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为明确台湾地区鸽子 A 群轮状病毒（pRVA）的存在情况并解析其基因组特征，屏东科技大学研究人员开展相关研究。他们从 2018 年样本中检测到 pRVA，明确其基因型。该研究对疫病防控意义重大，值得科研人员一读。
在禽鸟类的世界里，有一种病毒正悄然影响着它们的健康，这就是轮状病毒（Rotavirus）。轮状病毒属于呼肠孤病毒科（Reoviridae）轮状病毒属（Rotavirus），它有着独特的结构，11 节段的线性双链 RNA 基因组被包裹在三层衣壳内。在禽类中，轮状病毒可是个 “麻烦制造者”，它是具有重要经济意义的新兴病原体，无论是家禽还是野生鸟类都深受其害。它能引发多种疾病，像火鸡肠炎综合征、雏鸡生长迟缓综合征等，给养殖业带来了巨大的经济损失。这不仅是因为患病禽类的死亡率上升，更重要的是，这些病毒会让禽类的饲料吸收能力下降，导致养殖场的生产效率大打折扣 。
不过，在鸽子这个群体中，轮状病毒的相关信息却十分有限。2016 年，澳大利亚出现了一场鸽子疾病的爆发，患病鸽子出现呕吐和腹泻的症状，和幼鸽疾病综合征（YPDS）很相似，而且发病率和死亡率高达 45%。经过研究发现，原来是一种新型的 A 群轮状病毒在作祟，它还和鸽子的肝坏死有关。此前，人们一直认为鸽子圆环病毒（PiCV）是 YPDS 的关键致病因素，但随着鸽子相关 A 群轮状病毒（pRVA）基因型 G18P [17] 的发现，以及相关实验证明其能引发 YPDS，PiCV 在 YPDS 病因中的地位就被削弱了。此后，pRVA 在德国、比利时、丹麦等多个国家的鸽子中被检测到，鸽子养殖者和兽医们都对它高度警惕。
台湾的鸽子养殖规模很大，尤其是赛鸽产业，据估算，其市场价值高达约 700 亿新台币（约 22 亿美元）。在这样的背景下，pRVA 对台湾鸽子养殖业的潜在威胁不容忽视。然而，此前却没有研究证实 pRVA 在台湾的存在。为了填补这一空白，了解 pRVA 在台湾的情况，屏东科技大学的研究人员在《Scientific Reports》期刊上发表了题为 “First detection and whole genome characterization of pigeon Rotavirus A genotype G18-P [17]-I4-R4-C4-M4-A4-N4-T4-E19-H4 in Taiwan” 的论文。研究人员通过一系列研究，最终成功检测、分离并对台湾本地的 pRVA 进行了全基因组特征分析。这一研究成果意义重大，它不仅明确了 pRVA 在台湾的存在，还为后续相关疾病的诊断和治疗提供了重要依据。
在这项研究中，研究人员主要运用了以下几种关键技术方法：一是 PCR 检测技术，通过针对轮状病毒基因组非组特异性 NSP4 片段和 VP6 片段的 PCR 检测，来判断样本中是否存在 pRVA；二是病毒分离技术，利用阳性样本在多种细胞系中进行病毒分离培养；三是测序技术，对分离得到的病毒进行全基因组测序，并通过与 GenBank 数据库中的序列比对和系统发育分析，来确定病毒的基因型和进化关系。
下面来看看具体的研究结果。在样本检测方面，研究人员总共检测了 225 个样本，这些样本大多是 2020 年和 2021 年收集的肝脏样本，主要来自屏东县被淘汰的赛鸽。经过检测，只有一个 2018 年来自屏东县的肝脏样本呈阳性，这只鸽子生前患有衣原体性鸟疫，还出现了类似 YPDS 的呕吐和绿色腹泻症状。
在病毒确认与特征分析上，通过对 VP6 基因的测序，发现该病毒与其他公开的 pRVA 序列有很高的核苷酸同一性，尤其是和中国及美国的序列。研究人员利用 MARC-145 细胞系成功拯救并繁殖了病毒，观察到感染细胞出现了明显的细胞病变效应，细胞变圆或呈纺锤形，最终脱落死亡。通过透射电子显微镜，还观察到了病毒粒子，其平均直径为 81.28（±6.01）nm。
对病毒全基因组测序后发现，该病毒的 11 个基因片段与中国和美国的一些毒株最为匹配。根据国际病毒分类委员会轮状病毒分类工作组的分类系统，这一本地分离株被归类为 G18-P [17]-I4-R4-C4-M4-A4-N4-T4-E19-H4 基因型，与澳大利亚、德国和美国之前报道的鸽子感染病例一致，被命名为 RVA/pigeon-tc/TWN/NPUST-001/2018/G18P [17]（简称 NPUST-001）。
从系统发育分析结果来看，基于 VP6 基因序列的分析表明，NPUST-001 属于基因型 I4，且与中国和美国的一些序列属于同一独特谱系。对 VP7 和 VP4 基因的分析发现，NPUST-001 与高毒力菌株的亲缘关系更近，虽然其 VP4 和 VP7 核苷酸序列与高毒力菌株的同源性较低，但系统发育分析显示它与高毒力菌株聚为一类。
研究结论和讨论部分，这次研究首次在台湾检测到、分离并全基因组表征了 pRVA 基因型 G18-P [17]-I4-R4-C4-M4-A4-N4-T4-E19-H4，这大大扩展了这种病毒在地理和时间上的分布范围。通过比较分析，发现台湾分离株与美国和中国大陆之前报道的序列有很高的同一性，在 VP6 片段的系统发育分析中形成了一个独特的谱系。虽然只检测到一个阳性病例，但这一发现对诊断和治疗类似 “经典” YPDS 或其他 pRVA 感染症状的病例具有重要的指导意义。
此外，研究还发现了一些有趣的现象。比如，基于 VP6 基因序列的分析揭示了在台湾、中国大陆和美国存在一个独特的鸽子轮状病毒谱系，这表明该病毒可能存在持续的传播和演化过程。通过与其他地区毒株的比较，推测这种病毒的传播可能涉及跨海峡和洲际传播，但具体情况还需要更多研究来证实。对于 pRVA 的 VP4 和 VP7 蛋白，虽然目前还不能完全确定它们的毒力作用，但研究结果显示 NPUST-001 在系统发育上与高毒力菌株的关系，这为进一步研究病毒的致病机制提供了方向。
总的来说，这项研究为台湾鸽子轮状病毒的研究奠定了重要基础。未来，持续的监测，尤其是对疑似病例的监测至关重要。这不仅有助于更全面地了解 pRVA 在台湾的流行病学情况，还能及时发现病毒的变化，为鸽子养殖业的健康发展保驾护航，避免 pRVA 对鸽子造成更大的危害，保障养殖者的经济利益。
