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为探究 AtKC1 抑制 AKT1 的机制,来自多单位(含复旦大学、西湖大学等)的研究人员开展相关研究,解析出相关结构,明确 I - 结构域作用。该研究对理解植物钾离子通道调控、提高作物产量意义重大,值得科研人员一读。
在植物的生长发育过程中,钾离子(
)就像植物身体里的 “能量小助手”,对植物的健康起着至关重要的作用。在拟南芥(一种常用的植物研究模式生物)中,有两个 “厉害角色”——AKT1(拟南芥
转运体 1)和 HAK5(高亲和力
转运体 5),它们是植物吸收钾离子的主要 “通道”,对于植物在低钾环境下的生存有着关键意义。
AKT1 是一种 Shaker 样、超极化激活的
通道,它的结构十分复杂,就像一座精心建造的 “离子运输大厦”,由电压感应结构域(VSD)、孔道结构域(PD)以及包括 C - 连接子、环核苷酸结合同源结构域(CNBHD)、锚蛋白重复结构域(ANK 结构域)和 KHA 结构域等多个部分组成。而且,AKT1 的活性可不是自己 “说了算”,它除了受到磷酸化的调控,还会被一个 “同伴” AtKC1 影响。AtKC1 能通过与 AKT1 形成异源二聚体来调控它的活性,不过这其中的具体机制一直是个 “谜”。
之前有研究发现,AtKC1 上一个单点突变(G315D)会让它失去抑制 AKT1 激活的能力,但没人知道这是为什么。虽然已经有研究解析出了 AKT1 以及 AKT1 - AtKC1 复合物的结构,但 AtKC1 抑制 AKT1 的详细机制依旧没有完全弄清楚。为了解开这些谜团,来自复旦大学、西湖大学、北京大学等单位的研究人员在《PLANT COMMUNICATIONS》期刊上发表了一篇名为《AtKC1 inhibits AKT1 activation via its amino - terminal inhibitory domain》的论文。他们通过研究,终于找到了一些关键线索,为我们揭开了这个神秘机制的面纱。
研究人员为了深入探究 AtKC1 抑制 AKT1 的机制,使用了几个关键的技术方法。首先是冷冻电镜技术,这就像是给分子拍 “高清照片”,能让研究人员看到 AKT1、AKT1 - AtKC1 以及 AKT1 - AtKC1 (G315D) 这些蛋白质分子的精细结构。还有电生理学分析方法,它可以测量细胞在不同情况下的电流变化,帮助研究人员了解离子通道的活性。
下面我们来看看研究的具体结果:
1. AKT1、AKT1 - AtKC1 和 AKT1 - AtKC1 (G315D) 的冷冻电镜结构
研究人员利用冷冻电镜技术,成功解析出了 AKT1、AKT1 - AtKC1 和 AKT1 - AtKC1 (G315D) 的结构,分辨率分别达到了 2.7 ?、2.8 ?。这些结构展示了它们的跨膜结构域、细胞质 C - 连接子和 CNBHD 结构域,和之前报道的类似。而且,AKT1 和 AtKC1 都呈现出非结构域交换的构象,它们的电压感应结构域处于去极化状态,孔道也是关闭的。
2. AtKC1 的抑制结构域(I - 结构域)
通过对比 AKT1 和 AKT1 - AtKC1 的结构,研究人员发现了 AtKC1 上一个很重要的区域 —— 抑制结构域(I - 结构域,由 53 - 80 位氨基酸残基组成)。这个 I - 结构域就像一把 “钥匙”,正好插入到 AKT1 的一个 “小口袋” 里,这个 “小口袋” 是由 AKT1 的 S1、S4、S4 - S5 连接子以及相邻亚基的 C - 连接子围成的。I - 结构域与周围的结构元件形成了大量的疏水和极性相互作用,就像用很多 “小钩子” 把自己固定在那里。而且,I - 结构域和相邻 AKT1 的 C - 连接子相互作用,还会让 C - 连接子发生旋转,这种变化很可能就是 AtKC1 抑制 AKT1 的关键,它能让通道复合物稳定在关闭状态。
3. I - 结构域抑制作用的验证
为了验证 I - 结构域的抑制作用,研究人员设计了一系列突变体进行电生理学分析。他们先去掉 AtKC1 的 I - 结构域,得到 AtKC1 -
I,然后把它和 AKT1 一起在卵母细胞(一种常用于研究离子通道的细胞模型)中表达。结果发现,产生的电流比野生型 AtKC1 和 AKT1 一起表达时大得多,相对电导率(
)也朝着去极化方向移动。接着,他们把 I - 结构域里的三个疏水氨基酸(62AFG64)突变成亲水的谷氨酰胺(QQQ),得到 AtKC1 - QQQ,和 AKT1 共表达时电流也有所增加,不过增加的幅度比去掉 I - 结构域时小。这说明 I - 结构域对 AKT1 电流有很强的抑制作用,去掉它或者改变它里面关键氨基酸,都会减弱这种抑制。
反过来,研究人员把 AKT1 的 N 端区域(1 - 51 位氨基酸残基)换成 AtKC1 的 N 端(1 - 80 位氨基酸残基,包括 I - 结构域),得到 AKT1 - I,这时电流大幅减小,
朝着超极化方向移动。把 AKT1 - I 里的 62AFG64 也突变成 QQQ 得到 AKT1 - I - QQQ,这种抑制作用也没有完全消失,只是比 AKT1 - I 稍微减弱了一些。这进一步证明了 I - 结构域的抑制作用很强,而且多个 I - 结构域的共同作用效果更明显。
4. G315D 突变对 AtKC1 抑制作用的影响
之前研究说 AtKC1 上的 G315D 突变会让它失去抑制 AKT1 的能力,研究人员发现这个突变很神奇,它改变了 AKT1 - AtKC1 复合物的化学计量比,从 2:2 变成了 3:1。D315 位于 S6 跨膜片段中间,它的位置不太 “舒服”,朝向疏水的脂质双层,这可能会影响磷脂(一种对通道激活很重要的物质)的结合。虽然对比三种结构发现磷脂结合没有太大差异,但 AKT1 - AtKC1 (G315D) 中 D315 附近脂质尾端的密度比其他两种结构稍微弱一些。研究人员推测,就是因为 D315 这个不太好的位置,让两个 AtKC1 亚基没办法都进入通道复合物,所以 AKT1 - AtKC1 (G315D) 结构里只有一个 I - 结构域。而且,研究人员通过实验发现,有三个 I - 结构域的 AKT1 - I - AtKC1 (G315D) -
I 对通道激活的抑制作用和有四个 I - 结构域的 AKT1 - I 类似。
最后,我们来总结一下研究的结论和意义。这项研究揭示了 AtKC1 通过其 N 端的 I - 结构域抑制 AKT1 的激活机制。I - 结构域就像一个 “分子开关”,通过与 AKT1 上多个关键结构元件相互作用,稳定通道的关闭状态,从而抑制 AKT1 的活性。而且,I - 结构域的数量对抑制效果有很大影响,两个对角位置的 I - 结构域协同作用,比单个 I - 结构域的抑制效果强很多。这一发现不仅让我们对植物中钾离子通道的调控机制有了更深入的了解,还为研究其他类似的离子通道,比如人类的 Kv10 - 12、CNG 和 HCN 通道,提供了重要的参考。
从实际应用角度来看,AKT1 和 AtKC1 在植物耐受低钾和盐胁迫方面起着关键作用。了解它们的调控机制,就有可能为提高农作物产量提供新的策略。比如,科学家可以根据这些知识,通过基因工程手段优化植物中钾离子通道的功能,让农作物在低钾或者盐碱等恶劣环境下也能更好地生长,吸收足够的钾离子,从而提高农作物的产量和质量,这对农业生产有着非常重要的意义。