
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
综述:i-基序作为基因表达调控开关的机制与意义
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年02月19日 来源:Molecular Therapy Nucleic Acids 6.5
编辑推荐:
这篇综述系统阐述了DNA非经典结构i-基序(i-motif)的生物学功能,揭示了其在酸性环境中通过C-C+碱基配对形成的四链体结构特性,重点探讨了pH、分子拥挤(molecular crowding)和蛋白互作(如hnRNP K/LL)对其稳定性的调控机制。文章创新性地提出i-基序与G-四链体(G4)在细胞周期中的动态平衡关系,并论证了其在癌基因(如c-MYC、BCL2、KRAS)启动子区的转录调控作用,为靶向核酸结构的精准医疗提供了新思路。
在生命科学领域,DNA的"变形记"正在颠覆传统认知。一种被称为i-基序(i-motif)的DNA四链体结构,正以其独特的动态特性成为基因调控的新星。这种由胞嘧啶(C)和质子化胞嘧啶(C+)通过特殊配对形成的结构,在酸性环境中展现出惊人的稳定性,却在生理pH条件下显得"害羞"——直到2018年科学家首次在细胞核内捕获其存在证据。
STRUCTURE AND STABILITY OF I-MOTIFS
i-基序的稳定性堪称"pH传感器"。研究表明,其最适稳定pH范围为4.0-5.0,在pH>7.0时易解离。但细胞内的分子拥挤效应(如PEG模拟环境)能突破这一限制,甚至允许其在pH 8.0维持结构。这种特性源于两类构型差异:短环(2-4 nt)的Class I结构稳定性较弱,而长环(达8 nt)的Class II结构可通过形成"帽子"结构增强稳定性。有趣的是,人类端粒(hTelo)的i-基序在4℃时稳定性骤增,暗示其可能与细胞休眠机制相关。
I-MOTIFS AND THEIR PHYSIOLOGICAL SIGNIFICANCE
在细胞周期舞台上,i-基序是G1期的"主角"。随着细胞进入S期,其"戏份"逐渐让位于G-四链体(G4)。这种交替现象与核内pH波动(6.9-7.4)和染色质状态变化密切相关。在病理语境下,i-基序展现出双重人格:在BCL2启动子区,其稳定化促进转录激活;而在c-MYC的NHEIII1区域,却扮演转录抑制者的角色。这种调控特异性与结合蛋白密切相关——hnRNP LL偏好结合BCL2的i-基序,而hnRNP K则调控KRAS和c-MYC。
MECHANISM OF ACTION
i-基序的调控机制犹如精密的"发条装置"。在BCL2启动子区,hnRNP LL通过RRM1/2结构域识别i-基序侧环,触发"缠绕-结合-解缠"三部曲:先稳定四链体结构,随后诱导其解旋为二元复合物,最终激活转录。相反,c-MYC的调控呈现"结构开关"特性:其NHEIII1区的4CT i-基序必须解旋才能允许hnRNP K结合5CT元件。这种动态平衡受到SP1转录因子诱导的扭转应力调控,展现核酸结构的机械敏感性。
I-MOTIFS AS THERAPEUTIC TARGETS
将i-基序转化为治疗靶点面临独特挑战。小分子IMC-48可稳定BCL2的i-基序促进抗凋亡,而IMC-76则通过破坏结构诱导肿瘤细胞死亡。在代谢疾病领域,ACC1基因启动子的i-基序/G4双重调控网络,为肥胖和糖尿病提供了潜在干预靶点。最新基因组定位研究揭示,i-基序富集于开放染色质区,这种定位特性与其作为"表观遗传调节器"的功能不谋而合。
RNA I-MOTIFS
RNA世界的i-基序则充满未解之谜。尽管核糖i-基序自由能仅为DNA版本的一半,但C≥5的重复序列仍可能形成功能性结构。有假说认为,这种结构在原始RNA世界中可能参与配体结合和聚合物稳定,为生命起源研究提供了有趣线索。
随着iMab抗体和CUT&Tag等技术的突破,i-基序研究正从结构生物学迈向功能基因组学。这种核酸结构的独特魅力在于其动态本质——正如作者所言:"基因调控是i-基序与G4、发夹环等结构的多重对话"。未来研究需要破解其组织特异性调控密码,开发能区分不同i-基序构象的靶向药物,方能在精准医疗时代实现其治疗潜力。
生物通微信公众号
知名企业招聘