分子梭过渡路径时间对称性揭示微观可逆性机制:单分子光学镊子研究

【字体: 时间:2025年02月19日 来源:Chem 19.1

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  编辑推荐:本研究利用光学镊子技术首次在机械平衡条件下观测单个分子梭(molecular shuttle)的过渡路径(transition path),证实其时间分布具有对称性,验证了微观可逆性原理,为理解合成分子机器的动力学机制及优化纳米技术应用提供了新范式。

  

在分子机器的奇妙世界里,分子梭(molecular shuttle)如同纳米尺度的"摆渡车",其核心部件——大环分子(macrocycle)在线性轴上两个站点(station)间的往复运动,是构建更复杂分子机器的基本单元。尽管这类由氢键(hydrogen bonding)驱动的分子器件已被研究数十年,但科学家们始终被一个关键问题困扰:在皮秒级的时间尺度上,大环分子究竟如何穿越能量势垒?传统的光谱学方法只能捕捉平均态信息,而过渡路径(transition path)的瞬时动态始终是未被观测的"暗物质"。

针对这一挑战,IMDEA纳米科学研究所联合美国缅因大学的研究团队在《Chem》发表突破性成果。研究者设计合成了一种基于苄胺大环的Leigh型分子梭,其富马酰胺(fum)和琥珀酰胺酯(succ)两个站点通过5.5 nm的寡聚乙二醇间隔基分隔。通过独创性的单分子操控策略——将分子梭两端分别连接双链DNA(dsDNA)手柄,一端固定于微吸管尖端,另一端由光阱(optical tweezers)捕获,实现了在9.4 pN共存力(F1/2)条件下,以毫秒分辨率记录数百次穿梭事件。

关键技术包括:1)合成含叠氮基团大环和生物素标记封端基的分子梭;2)通过点击化学(click chemistry)将dsDNA手柄分别连接大环与封端基;3)光学镊子系统在Tris-HCl缓冲液中施加恒定力并监测位移;4)采用最后接触-首次接触时间(LTFT)分析和过渡路径概率计算能量景观。

过渡路径时间的对称性验证
通过定义a→b(fum→succ)和b→a(succ→fum)的过渡路径时间τts,发现两者分布曲线完美重叠(p>0.05,Kolmogorov-Smirnov检验)。当选取不同机械力(8.5-10.3 pN)改变站点平衡时,LTFT时间始终满足τLTFT(a→b)=τLTFT(b→a),这一结果首次实验验证了Bier-Astumian理论预测的微观可逆性(microscopic reversibility)在合成分子系统中的普适性。

能量景观的重构
基于过渡路径概率比P[a→b,Δt]/P[b→a,Δt]=exp(-ΔG/kBT),研究者成功计算出过渡态附近的自由能变化。与传统的玻尔兹曼分布法相比,该方法在非平衡条件下仍保持准确性,为分子机器能量学分析提供了新工具。特别值得注意的是,尽管单个过渡路径时间存在显著波动(反映热运动的随机性),但统计集合严格遵循时间反演对称性。

这项研究的意义在于:1)建立了合成分子器件过渡路径分析的实验范式;2)证实微观可逆性在人工分子机器中的支配地位;3)发展的LTFT分析方法可推广至化学驱动非平衡态研究。正如作者展望指出,未来通过比较不同化学结构分子梭的过渡路径形状,将能解析能垒穿越的多路径机制,为设计高性能纳米传动装置提供定量依据。该成果不仅填补了分子机器基础理论的实验空白,更开辟了通过路径热力学(path thermodynamics)优化分子器件的新方向。

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