揭秘 hnRNPC:助力病毒复制与制衡干扰素反应的 “双面手”

【字体: 时间:2025年02月25日 来源:Veterinary Research 3.7

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  为解决 hnRNPC 在病毒感染中作用机制不明的问题,研究人员开展其与病毒及宿主免疫关系的研究。结果发现 hnRNPC 促进 SVCV 复制且抑制 I 型 IFN 反应。该研究揭示新机制,为抗病毒研究提供重要参考,值得科研读者一读。

  
在人体的微观世界里,一场看不见的战争时刻都在上演,那就是病毒与人体免疫系统的对抗。其中,干扰素(IFN)系统作为人体先天免疫的重要防线,就像忠诚的卫士一样,在抵抗病毒入侵的战斗中发挥着关键作用。当病毒来袭,像 Toll - 样、NOD - 样和 RIG - I 样受体(RLRs)这些 “侦察兵” 就会识别病毒相关分子模式(PAMP),随后激活一系列信号通路,诱导 I 型干扰素(IFN)和干扰素刺激基因(ISGs)表达,从而抑制病毒复制 。

然而,这个看似精密的防御系统,背后却隐藏着复杂的调控机制。I 型干扰素的产生受到众多因素的严格控制,比如 TBK1、IRF3 激活的介质(MITA)、IRF3 和 IRF7 等。这些因素之间相互作用,形成了一个错综复杂的网络。而且,这个网络中还有很多未知等待我们去探索,就像神秘的宝藏等待着勇敢的探险家去挖掘一样。目前,虽然已经知道一些宿主因子和病毒因子会在翻译后水平调节 MITA - TBK1 - IRF3/IRF7 轴,但仍有许多调控因子尚未被发现。

与此同时,一类被称为异质核核糖核蛋白(hnRNPs)的物质,也逐渐进入了科学家们的视野。它们是高等真核生物中含量最为丰富的核蛋白,在 RNA 转录、前体 mRNA 剪接和翻译等过程中发挥着重要作用。而且,研究发现 hnRNPs 家族中的一些成员参与了病毒感染过程。有的能促进病毒复制,像 hnRNPA1、hnRNPA2 等;有的则起到抑制作用,例如 hnRNPE1 和 hnRNPE2 。但 hnRNPs 家族成员众多,有大约 20 个成员,它们在抗病毒先天免疫中的具体作用机制还存在很多争议,就像一团迷雾笼罩着这个研究领域。

其中,hnRNPC 作为一种 RNA 结合蛋白,在 RNA 转录和剪接中不可或缺。虽然已经有证据表明它参与了多种病毒感染的调控,如流感病毒、脊髓灰质炎病毒、登革热病毒等,但它调控病毒感染的具体机制却一直没有完全弄清楚。这就好比我们知道它在病毒感染这场大戏中扮演着重要角色,但它具体是怎么表演的,我们却还没有看清。

为了揭开这些谜团,来自相关研究机构的研究人员在《Veterinary Research》期刊上发表了一篇名为 “Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C promotes spring viraemia of carp virus replication by suppressing the type I interferon response” 的论文。研究人员通过一系列实验,得出了重要结论:hnRNPC 能够促进鲤春病毒血症病毒(SVCV)的复制,它主要通过抑制由 MITA 激活的 IFN 产生,同时增加病毒蛋白的可用性来实现这一过程。这一发现揭示了脊椎动物中 hnRNP 家族成员控制 IFN 介导的抗病毒反应的进化保守机制,为我们理解病毒与宿主之间的相互作用提供了新的视角,就像在黑暗中点亮了一盏明灯。

在这项研究中,研究人员用到了几个主要关键的技术方法。他们利用定量实时 PCR(qRT - PCR)技术,检测相关基因的表达水平变化,就像是给基因表达装上了一个 “监测器”;通过蛋白质免疫印迹(Western blotting)技术,分析蛋白质的表达和修饰情况,让蛋白质的 “秘密” 无处遁形;运用免疫共沉淀(Co - immunoprecipitation)技术,探究蛋白质之间的相互作用,帮助找到蛋白质之间的 “伙伴关系”;还使用了荧光素酶报告基因活性测定(Luciferase promoter activity assay)技术,来评估基因启动子的活性,从而了解相关基因的调控机制。

下面我们来看看具体的研究结果:

  1. HnRNPC 在进化上保守,可被 SVCV 和 IFN 诱导:研究人员对不同脊椎动物(包括斑马鱼、小鼠和人类)的 hnRNPC 基因进行了共线性分析,发现 hnRNPC 基因在进化过程中,其基因组组织和基因共线性都高度保守。在构建的系统发育树中,斑马鱼 hnRNPC 与小鼠和人类的 hnRNPC 相聚在同一分支。而且,斑马鱼和人类 hnRNPC 基因的结构也很相似。此外,研究人员用 SVCV 感染斑马鱼细胞系,发现感染后 6、12 和 24 小时,hnRNPC 的表达显著增加,48 小时后又回到基础水平。用重组 IFNφ1 和 IFNφ4 蛋白刺激 DrFIN 细胞,也能显著诱导 hnRNPC 表达。这一系列实验表明,hnRNPC 参与了抗病毒反应,就像是免疫系统在面对病毒入侵时发出的 “动员令”。
  2. HnRNPC 促进病毒复制:研究人员通过过表达 hnRNPC,发现 SVCV 的 N 和 G 基因表达显著增加,细胞病变效应和病毒滴度也明显高于对照组。接着,他们使用针对 hnRNPC 的小干扰 RNA(siRNAs)进行实验,发现抑制 hnRNPC 表达后,SVCV 的 N 和 G 蛋白表达显著降低。这就说明 hnRNPC 在 DrFIN 细胞中起到了促进 SVCV 复制的作用,仿佛是病毒的 “帮凶”。
  3. HnRNPC 通过抑制 K48 连接的多聚泛素化增加 SVCV 磷蛋白(SVCV - P)的稳定性:研究人员运用免疫共沉淀方法,发现 GFP - hnRNPC 能与 SVCV 的 N、P 和 M 蛋白免疫共沉淀,其中与 SVCV - P 的结合亲和力最高。进一步研究发现,hnRNPC 与 SVCV - P 的相互作用不依赖 RNA。通过构建多种质粒进行实验,确定了 SVCV - P 的 101 - 187aa 区域与 hnRNPC 的 RRM 和 C 末端结构域结合。而且,hnRNPC 能以剂量依赖的方式增加 SVCV - P 的蛋白水平。研究人员还发现,hnRNPC 显著抑制 SVCV - P 的 K48 连接的泛素化,但对 K63 连接的泛素化没有影响,这表明 hnRNPC 通过抑制 K48 连接的泛素化来稳定 SVCV - P,就像给 SVCV - P 穿上了一层 “保护衣”。
  4. HnRNPC 抑制 SVCV 和聚肌胞(poly(I:C))诱导的 IFN 启动子活性:基因启动子驱动的报告基因实验表明,SVCV 感染能激活 ifnφ1 和 ISRE 的启动子,但 hnRNPC 会显著削弱这种激活作用。在聚肌胞转染实验中,hnRNPC 也表现出类似的抑制启动子活性的能力。此外,研究人员还发现,hnRNPC 会降低 IFN 反应相关基因(如 ifn1、mx 和 isg15)的转录水平。这说明 hnRNPC 对 I 型干扰素的产生起到了负调控作用,就像是给干扰素的产生踩了 “刹车”。
  5. HnRNPC 抑制 RLR 信号通路诱导的 IFN 启动子活性:研究人员过表达 hnRNPC 和 RLR 信号通路中的 RIG - I、MAVS、MITA、TBK1、IRF3 或 IRF7 等因子,发现 RLR 因子的过表达能显著增强 ifnφ1 和 ISRE 启动子的活性,但这种激活会被 hnRNPC 抑制。这进一步证明了 hnRNPC 对由 RLR 通路介导的 ifn 和 isg 基因激活的转录具有负调控作用,就像在 RLR 信号通路中设置了一道 “关卡”。
  6. hnRNPC 与 RLR 因子的相互作用触发 MITA 降解:免疫共沉淀实验显示,hnRNPC 能与 RIG - I、MITA、TBK1、IRF3 和 IRF7 结合,但不与 MAVS 结合。在 EPC 细胞中过表达 hnRNPC 会降低 MITA 的蛋白水平,共聚焦显微镜观察发现这种降解发生在细胞质中。而且,在人类细胞中进行的实验也表明,hnRNPC 对 IFN 反应的抑制作用是保守的。这表明 hnRNPC 与 RLR 因子相互作用,诱导了 MITA 的降解,MITA 就像是被 hnRNPC “盯上” 的目标。
  7. HnRNPC 通过蛋白酶体途径介导 MITA 降解:研究人员通过构建多种质粒进行实验,发现 MITA 的 C 末端结构域与 hnRNPC 的 C 末端结构域结合。过表达 hnRNPC 的 C 末端结构域(Flag - hnRNPC<sub>C</sub>)会降低 MITA 蛋白水平,抑制 ifnφ1pro 和 ISRE 的启动子活性,减少 IFN 相关基因的转录。用蛋白酶体抑制剂 MG132 处理转染细胞后,hnRNPC 介导的 MITA 降解能得到显著恢复,而自噬抑制剂 3 - MA 和溶酶体抑制剂 CQ 则没有这种效果。这说明蛋白酶体途径主要负责 hnRNPC 诱导的 MITA 降解,就像是蛋白酶体途径成为了 hnRNPC 降解 MITA 的 “帮凶”。
  8. HnRNPC 增强 MITA 的 K48 连接的多聚泛素化:研究发现 hnRNPC 参与了 GFP - MITA 的泛素化过程,且这种泛素化依赖于 hnRNPC 的结构域。hnRNPC 过表达会显著促进 MITA 的 K48 连接的泛素化,但不影响 K63 连接的泛素化,而且 hnRNPC 还会增强 MITA C 末端结构域(MITA<sub>C</sub>)的 K48 连接的泛素化。这表明 hnRNPC 通过催化 MITA<sub>C</sub>结构域的 K48 连接的泛素化,导致 MITA 通过蛋白酶体途径降解,就像给 MITA 的降解找到了一条 “快速通道”。

综合这些研究结果,我们可以看到,hnRNPC 在病毒感染过程中扮演着双重角色。一方面,它通过抑制 SVCV - P 的 K48 连接的泛素化,增加其稳定性,从而促进病毒复制;另一方面,它作为 I 型干扰素产生的负调控因子,靶向 MITA,导致 MITA 发生 K48 连接的泛素化和蛋白降解,抑制干扰素的产生。这一发现揭示了 hnRNPC 在调节 IFN 反应和抗病毒免疫中的重要作用,为我们理解病毒与宿主之间的相互作用提供了新的分子机制。它就像一把钥匙,为我们打开了探索病毒感染和宿主免疫反应的新大门,也为开发抗病毒疗法和疫苗提供了有价值的信息,让我们在对抗病毒的道路上又前进了一大步。

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