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为探究 hnRNPC 在病毒感染中的作用机制,研究人员开展 hnRNPC 与病毒及宿主免疫关系的研究。结果发现 hnRNPC 促进病毒复制且抑制 I 型 IFN 反应。该研究揭示新机制,为抗病毒疗法和疫苗开发提供思路,值得科研读者一读。
在我们的身体里,有一支时刻保卫着我们健康的 “免疫大军”,干扰素(IFN)系统就是其中非常重要的一部分。它就像免疫系统的 “先遣部队”,在宿主抵抗病毒病原体的战斗中发挥着关键作用。当病毒入侵时,模式识别受体(PRRs)会像 “侦察兵” 一样,迅速识别出病毒相关的分子模式(PAMP),进而激活干扰素系统。其中,RIG-I 样受体(RLRs)能敏锐地感知到病毒 RNA,随后一系列复杂的信号传导就开始啦,最终会诱导 I 型干扰素(IFN)和干扰素刺激基因(ISGs)的表达,这些物质就像 “武器” 一样,能够抑制病毒的复制 。
不过,I 型干扰素的产生可不是随随便便的,它受到很多因素的严格调控,就像一个精密的仪器。其中,MITA - TBK1 - IRF3/IRF7 这条信号轴对于干扰素基因的转录至关重要,而且它在翻译后水平还会被宿主和病毒的多种因素调节。比如,有些宿主因子会像 “捣乱分子” 一样,通过影响 MITA 等关键分子,来调控干扰素的产生,但是这个调控网络非常复杂,还有很多未知的 “谜题” 等待我们去解开。
与此同时,在细胞的世界里,有一种叫做异质核核糖核蛋白(hnRNPs)的物质。它们是高等真核生物细胞核中数量众多且功能多样的蛋白质,在 RNA 的转录、剪接和翻译等过程中都扮演着重要角色。hnRNP 家族大约有 20 个成员,它们在病毒感染过程中也有着不同的表现,有些成员会帮助病毒复制,有些则可能起到抑制作用,就像一群 “立场不一” 的分子。
hnRNPC 作为 hnRNP 家族的一员,是一种 RNA 结合蛋白,对 RNA 的转录和剪接至关重要。越来越多的证据表明,它参与了多种病毒感染的调节过程,比如流感病毒、脊髓灰质炎病毒、登革热病毒等。然而,hnRNPC 调节病毒感染的具体机制却一直是个 “谜团”,这让科学家们十分好奇。
为了揭开这些神秘的面纱,来自 作者[第一作者单位] 的研究人员进行了深入的探索。他们的研究成果发表在《Journal of Virology》期刊上,论文题目是 “Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C promotes virus replication by suppressing the type I interferon response”。研究人员发现,hnRNPC 就像一个 “双面间谍”,它既能够促进病毒复制,又能抑制 I 型干扰素的产生,在调节干扰素反应和抗病毒免疫方面发挥着重要作用,这一发现为我们理解宿主和病毒之间的相互作用提供了新的视角。
在这项研究中,研究人员运用了多种技术方法来探索真相。他们通过病毒感染实验,用感染了鲤春病毒血症病毒(SVCV)的细胞,来观察相关基因的表达变化;利用定量实时荧光定量 PCR(qRT-PCR)技术,准确检测基因的表达水平;采用蛋白质免疫印迹(Western blotting)和免疫共沉淀(Co - immunoprecipitation assay)实验,研究蛋白质之间的相互作用;还进行了荧光素酶报告基因活性检测(Luciferase promoter activity assay),来分析基因启动子的活性。这些技术就像研究人员手中的 “魔法工具”,帮助他们一步步揭开谜团。
下面让我们来看看研究人员都发现了什么有趣的结果吧。
HnRNPC 在进化上保守,可被 SVCV 和 IFN 诱导
研究人员想知道 hnRNPC 基因在不同脊椎动物中的保守性,于是他们进行了共线性分析。结果发现,hnRNPC 基因的基因组组织和基因共线性在进化过程中保存得相当好。在斑马鱼、小鼠和人类中,hnRNPC 基因都和一些特定的基因紧密相连。而且,通过构建系统发育树和序列比对,也进一步证实了 hnRNPC 蛋白的高度保守性。
不仅如此,研究人员还发现,当斑马鱼的细胞系感染 SVCV 后,hnRNPC 的表达会发生显著变化。在感染后的 6 小时、12 小时和 24 小时,hnRNPC 的表达量明显增加,就像细胞在发出 “警报” 一样,不过到了 48 小时又会回到基础水平。有趣的是,当用重组的 IFNφ1 和 IFNφ4 蛋白刺激细胞时,也能显著诱导 hnRNPC 的表达。这一系列结果强烈暗示着 hnRNPC 参与了抗病毒反应,就像是细胞抗病毒防御体系中的一员 “大将”。
HnRNPC 促进病毒复制
接下来,研究人员想看看 hnRNPC 对病毒复制有什么影响。他们让 hnRNPC 基因在细胞中过量表达,结果发现,SVCV 的 N 和 G 基因的表达明显增加,细胞的病变效应(CPEs)也更加明显,培养介质中的病毒滴度也显著提高,这说明病毒在细胞中的复制变得更加活跃了。
为了进一步验证,研究人员又使用了小干扰 RNA(siRNA)来降低 hnRNPC 的表达。他们发现,当 hnRNPC 的表达被抑制后,SVCV 的 N 和 G 蛋白的表达也随之减少。这一增一减的实验结果清楚地表明,hnRNPC 在 DrFIN 细胞中能够促进 SVCV 的复制,它就像是病毒的 “帮凶”,帮助病毒在细胞中大量繁殖。
HnRNPC 通过抑制 K48 连接的多聚泛素化增加 SVCV 磷蛋白(SVCV - P)的稳定性
那么,hnRNPC 是如何促进病毒复制的呢?研究人员通过免疫共沉淀实验发现,hnRNPC 能够与 SVCV 的 N、P、M 蛋白相互作用,其中与 SVCV - P 的结合亲和力最高。而且,他们还发现这种相互作用并不依赖 RNA,即使细胞裂解物经过 RNA 酶处理,hnRNPC 与 SVCV - P 的结合也不受影响。
研究人员进一步构建了多种质粒,通过免疫共沉淀实验确定了 SVCV - P 与 hnRNPC 相互作用的结构域。他们发现,SVCV - P 的 101 - 187 aa 区域能够与 hnRNPC 的 RRM 和 C 末端结构域结合。同时,他们还观察到,随着 GFP - hnRNPC 剂量的增加,SVCV - P 的蛋白水平也稳步上升,这表明 hnRNPC 可能促进了 SVCV - P 的积累。
由于泛素化在调节蛋白质降解中起着重要作用,研究人员推测 hnRNPC 可能通过影响泛素 - 蛋白酶体途径来抑制 SVCV - P 的降解。实验结果证实了他们的猜测,hnRNPC 能够显著抑制 SVCV - P 的 K48 连接的泛素化,而对 K63 连接的泛素化没有影响,这说明 hnRNPC 通过抑制 K48 连接的泛素化来稳定 SVCV - P,为病毒复制提供了更多的 “原料”。
HnRNPC 抑制 SVCV 和聚肌胞(poly(I:C))诱导的 IFN 启动子活性
既然 hnRNPC 能被 IFN 诱导,还能促进病毒复制,那么它是否参与了 IFN 产生的调节呢?研究人员通过基因启动子驱动的报告基因检测实验发现,SVCV 感染能够激活 ifnφ1 和 ISRE 的启动子,但是当 hnRNPC 存在时,这种激活作用会受到显著抑制。同样,在聚肌胞(poly(I:C))转染实验中,hnRNPC 也表现出了抑制启动子活性的能力。
不仅如此,研究人员还检测了 IFN 反应相关基因的转录水平,发现 ifn1、mx 和 isg15 等基因的转录水平在 hnRNPC 存在时降低了。这些结果表明,hnRNPC 就像一个 “刹车”,能够负向调节 I 型干扰素的产生,阻止干扰素系统过度激活。
HnRNPC 抑制 RLR 信号通路诱导的 IFN 启动子活性
为了更深入了解 hnRNPC 在 RLR 介导的 IFN 表达中的作用,研究人员让 hnRNPC 与 RIG - I、MAVS、MITA、TBK1、IRF3 或 IRF7 等因子同时过量表达,然后检测 ifnφ1 和 ISRE 启动子的活性。结果发现,RLR 因子的过量表达能够显著增强启动子活性,但是 hnRNPC 的存在却能抑制这种增强作用。这说明 hnRNPC 在 RLR 信号通路中起到了负向调节的作用,进一步证明了它是调节 IFN 和 ISG 基因激活的 “关键人物”。
HnRNPC 与 RLR 因子的相互作用触发 MITA 降解
蛋白质的翻译后修饰会影响蛋白质的稳定性和降解,而这通常涉及蛋白质之间的物理接触。研究人员通过免疫共沉淀实验发现,hnRNPC 能够与 RIG - I、MITA、TBK1、IRF3 和 IRF7 结合,但不与 MAVS 结合。而且,当 hnRNPC 在 EPC 细胞中过量表达时,MITA 的蛋白水平会下降,通过共聚焦显微镜观察发现,这种降解发生在细胞质中。
研究人员还发现,在人类细胞中,hnRNPC 也能与 MITA 形成蛋白复合物,并且过量表达 hnRNPC 会降低 MITA 的蛋白水平,同时抑制 IFNβ 和 ISRE 的启动子活性。这一系列结果表明,hnRNPC 与 RLR 因子相互作用,能够诱导 MITA 的降解,而且这种抑制 IFN 反应的作用在进化上是保守的。
HnRNPC 通过蛋白酶体途径介导 MITA 降解
那么,hnRNPC 的哪个结构域与 MITA 的相互作用至关重要呢?研究人员通过构建不同的质粒进行免疫共沉淀实验,发现 MITA 能够与 hnRNPC 的 C 末端结构域(Flag - hnRNPC<sub>C</sub>)结合,而不与 RRM 结构域(Flag - hnRNPC<sub>RRM</sub>)结合。而且,只有 Flag - hnRNPC<sub>C</sub>的过量表达能够降低 MITA 的蛋白水平,抑制 ifnφ1pro 和 ISRE 的启动子活性,减少 IFN 相关基因的转录。
为了确定介导 hnRNPC 诱导 MITA 降解的信号通路,研究人员用蛋白酶体抑制剂 MG132、自噬抑制剂 3 - MA 和溶酶体抑制剂 CQ 处理转染的细胞。结果发现,MG132 能够剂量依赖性地挽救 hnRNPC 介导的 MITA 降解,而 3 - MA 和 CQ 则没有这种效果。这表明,蛋白酶体途径主要负责 hnRNPC 诱导的 MITA 降解,就像一把 “剪刀”,剪断了 MITA 这个 “关键链条”。
HnRNPC 增强 MITA 的 K48 连接的多聚泛素化
最后,研究人员想弄清楚 hnRNPC 降解 MITA 的具体机制。他们发现,hnRNPC 能够参与 GFP - MITA 的泛素化过程,而且这种泛素化依赖于 hnRNPC 的结构域。进一步研究发现,hnRNPC 过量表达能够显著促进 MITA 的 K48 连接的泛素化,而对 K63 连接的泛素化没有影响。此外,hnRNPC 还能增强 MITA C 末端结构域(MITA<sub>C</sub>)的 K48 连接的泛素化。这说明 hnRNPC 通过催化 MITA<sub>C</sub>结构域的 K48 连接的泛素化,导致 MITA 通过蛋白酶体途径降解。
综合这些研究结果,我们可以看到,hnRNPC 在宿主与病毒的 “战争” 中扮演着复杂而重要的角色。它一方面抑制 SVCV - P 的 K48 连接的泛素化,增加其稳定性,从而促进病毒复制;另一方面,它作为 I 型干扰素产生的负调节因子,靶向 MITA,导致 MITA 发生 K48 连接的泛素化和蛋白降解,抑制干扰素反应。这一发现揭示了 hnRNPC 通过蛋白质翻译后修饰调节病毒复制的新机制,为我们理解宿主抗病毒免疫反应提供了新的思路,也为开发抗病毒疗法和疫苗提供了有价值的信息。就像找到了一把新的 “钥匙”,或许能帮助我们打开攻克病毒感染难题的大门,为人类健康带来新的希望。