综述:揭开细菌源细胞外囊泡的奇妙面纱:从基本功能到有益应用

【字体: 时间:2025年02月19日 来源:Heliyon 3.4

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  这篇综述聚焦细菌源细胞外囊泡(EVs),详细阐述其分类、特性、形成机制,以及在致病、免疫调节、抗菌耐药性传播等方面的作用,还探讨了其在治疗、诊断、疫苗开发等领域的应用前景与面临的挑战,为相关研究提供全面参考。

  

1. 细胞外囊泡:分类、分离、组成及功能

细胞向胞外分泌成分是生命基本过程,其中细胞外囊泡(EVs)是重要媒介。EVs 是纳米级、膜包裹的结构,由原核生物和真核生物分泌。
在真核生物中,EVs 可分为微泡(200nm - 1μm,由质膜向外出芽形成)、外泌体(30 - 150nm,源于多泡体与质膜融合)和凋亡小体(1000nm - 5000nm,产生于程序性细胞死亡)。不过,文献中细胞衍生微粒和微泡常混用,二者在大小、形成过程、内容物和功能上存在细微差异 。
细菌分泌的 EVs 同样备受关注。革兰氏阴性菌能分泌外膜囊泡(OMVs)、外 - 内膜囊泡(O - IMVs)和爆炸外膜囊泡(E - OMVs);曾认为革兰氏阳性菌因细胞壁结构无法产生 EVs,但如今已成功分离出 20 - 400nm 的膜囊泡。此外,细菌还能产生类外泌体囊泡、凋亡小体和原生质体衍生囊泡等 。
革兰氏阳性菌和阴性菌产生 EVs 的途径不同。阴性菌中,内膜溶素引发的细胞裂解、周质中错误折叠蛋白积累、外膜 - 肽聚糖交联丧失、ABC 转运系统表达降低以及膜成分改变等都可促使 OMVs 形成 。阳性菌的 EVs 主要通过细胞质膜特定富含脂质区域扩张,在胞壁溶解酶作用下释放 。而且,多种基因参与细菌 EVs 的生物发生过程。
EVs 携带蛋白质、脂质、核酸(DNA 和 RNA)等多种成分,其组成受来源、菌株、生物发生过程和环境条件影响。例如,革兰氏阳性菌的 EVs 不含脂多糖和周质成分,致病细菌的 EVs 可能携带毒力因子 。这些成分通过尚未明确的选择性机制进行分选,可能涉及一般分泌系统、双精氨酸转运(Tat)途径等 。
研究 EVs 及其组成依赖先进的生化和技术手段。目前的分离方法包括超速离心、超滤和尺寸排阻色谱等,各有优缺点 。在功能上,EVs 在细菌生命周期中至关重要,参与细菌间通讯、生存和适应,例如促进生物膜形成、群体感应、水平基因转移,协助细菌递送毒性物质、调节宿主免疫反应、获取营养等 。

2. 影响 EVs 特性的因素

EVs 的产生、组成和功能受多种因素影响,其中环境压力作用显著。
温度对 EVs 影响较大,它能改变膜流动性、蛋白质表达和毒力因子包装。高温可能通过增加膜流动性促进 EVs 产生,低温则抑制其生成。例如,金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)在不同温度下,EVs 的蛋白质含量和毒力因子包装存在差异,40°C 时毒力因子较多,可能增强对免疫反应的抵抗;34°C 时货物成分更丰富,或许与定植阶段相关 。
渗透压同样影响 EVs,它可改变膜张力,进而促进或抑制囊泡形成。高渗透压下,金黄色葡萄球菌的细胞壁增厚,阻碍 EVs 分泌,导致蛋白质产量降低;而恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)在高渗透压时,OMVs 脱落增加 。在渗透压应激下,EVs 可作为排出有毒化合物或积累维持渗透压平衡分子的机制,起到保护细胞的作用 。
氧化应激也不容忽视。当细菌产生的活性氧物种未完全消耗时,会引发氧化应激,促使富含应激诱导分子的 EVs 产生,这些 EVs 可向其他细胞发出信号,诱导防御反应或调节宿主免疫反应。如在亚抑制浓度环丙沙星作用下,金黄色葡萄球菌的 EVs 产量增加 。
研究这些因素对囊泡动态的调节作用,有助于深入理解细菌的生存策略、致病机制,为生物技术和医学应用(如疫苗和药物递送)提供思路 。

3. EVs 在各领域的新兴作用

3.1 EVs 的致病性与免疫反应调节作用

EVs 在细菌感染致病过程中扮演关键角色。它能帮助细菌进入细胞、逃避免疫系统攻击,进而引发疾病和组织损伤。比如单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)的 EVs 可协助细菌入侵宿主细胞;霍乱弧菌(Vibrio cholerae)通过 EVs 释放霍乱毒素,促进其向肠道上皮细胞的递送,引发腹泻 。
EVs 还可与 Toll 样受体(TLRs)相互作用,TLRs 是免疫细胞表面的模式识别受体(PRRs) 。EVs 携带的病原体相关分子模式(PAMPs),如脂多糖(LPS)、病毒 RNA 和细菌 DNA 等,能被 TLRs 识别,触发免疫反应,保护机体免受感染;同时,EVs 中的损伤相关分子模式(DAMPs)也可激活 TLRs 。不过,在疾病状态下,EVs 对免疫反应的调节作用复杂,可能促进或抑制 TLR 信号传导,如肿瘤来源的 EVs 可逃避免疫检测或激活抗肿瘤免疫反应 。此外,EVs 有望作为递送 TLR 激动剂或拮抗剂的载体,用于增强疫苗疗效或调节自身免疫疾病中的过度炎症 。
一些病原体的 EVs 还能作为诱饵,吸收抗体和抗菌肽,帮助细菌逃避直接免疫攻击。例如幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)和脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis)的 EVs 含有免疫调节因子,可抑制免疫细胞激活、下调炎症反应或诱导免疫细胞凋亡 。在泌尿系统感染(UTIs)中,由革兰氏阴性菌、阳性菌和真菌引起的感染里,EVs 都参与调节免疫过程,成为潜在的治疗靶点和诊断标志物 。

3.2 EVs 在诱导抗菌耐药性中的作用及抗生素对 EVs 的影响

EVs 在细菌群体间传播抗菌耐药性(AMR)方面作用重大,它能携带并运输包括质粒和抗生素耐药基因在内的遗传物质,通过水平基因转移(即 vesiduction)促进耐药性在不同细菌间扩散 。例如鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)释放的 OMVs 携带 blaOXA - 58、blaOXA - 23和 blaNDM - 1等 β - 内酰胺酶基因,使细菌对碳青霉烯类抗生素产生耐药性;嗜麦芽窄食单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)、卡他莫拉菌(Moraxella catarrhalis)和脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)等耐药菌株的 OMVs 也运输 β - 内酰胺酶 。流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae)合成 β - 内酰胺酶并封装在囊泡中,保护自身及其他细菌免受抗生素影响 。在产超广谱 β - 内酰胺酶(ESBL)的大肠杆菌(E. coli)菌株中,EVs 也促进了抗生素耐药基因的水平转移 。
此外,EVs 可保护携带的遗传物质不被降解,提高受体细菌成功整合遗传元件的概率 。同时,抗生素对细菌的作用也会影响 EVs 的产生。例如,地杆菌(Geobacter sulfurreducens)暴露于亚最小抑制浓度的抗生素时,OMVs 的产生和氧化还原活性改变;β - 内酰胺类抗生素可增加大肠杆菌 K1 RS218 菌株的 BEV 产生,而氨基糖苷类则无此作用 。有趣的是,气道上皮细胞来源的 EVs 可将小 RNA 片段转移到铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)中,增强其对氟喹诺酮类药物的敏感性 。深入了解 EVs 在 AMR 传播中的机制,对制定有效对抗抗生素耐药性的策略至关重要 。

3.3 OMVs 的抗菌和抗生物膜特性

抗菌耐药性给抗菌治疗带来巨大挑战,尤其是在生物膜存在的情况下。生物膜是由微生物(如细菌)组成的复杂群落,被自身产生的细胞外基质包裹,可抵御抗生素和宿主免疫系统 。EVs 在生物膜形成、结构维持和功能发挥中起重要作用,它作为信号分子、遗传物质和生物活性化合物的载体,促进细菌间通讯,增强生物膜结构,帮助细菌适应环境变化 。例如,EVs 可通过交联生物膜中的蛋白质、多糖和 DNA 等成分,增强生物膜的稳定性和凝聚力,使其更能抵抗物理干扰和抗菌治疗 。
不过,EVs 在生物膜形成中的作用具有两面性。一方面,一些 EVs 可促进生物膜形成,如气单胞菌(Aeromonas)菌株的 OMVs、金黄色葡萄球菌和变形链球菌(Streptococcus mutans)的 EVs;另一方面,某些 EVs 能抑制早期生物膜形成,甚至降低细菌毒力,如干酪乳杆菌(Lacticaseibacillus casei)的囊泡、铜绿假单胞菌产生的具有抗生物膜活性的 OMVs 。此外,研究发现铜绿假单胞菌生物膜在不同生长阶段分泌的 EVs 功能不同,指数生长期的 EVs 促进生物膜生长,而死亡 / 存活期的 EVs 则可能抑制生物膜生长,这为治疗铜绿假单胞菌生物膜感染提供了新思路 。而且,非细菌来源的 EVs 也可能抑制细菌生物膜形成,如白色念珠菌(Candida albicans)产生的 EVs 可抑制肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)的粘附和生物膜形成 。

3.4 EVs 的治疗应用

EVs,包括革兰氏阴性菌的 OMVs 和革兰氏阳性菌的 MVs,在治疗研究领域发展迅速 。它们具有良好的生物相容性和安全性,可被工程化用于特定医疗目的,在癌症治疗、感染控制等方面展现出巨大潜力 。
在应对抗生素耐药问题上,EVs 表现出强大的杀菌能力,可作为抗生素递送平台,提高治疗效果和特异性 。例如,将环丙沙星装载到囊泡中治疗志贺菌感染模型,取得了良好效果 。与游离抗生素相比,装载抗生素的 EVs 能更精准地靶向感染部位,增强药代动力学特性,减少副作用 。
在癌症治疗方面,EVs 也发挥着重要作用。以幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)感染相关的胃癌为例,乳酸杆菌(Lactobacillus crispatus)来源的 EVs 可下调促炎细胞因子(如 IL - 1β、IL - 6、IL - 8 和 TNF - α)的 mRNA 表达,上调抗炎细胞因子(如 IL - 10 和 TGF - β)的表达,有望用于预防此类癌症 。此外,EVs 还可用于癌症的药物递送。如肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)来源的装载阿霉素(DOX)的 OMVs,能有效将 DOX 递送至肺癌细胞,抑制小鼠模型中的肿瘤生长,并招募肿瘤微环境(TME)中的巨噬细胞,增强药物的体内细胞毒性 。还有经工程化修饰的大肠杆菌来源的 OMVs,可用于靶向治疗黑色素瘤,通过光热效应和释放肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL),抑制肿瘤细胞增殖和侵袭 。大肠杆菌 W3110 来源的 OMVs 可在肿瘤部位聚集,诱导长期抗肿瘤免疫反应,促进抗癌细胞因子(如 CXCL10 和干扰素 - γ)的产生,有望作为多种癌症的免疫治疗剂 。

3.5 EVs 在细菌种间协同作用中的角色

EVs 在介导细菌种间相互作用方面发挥重要作用。例如金黄色葡萄球菌(S. aureus)来源的 EVs(SaEVs)可与铜绿假单胞菌(P. aeruginosa)的膜融合,增强铜绿假单胞菌的脂多糖(LPS)合成,促进生物膜形成,增加其对宿主上皮细胞的侵袭能力,降低被免疫细胞(如巨噬细胞)摄取的概率,从而增强铜绿假单胞菌的致病性,使感染更加严重 。
在人类肠道微生物群中,多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)和普拉梭菌(Faecalibacterium prausnitzii)通过 EVs 形成协同关系。多形拟杆菌释放的 EVs 含有分解复杂多糖的酶,为普拉梭菌提供生长所需的简单糖类;普拉梭菌产生丁酸,而 EVs 中的信号分子可增强丁酸产生,这种互利共生关系有助于维持肠道健康和稳定 。这种种间协同作用促进了微生物群落的形成,增强了细菌群体的毒力和生存能力,也为开发破坏有害细菌协作的策略提供了方向 。

3.6 EVs 在诱导植物感染中的作用

EVs 是植物 - 病原体相互作用和植物适应环境的重要介质 。它可触发植物免疫反应,同时含有毒力蛋白,可能抑制植物免疫反应,帮助细菌在植物环境中生存 。例如,细菌鞭毛蛋白是植物免疫系统识别的成分,EVs 可携带鞭毛蛋白启动植物免疫反应 。此外,EVs 中的 β - 内酰胺酶可增强细菌在植物抗菌化合物存在下的生存能力,表明其在抗生素耐药方面的作用 。在铁限制条件下,EVs 富含的铁载体转运蛋白有助于细菌获取铁,参与植物环境适应 。通过递送毒力因子和调节宿主免疫反应,EVs 在植物感染过程中发挥关键作用,为开发新型植物保护策略提供了潜在靶点 。

3.7 疫苗与预防医学

EVs 携带可激活先天免疫受体的病原体相关分子模式和引发 B、T 细胞反应的抗原,能有效刺激先天和适应性免疫反应,因此成为疫苗开发的有前景候选者 。它可封装和递送多种抗原,以天然构象呈递,增强免疫原性 。
EVs 不仅可用于传染病疫苗,还可用于癌症疫苗。通过在其结构中呈现癌症抗原,EVs 可刺激免疫系统识别和攻击癌细胞 。例如,肠球菌(Enterococci)来源的 EVs 可作为潜在疫苗候选物,其中粪肠球菌(Enterococcus faecium)的六种与细胞外膜囊泡相关的蛋白质具有潜在疫苗价值 。此外,EVs 的纳米尺寸和生物相容性使其可作为疫苗的靶向递送系统,促进疫苗成分向特定免疫细胞的运输,增强摄取和疗效,同时稳定敏感疫苗成分,保护其在储存和运输过程中不被降解,尤其适用于需要严格冷链物流的疫苗 。

3.8 EVs 作为诊断工具的作用

近年来,EVs 因其独特性质和功能,在研究和诊断领域成为有力工具 。它可作为疾病生物标志物,通过对血液、尿液或唾液等体液进行非侵入性采样,实现靶向快速诊断 。例如,测量外泌体上的表皮生长因子(EGFR)受体可用于肺癌的体外诊断;血清外泌体 miR - 378 有望作为非小细胞肺癌的非侵入性筛查和监测生物标志物 。血清外泌体中的蛋白质 SIRT2 与急性缺血性中风(AIS)高度相关,可用于预测 AIS 诊断;尿液外泌体微小 RNA 可作为肾移植患者急性排斥反应的生物标志物 。EVs 为改善诊断方法,尤其是即时护理诊断提供了新机遇 。

3.9 EVs 对健康的促进作用

原核生物和真核生物来源的 EVs 在再生和治疗方面具有巨大潜力,尤其是在皮肤再生和伤口愈合领域 。间充质干细胞来源的 EVs(MSC - EVs)可通过向损伤部位递送血管内皮生长因子等生长因子,促进血管生成,加速组织修复和伤口愈合,还能刺激上皮细胞和成纤维细胞增殖,重塑细胞外基质,恢复正常皮肤结构,对治疗脱发等疾病也有一定效果 。细菌来源的 EVs 同样具有类似益处,如人头皮上的发酵乳杆菌(Leuconostoc holzapfelii)来源的 EVs 可促进人毛囊真皮乳头细胞分裂、迁移和增殖,刺激毛发生长;植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)来源的 EVs(LpEVs)具有抗老化和抗色素沉着作用,可调节细胞外基质相关基因表达,抑制弹性蛋白酶活性,减少皱纹形成,维持皮肤弹性 。这些发现为开发创新的护肤产品和治疗方法提供了可能 。

4. EV 介导疗法面临的挑战

尽管 EVs 作为潜在治疗载体备受关注,但 EV 介导的疗法仍面临诸多挑战 。
生产和扩大 EVs 规模是首要难题。生产过程往往产量低、劳动强度大,如生产链霉菌来源的 EVs 存在困难,从肿瘤细胞中分离外泌体也较为繁琐 。
药物装载效率和 EVs 的稳定性对治疗效果至关重要 。虽然有研究尝试通过创建混合外泌体等方法解决,但实现一致且高效的药物装载仍面临挑战 。此外,药物装载的 EVs 在储存和生理条件下的稳定性也有待提高 。同时,增强 EVs 的靶向特异性和效率也是一大障碍,需要优化靶向机制,减少脱靶效应 。
EVs 虽具有生物相容性,但免疫原性和安全性不容忽视 。尤其是细菌来源的 EVs 或重复给药时,可能引发免疫反应,因此需要对其免疫原性和长期安全性进行全面评估 。解决这些挑战对将 EV 介导的疗法成功转化为临床实践至关重要 。

5. 结论

EVs 参与多种生理和病理过程,在细菌生存和适应中发挥重要作用 。它通过传递信号<
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