前沿探索：菲律宾窄口蛙属杂交现象对系统发育推断与分类学的深远影响——揭示森林破坏背景下的进化新机制

为解决菲律宾窄口蛙属（Kaloula）杂交现象导致的系统发育推断和分类学混淆问题，研究人员开展了关于杂交对进化历史和分类学影响的研究。他们发现，杂交导致的“人为分支效应”会误导传统分类方法，而网络多物种共存（network multispecies coalescent）和群体遗传学方法能更准确推断网状进化历史。该研究揭示了森林破坏背景下的杂交现象，为生物多样性保护和进化生物学研究提供了新视角，值得生命科学领域专业人士深入阅读。

　　

摘要

杂交在许多类群的进化历史中扮演着重要角色，并可能产生混淆模式，影响许多下游应用。在本研究中，我们实证展示了杂交如何通过“人为分支效应”混淆系统发育推断、物种边界和分类学研究。菲律宾窄口蛙属（Kaloula）的适应性辐射表现出广泛的表型和生态适应，性但其进化历史和分类学仍然知之甚少。特别是Kaloula conjuncta复合群包含许多尚未解决分类边界的亚种，其进化关系也不明确。在这个复合群中，Kaloula conjuncta stickeli一直被认为是一种罕见、神秘且表型独特的亚种，自其最初描述以来近80年未被再次发现。在这里，我们发现K. c. stickeli与K. conjuncta meridionalis和Kaloula复合群之外的另一个物种K. picta共享等位基因。通过目标捕获测序和稳健的分析框架，我们表明，尽管K. c. stickeli具有独特的表型，但它很可能是K. c. meridionalis和K. picta之间的不育F1杂交后代，因此不应被赋予分类学地位。我们的结果表明，系统发育推断和综合分类学中常用的行业标准方法——形态学、系统基因组学、聚类和基于距离的方法——在识别和理解杂交后代的亲缘关系时可能会产生误导性结果。相比之下，我们展示了网络多物种共存和群体遗传学方法在准确推断网状进化历史方面更为有效。我们还提出了一个罕见现象——由森林砍伐诱导的杂交，这在东南亚大规模森林破坏的背景下可能具有重要意义。