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在细胞研究领域,微管超稳定化对染色体分离的影响尚不明晰。为深入探究,研究人员以表达微管超稳定化 tubulin 突变体的 budding yeast 为对象展开研究。结果发现细胞通过非整倍体和 tubulin 突变适应微管超稳定化,该成果为理解癌症对微管靶向药物耐药机制提供了重要线索。
** 在细胞的微观世界里,微管就像一座繁忙城市中的交通网络,有条不紊地引导着染色体的分离,确保细胞分裂的正常进行。然而,当微管的稳定性被打破,变得过度稳定时,就如同交通网络陷入了混乱,染色体的分离也会受到影响,进而导致细胞功能出现异常。目前,虽然知道微管超稳定化会干扰染色体分离,且这一现象在癌症治疗中有所应用,但细胞究竟是如何应对微管超稳定化的,这个问题却如同迷雾,一直没有得到清晰的解答。
为了揭开这层迷雾,来自 IFOM - ETS(The AIRC Institute of Molecular Oncology)等机构的研究人员展开了一项深入的研究。他们的研究成果发表在《Cell Reports》上,为我们理解细胞的奥秘提供了重要的线索。
研究人员主要采用了实验室进化实验、基因组测序、多种细胞分析技术以及数学建模等方法来开展研究。在实验室进化实验中,他们利用携带 tub2T238A点突变的 budding yeast(酿酒酵母)细胞进行实验 ,观察细胞在微管超稳定化情况下的进化过程。通过基因组测序,分析细胞在进化过程中的基因变化。运用多种细胞分析技术,如液体生长测定、流式细胞术等,对细胞的生长、DNA 含量、微管形态等特征进行监测。同时,借助数学建模,深入探讨细胞进化的动态过程和机制。
研究结果主要有以下几个方面:
- 酵母细胞恢复生长:研究人员利用 tub2T238A点突变开展实验,发现该突变的单倍体细胞生长严重受损。于是,他们通过将杂合二倍体孢子化获得野生型(WT)和 tub2T238A单倍体菌株进行进化实验。实验过程中,以生长速率等作为检测指标,结果显示,随着实验的进行,tub2T238A细胞的生长速率逐渐增加,在约 65 代时接近 WT 水平,并一直维持到实验结束。这表明细胞能够进化以补偿 tub2T238A诱导的微管超稳定化,使细胞周期能够正常进行。
- 最早的进化反应及后续变化:研究人员对不同时间点的细胞群体进行基因组测序,以确定生长恢复背后的基因变化。在早期(T1),细胞中未检测到反复突变的基因,但出现了反复的非整倍体,主要涉及染色体 XII 和 XVI 等。而在后期(Tf),当生长基本恢复时,细胞大多恢复了正常的倍性,此时出现了点突变,其中 TUB1、TUB2、TUB3 和 MCM21 的突变符合作为 tub2T238A候选补偿突变的标准。这说明细胞对微管超稳定化的进化反应,最初是出现非整倍体,随后被点突变所取代。
- 不同突变的补偿作用差异:研究人员选择了不同位置的 tubulin 基因突变进行深入研究,通过生长实验等方法评估它们对 tub2T238A突变的补偿能力。结果发现,这些 tubulin 基因突变都能在一定程度上补偿 tub2T238A突变,使细胞恢复生长。其中,tub2T238A,V268I和 tub2T238A,N347K的生长依赖于纺锤体组装检查点(SAC)。而 MCM21 突变单独存在时,对 tub2T238A的补偿作用不明显。
- 体内外分析揭示突变差异:在体内实验中,研究人员通过对不同突变体进行多种检测,如对微管解聚药物苯菌灵的敏感性检测和与 mad2Δ 的合成相互作用检测等,发现不同的补偿突变对微管稳定性的影响程度不同,并将其分为强、中、弱解聚剂三类。在体外实验中,通过测量携带补偿突变和 T238A 突变的微管动力学,进一步证实了补偿突变能不同程度地恢复微管动力学,且体外实验结果与体内实验基本一致。
- 特定基因剂量增加的作用:研究人员发现,在早期进化过程中出现的染色体 XII 和 XVI 的非整倍体,可分别由 STU2 和 VIK1/KAR3 基因剂量的增加来解释。STU2 编码的蛋白能促进微管解聚,其剂量增加可部分挽救微管超稳定化伴随的生长缺陷和染色体错分离。VIK1 和 KAR3 基因的复制也能改善细胞生长,而 IPL1 基因在染色体 XVI 非整倍体形成中不起相关作用。
- 突变与非整倍体的关系:研究人员通过实验和数学建模研究了补偿突变与非整倍体之间的相互作用。结果表明,获得补偿突变的 tub2T238A细胞并非来自非整倍体细胞,而是直接来自 tub2T238A整倍体细胞,即非整倍体在细胞适应微管超稳定化的过程中可能是一种进化 diversion。
在讨论部分,研究人员指出,他们的研究确定了纺锤体组装检查点(SAC)在支持染色体分离中的作用,它能增加补偿突变的目标大小,可能加速适应性进化。同时,研究还发现只有 tubulin 突变能挽救微管超稳定化的 T238A 突变,这可能与微管作为结构成分需恢复原有形式有关。此外,研究中发现的一些突变与癌症患者中的突变存在重叠,这对于理解癌症患者对微管靶向药物耐药性的产生具有重要意义,为未来开发针对耐药细胞的治疗策略提供了新的思路。总的来说,这项研究为我们深入理解细胞应对微管超稳定化的机制提供了丰富的信息,在细胞生物学和癌症治疗领域都具有重要的价值,为后续的研究和治疗策略的开发奠定了坚实的基础。**