HRI,病毒和内源性双链 RNA 激活 PKR,ER 蛋白质稳态失衡激活 PERK 。这些激酶会磷酸化真核起始因子 2α(eukaryotic initiation factor 2α,eIF2α),抑制细胞内整体的蛋白质合成。但一些含有上游开放阅读框(upstream open reading frames,uORFs)的 mRNA 不受此调控,在 eIF2α 磷酸化时会被选择性翻译,其中包括编码转录因子 ATF4、CHOP 以及 GADD34 的 mRNA。GADD34 能使 eIF2α 去磷酸化,形成负反馈回路,终止 ISR 信号传导,并建立应激记忆。


在正常情况下,ISR 通过重新编程翻译组和转录组来满足细胞需求,恢复体内平衡。然而,当细胞面临严重且持续的应激,无法恢复平衡时,ISR 就会启动细胞凋亡程序,清除受损细胞。在 ER 应激过程中,PERK 和 ER 应激传感器激酶 / 核糖核酸酶 IRE1(Unfolded Protein Response,UPR 的三个调控因子之一)之间的信号相互作用,决定了细胞的适应性反应或死亡结局。PERK 下游的 CHOP 会诱导 DR5 的表达,DR5 属于肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)超家族的跨膜死亡受体。在 UPR 的早期适应性阶段,IRE1 会切割 DR5 mRNA 使其降解。但在持续的 ER 应激中,PERK 下游的磷酸酶 RPAP2 抑制促生存的 IRE1 信号,使平衡向促凋亡的 PERK-CHOP 轴倾斜,导致 DR5 激活。此前认为,在 ER 应激时,未折叠蛋白会积累并作为激活配体与 DR5 的 ED 结合,其 ED 中的二硫键重排也有助于 DR5 通过寡聚化激活。


这些现象表明,持续的 ER 应激会引发局部的细胞清除程序。但 eIF2α 磷酸化和 CHOP 诱导是 ISR 的常见输出,这暗示可能存在一种由 DR5 控制的通用 ISR 细胞清除模式。为验证这一假设,研究人员开展了此项研究。


研究方法


  1. 细胞处理与诱导:选用 H4 神经胶质瘤细胞(neuroglioma cells)、ARPE19 和 RPE1 非癌细胞系进行实验。使用多种 ISR 诱导剂处理细胞,如用毒胡萝卜素(thapsigargin)诱导 ER 应激并激活 PERK,转染双链 RNA 模拟物聚肌苷酸 - 聚胞苷酸(polyinosinic-polycytidylic acid,poly I:C)诱导 dsRNA 应激并激活 PKR,用寡霉素(oligomycin)诱导线粒体应激并激活 HRI,用 L - 组氨醇(L-histidinol)模拟营养缺乏并激活 GCN2。同时,使用 ISR 抑制剂 ISRIB、泛半胱天冬酶抑制剂 Z-VAD-FMK 等进行共处理实验。

  2. 基因工程技术:构建稳定表达 FKBP-PKR 的细胞系,通过小分子配体激活该融合蛋白,实现无应激条件下激活 ISR。利用 CRISPR 干扰(CRISPR interference,CRISPRi)技术敲低 DR5 基因表达,用 RNA 干扰(RNA interference)技术敲低 FADD 或 TRAIL 基因表达。构建并转染表达全长 DR5 和缺失 ED 的 DR5 突变体的细胞系。

  3. 检测技术:采用定量实时聚合酶链反应(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)检测 mRNA 水平;蛋白质免疫印迹(immunoblotting)分析蛋白质表达、磷酸化水平和蛋白切割情况;免疫荧光分析(immunofluorescence analyses)观察蛋白的亚细胞定位;流式细胞术(flow cytometry)检测细胞活力和死亡情况;酶联免疫吸附测定(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)检测细胞内和细胞外 TRAIL 蛋白水平。


研究结果


  1. 不同 ISR 诱导应激均导致 DR5 激活:用不同的 ISR 诱导剂处理 H4 细胞 18 小时后,qRT-PCR 检测发现,毒胡萝卜素处理使 DR5 mRNA 上调约 4 倍,poly I:C、寡霉素和 L - 组氨醇处理分别使其上调约 2 倍和 3 倍。蛋白质免疫印迹结果显示,DR5 蛋白水平也相应增加,同时伴随 caspase - 8、caspase - 3 的切割和 PARP1 的裂解,这些都是 DR5 促凋亡活性的体现。用 ISRIB 抑制 ISR 后,DR5 mRNA 上调受到抑制,细胞活力部分恢复,细胞死亡减少。过表达 eIF2α 的磷酸模拟突变体 eIF2α551D 也能诱导 DR5 mRNA 积累,进一步证明 DR5 是由磷酸化 eIF2α 下游的不同 ISR 激酶诱导产生的。

  2. 无应激激活 ISR 诱导 DR5 和细胞凋亡:激活 FKBP-PKR 模拟无应激条件下的 ISR 激活,H4 细胞中 DR5 mRNA 和蛋白随时间积累,在 16 小时达到峰值。在 ARPE19 和 RPE1 细胞中也观察到类似现象,且伴随 caspase - 8 切割和 PARP1 裂解等细胞凋亡标志。这表明 DR5 可以在不依赖应激输入的情况下被诱导,启动 ISR 下游的细胞自主凋亡。

  3. ISR 下游细胞死亡依赖 DR5:在表达 FKBP-PKR 的 H4 细胞中,用 CRISPRi 敲低 DR5 后,FKBP-PKR 激活时 caspase - 8 和 caspase - 3 的激活显著降低,细胞活力明显恢复。过表达抗凋亡蛋白 BCL-XL 可完全阻断 FKBP-PKR 激活诱导的细胞死亡,表明 ISR 细胞死亡信号通过内源性凋亡途径传导。此外,ISRIB 和 Z-VAD-FMK 处理以及 DR5 基因敲低均能恢复细胞活力,进一步证实 DR5 是 ISR 诱导细胞凋亡所必需的。

  4. 无应激激活 ISR 导致 DR5 细胞内激活:检测发现,FKBP-PKR 激活的细胞中 TRAIL mRNA 和蛋白水平均下降,敲低 TRAIL 不影响细胞死亡,用 DR5 中和性 Fc 抗体片段(FcDR5)处理也不能阻止细胞死亡和 caspase 激活,说明 TRAIL 和细胞膜上的 DR5 在 ISR 激活的细胞死亡中并非必需。免疫荧光分析显示,无应激激活 ISR 时,DR5 积累在顺面高尔基体(cis-Golgi apparatus),与 ER 应激诱导剂处理后的定位相似,表明终端 ISR 采用了一种内在、通用、非传统的细胞自主凋亡机制。

  5. DR5 激活无需其 ED:构建表达全长 DR5 和缺失 ED 的 DR5 突变体的细胞系,过表达这两种蛋白均导致细胞活力剂量依赖性下降,且激活 DR5 下游分子级联反应的程度相似,均能诱导 caspase - 8、caspase - 3 切割和 PARP1 裂解。两种蛋白都积累在顺面高尔基体并与 caspase - 8 共定位,用布雷菲德菌素 A(brefeldin A)破坏高尔基体结构后,细胞死亡部分受到保护,说明增加 DR5 水平足以在高尔基体膜上原位组装死亡诱导信号复合物(Death-Inducing Signaling Complex,DISC),启动细胞内、依赖 DR5 的细胞自主凋亡程序,DR5 表达本身就足以激活细胞自主的 ISR 细胞死亡开关,无需细胞内配体。


研究结论与讨论


本研究通过多种实验方法证实,终端 ISR 依赖细胞内 DR5 的激活来启动细胞自主凋亡机制,且该过程无需 DR5 的 ED 激活信号。这一结论基于多方面证据:ISR 诱导剂和无应激激活 ISR 均能上调 DR5 并诱导细胞凋亡;ISRIB 可逆转 ISR 诱导的 DR5 上调和细胞死亡;缺乏 DR5 的细胞对 ISR 诱导的细胞死亡更具抗性;DR5 在细胞内激活且积累于顺面高尔基体;缺失 ED 的 DR5 突变体过表达仍能诱导细胞死亡。


ISR 在维持细胞健康中起着关键作用,它需要准确解读应激信息并做出相应反应。终端 ISR 可能通过 eIF2α 下游的通用机制,将细胞不可修复的危急状态信息传递给 DR5,启动促凋亡信号通路(phospho-eIF2α→CHOP→DR5)。研究还发现,过表达 BCL-XL 可完全阻止合成 ISR 激活导致的细胞死亡,表明 ISR 细胞死亡开关优先激活内源性凋亡途径,但细胞中可能存在功能冗余机制来清除无法恢复稳态的细胞。


此外,研究表明 DR5 可通过过表达激活,且在无 ISR 诱导应激时也能激活,这意味着 ISR 细胞死亡开关可能不依赖于特定的应激输入与 DR5 激活的精确匹配,而是当应激持续且达到一定阈值(如 ISR 信号持续时间或强度)时即可启动。虽然不能完全排除其他因素对 DR5 活性的影响,但研究结果支持 DR5 在顺面高尔基体的聚集是 ISR 细胞死亡开关的主要组成部分这一观点。


这项研究揭示了 ISR 调控细胞死亡的通用机制,有助于深入理解 ISR 如何维持组织健康,无论是通过定制的稳态解决方案还是统一的终端反应。这为进一步研究细胞应激反应和细胞死亡调控提供了重要理论基础,也为开发针对相关疾病(如神经病理疾病、癌症等,这些疾病中 ISR 常出现失调)的治疗策略提供了潜在靶点和新思路。


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