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为解决荧光显微镜颜色通道有限制约生物样本空间分析的问题,研究人员开展 cycleHCR 技术研究。结果显示其可实现 RNA 和蛋白质多重成像。该研究为深层组织空间调控研究及诊断提供新方法,值得一读。
摘要
长期以来,荧光显微镜中有限的颜色通道一直制约着生物样本的空间分析。在此,我们介绍循环杂交链式反应(cycle Hybridization Chain Reaction,cycleHCR),这是一种将多轮 DNA 条形码技术与杂交链式反应相结合的方法,以克服这一限制。cycleHCR 能够利用统一的条形码系统对 RNA 和蛋白质进行高度多重成像。全胚胎转录组成像在约 310μm 的样本深度范围内实现了精确的三维基因表达和细胞命运图谱绘制。当与扩展显微镜技术相结合时,cycleHCR 揭示了小鼠胚胎成纤维细胞中由 10 种亚细胞结构组成的复杂网络。在小鼠海马体切片中,多重 RNA 和蛋白质成像揭示了复杂的基因表达梯度和细胞类型特异性的核结构变化。cycleHCR 为阐明深层组织环境中的空间调控提供了一个定量框架,可用于研究以及潜在的诊断应用。