基于生物信息学分析鉴定CTSS、DOK2和ENTPD1作为精神分裂症的潜在血液生物标志物

【字体: 时间:2025年02月20日 来源:BMC Psychiatry 3.4

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  本研究针对精神分裂症(SCZ)缺乏可靠血液诊断标志物的临床难题,通过整合GSE27383、GSE38484和GSE38481三个外周血基因表达数据集,运用limma差异分析、PPI网络构建及免疫浸润分析等技术,首次鉴定出CTSS、DOK2和ENTPD1三个关键基因。这些基因通过调控微胶质细胞活化、Ras-MAPK信号通路及嘌呤能系统参与SCZ发病,其联合诊断AUC达0.791,为SCZ的早期诊断和靶向治疗提供了新方向。

  

精神分裂症作为严重影响青少年认知功能的重性精神疾病,全球患者已从1990年的1330万激增至2016年的2090万,每年导致1340万伤残调整寿命年(DALYs)损失。尽管临床需求迫切,但当前诊断完全依赖主观症状评估,缺乏客观生物学标志物。更棘手的是,患者死亡率较普通人群高出11.2倍,其中自杀风险飙升9.7倍,凸显开发精准诊断工具的紧迫性。

为破解这一难题,研究人员通过生物信息学手段系统分析了来自外周血单核细胞(PBMCs)和全血样本的GSE27383(72例)、GSE38484(202例)和GSE38481(37例)三大数据集。研究发现,CTSS、DOK2和ENTPD1这三个关键基因构成的分子网络不仅能有效区分患者与健康人(组合AUC=0.791),更揭示了免疫-神经互作在SCZ发病中的核心作用。这项发表于《BMC Psychiatry》的研究,为精神分裂症的分子诊断开辟了新途径。

研究主要采用四大技术方法:1)基于limma包的差异基因筛选(|logFC|>0.1,p<0.05);2)STRING数据库构建蛋白互作网络结合Cytoscape的CytoHubba/MCODE插件鉴定枢纽基因;3)CIBERSORT算法解析22种免疫细胞浸润特征;4)NetworkAnalyst预测基因-miRNA调控网络。

研究结果

差异基因筛选

三数据集交叉获得55个核心差异基因(31上调/24下调),火山图显示GSE27383差异最显著(2687个DEGs)。

功能富集分析

上调基因富集于染色体端粒区(如CTSS)、NK细胞介导的细胞毒性等通路;下调基因(如ENTPD1)则与TLR信号通路、泛素化降解显著相关。

枢纽基因鉴定

PPI网络揭示CTSS、DOK2和ENTPD1构成关键模块:

免疫机制解析

CD8+T细胞在患者中显著减少(p<0.05),且与CTSS(r=-0.32)、ENTPD1(r=-0.28)呈负相关,与DOK2(r=0.35)正相关,提示Th1/Th2免疫失衡。

诊断效能验证

GSE38481中ENTPD1诊断AUC最高(0.718),三基因联合诊断效能超越单基因(AUC提升12.3%-17.3%)。

分子机制探讨

CTSS:通过p38MAPK-CX3CL1轴激活微胶质细胞,导致突触过度修剪

DOK2:负调控Ras-RAF-MAPK和PI3K-Akt通路,异常时导致髓鞘发育缺陷

ENTPD1:eATP-P2×7R通路紊乱引发炎症小体过度激活,造成认知损伤

这项研究首次建立外周血三基因诊断模型,其价值体现在:1)突破现有诊断主观性局限;2)揭示免疫-神经互作新机制;3)为开发靶向CTSS/DOK2的抑制剂(如CatS抑制剂Irie O,2008)提供理论依据。未来需扩大样本验证,并探索这些靶点与抗精神病药物的协同效应。

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