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为解决驱动特定分泌表型的基因表达状态未知问题，研究人员开展 SEC-seq 技术研究。结果表明该技术能将单细胞基因表达与分泌量关联。这有助于深入理解细胞分泌调控，为开发更好的细胞疗法提供思路，值得科研读者一读。
摘要
细胞会向周围环境分泌大量蛋白质及其他生物分子，以实现关键功能，从与其他细胞通讯到阻断病原体的活动。细胞因子、生长因子、细胞外囊泡，甚至重组生物药物的分泌，决定了许多细胞疗法的治疗效力。然而，驱动特定分泌表型的基因表达状态在很大程度上仍不明确。我们提供了一种实验方案，能够将由寡核苷酸条形码编码的目标蛋白（SEC）的分泌量与数千个单细胞的转录测序（seq）联系起来。SEC-seq 技术利用名为纳米小瓶的微型水凝胶颗粒来分离细胞，并在细胞附近捕获其分泌产物，使用寡核苷酸标记的抗体对纳米小瓶上的分泌产物进行标记，然后通过流式细胞术和单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）平台进行检测。纳米小瓶上的细胞可以根据活力、分泌量或其他表面标记进行分选，且无需固定或透化处理，含有细胞和分泌产物的纳米小瓶可直接被引入油包水微流控液滴乳液中，用于对细胞转录组和分泌产物进行单细胞条形码标记。我们利用 SEC-seq 技术，将 T 细胞受体序列与相关细胞因子的相对分泌量联系起来，将表面标记基因表达与间充质基质细胞中具有高分泌能力和潜在再生能力的细胞群联系起来，还将转录组与浆细胞的高免疫球蛋白分泌联系起来。纳米小瓶的修饰和细胞加载过程耗时不到 4 小时，一旦达到所需的孵育时间，染色、细胞分选以及用于 scRNA-seq 的乳液制备也可在 4 小时内完成。与将分泌产物与细胞表面联系起来的相关技术相比，SEC-seq 由于生物素化纳米小瓶易于修饰，为任何分泌靶点提供了通用解决方案。通过将基因表达与分泌强度联系起来，SEC-seq 技术能够拓展我们对细胞分泌的理解，包括细胞分泌的调控机制，以及如何通过工程改造细胞分泌来开发更有效的疗法。
