揭开辐射性肝损伤 “密码”:m?A 修饰如何左右细胞凋亡命运?

【字体: 时间:2025年02月25日 来源:Cell Death & Disease 8.1

编辑推荐:

  为解决 RILI 发病机制未明的问题,枣庄学院研究人员开展了 m?A 修饰在 RILI 中作用的研究。结果发现 METTL3 介导的 MEG3 的 m?A 修饰参与调控 RILI。这为理解 RILI 发病机制提供新视角,极具科研价值,推荐科研读者阅读。

  
在癌症治疗的战场上,放疗是一把双刃剑。当它对准上半身或其他部位的肿瘤时,健康的肝组织却可能 “躺枪”,受到电离辐射(IR)的攻击,进而引发辐射诱导的肝损伤(RILI)。这可不是个小问题,很多患者在放疗后,肝脏会出现各种状况,像非黄疸性肝肿大、腹水等,这些病症通常在放疗后的 2 周到 3 个月内就会冒出来。而且,放疗剂量和 RILI 的发生几率紧密相关,当剂量从最低有效剂量 30Gy 增加到 40Gy 时,RILI 的发生几率从 5% 飙升到了 50% 以上;要是剂量达到 60Gy,76% 的肝癌患者最终会因急性肝衰竭而病情恶化。可尴尬的是,到现在为止,RILI 的发病机制还没有完全搞清楚,这就好比医生在战场上拿着一把没校准准星的枪,想要有效预防和治疗 RILI,却无从下手。

同时,科学家们知道 RILI 的发生和细胞凋亡、氧化应激以及纤维化脱不了干系,尤其是细胞凋亡,在 RILI 发生的早期就开始 “搞事情”。还有一种神秘的化学修饰 ——N? - 甲基腺苷(m?A),它在真核细胞的长链非编码 RNA(lncRNA)上很常见,能像一个神奇的开关一样,调控各种生物过程。之前也有研究发现 m?A 和细胞凋亡关系密切,但在 RILI 这个特殊的场景里,m?A 到底扮演着什么角色,是不是参与调控了 RILI 相关的细胞凋亡,这些问题就像一团迷雾,亟待科学家们去揭开谜底。

为了弄清楚这些问题,来自枣庄学院的研究人员在《Cell Death & Disease》期刊上发表了一篇名为 “METTL3-mediated m?A modification of lncRNA MEG3 promotes radiation-induced liver injury via regulating miR-20b/BNIP2 axis” 的论文。他们经过一系列研究发现,METTL3(甲基转移酶样 3)活性对 IR 的响应在 IR 诱导的细胞凋亡中发挥着作用,它通过依赖 YTHDC1(m?A 阅读蛋白)的 MEG3(一种长链非编码 RNA)的 m?A 修饰,逆转了 miR - 20b(一种微小 RNA)对 BNIP2(Bcl - 2 同源结构域蛋白 2)表达的抑制。这个发现就像是在黑暗中找到了一盏明灯,为理解 RILI 的发病机制提供了新的方向,也为未来预防和治疗 RILI 带来了新的希望。

在研究过程中,研究人员用到了几个关键技术方法。首先是定量实时 PCR 分析,这个技术就像是一个精准的 “探测器”,可以检测 RNA 的含量变化,帮助研究人员了解基因表达水平。其次是甲基化 RNA 免疫沉淀定量 PCR(MeRIP - qPCR)分析,它能像 “寻宝器” 一样,找到发生 m?A 修饰的 RNA,确定 m?A 修饰水平。还有 RNA 免疫沉淀(RIP)实验,能验证蛋白和 RNA 之间的相互作用,看看它们是不是真的 “手拉手” 一起工作。另外,RNA 衰减实验可以评估 RNA 的稳定性,就像测试一件物品能 “扛” 多久一样,观察 RNA 在不同条件下的变化情况。

下面我们来详细看看研究结果。

YTHDC1 相关的 m?A 甲基化蛋白和 MEG3 相关分子与细胞凋亡的关系:研究人员预测 MEG3 和 YTHDC1 之间可能存在相互作用,而且 MEG3 还可能和 miR - 20b、BNIP2 存在关联。通过实验观察发现,在 BNL CL2 细胞受到辐射后,METTL3 和 YTHDC1 在 2 小时的时候表达上调,而 MEG3 则在之后的时间里表达下调,miR - 20b 在 2 小时时表达上调,BNIP2 的 mRNA 和蛋白水平在 24 小时内降低。基于这些发现,研究人员选择了辐射后 2 小时这个时间点进行后续更深入的研究。这就好比是在时间轴上找到了一个关键的 “节点”,准备从这里开始深挖背后的秘密。

YTHDC1 对辐射损伤后 BNL CL2 细胞活力和凋亡的影响:研究人员分析了辐射后不同时间 YTHDC1 的水平变化,发现它在 24 小时的时候升高,48 小时的时候又明显下降。通过流式细胞术、细胞计数试剂盒 - 8(CCK - 8)实验和 MeRIP 实验进一步研究发现,敲低 YTHDC1 会增加细胞凋亡,降低细胞活力,还会让 MEG3 的甲基化水平下降。这表明 YTHDC1 对细胞活力和凋亡的调控可能和 MEG3 的甲基化有关,就像它们之间存在着一条看不见的 “纽带”。

MEG3 对辐射损伤后 BNL CL2 细胞活力和凋亡的影响:研究人员让 MEG3 在细胞中过量表达,结果发现这会增加细胞凋亡的比例,降低细胞活力。Hoechst 染色也证实了 MEG3 过表达的细胞在辐射后凋亡率更高。这说明 MEG3 就像一个 “促凋亡开关”,一旦开启,就会让细胞更容易走向凋亡,降低细胞的生存能力。

METTL3 介导的 MEG3 的 m?A 甲基化对辐射诱导的肝细胞损伤的影响:研究人员先用预测工具找到了 MEG3 的甲基化修饰位点,以及它和 YTHDC1 的结合位点。然后通过实验敲低 METTL3,发现 MEG3 的水平升高了,m?A 修饰水平下降了。而且在辐射后 2 小时,MEG3 的甲基化修饰水平会增加。这表明 METTL3 介导的 m?A 修饰会促使 MEG3 降解,在肝细胞受到辐射损伤时发挥着重要作用,就像是 METTL3 拿着一把 “剪刀”,可以剪断 MEG3,影响细胞的命运。

METTL3 通过依赖 YTHDC1 控制 m?A 修饰的 MEG3 表达来调节辐射诱导的肝细胞损伤:研究人员通过实验发现,敲低 YTHDC1 会让 MEG3 的表达上调,而且 YTHDC1 可以促进 MEG3 的降解。在敲低 METTL3 的细胞中,YTHDC1 对 MEG3 的沉淀作用会减弱,而过表达 YTHDC1 则会逆转敲低 METTL3 导致的 MEG3 上调。这一系列实验结果表明,METTL3 介导的 m?A 甲基化会在辐射诱导的肝细胞损伤中,以 YTHDC1 依赖的方式促进 MEG3 的降解,它们之间的关系就像一个精密的 “齿轮系统”,相互配合,共同影响着细胞的变化。

MEG3 通过靶向 miR - 20b 上调 BNIP2,影响辐射相关损伤:研究人员预测并验证了 MEG3 可以吸附 miR - 20b,就像一块 “海绵” 一样,把 miR - 20b “吸” 过来。当 MEG3 表达变化时,miR - 20b 和 BNIP2 的表达也会跟着变化。MEG3 能够逆转 miR - 20b 对 BNIP2 的抑制作用,说明 MEG3 可以通过调节 miR - 20b 和 BNIP2 的关系,来影响 BNL CL2 细胞受到辐射损伤的程度,这为理解细胞辐射损伤的调控机制又打开了一扇新的窗户。

miR - 20b 通过靶向 BNIP2 减轻辐射诱导的 BNL CL2 细胞损伤:研究人员发现 miR - 20b 可以直接靶向 BNIP2,抑制 BNIP2 的表达。当 miR - 20b 受到抑制时,BNIP2 的表达会增加,细胞的辐射敏感性也会增加,凋亡率上升。这表明 miR - 20b 就像一个 “保护罩”,通过靶向 BNIP2 来减轻细胞受到的辐射损伤,维持细胞的正常功能。

YTHDC1 识别 m?A 修饰的 MEG3 对体内 RILI 发病机制的影响:研究人员在小鼠身上进行实验,敲低 YTHDC1 后发现,小鼠肝脏中 MEG3 的甲基化水平、METTL3 和 YTHDC1 的蛋白水平都下降了。辐射后,miR - 20b 的水平降低,MEG3 和 BNIP2 的表达变化在不同处理组中有差异。而且,敲低 YTHDC1 会让肝细胞凋亡增加,肝脏的病理变化也更明显。这说明 YTHDC1 可以通过调节小鼠肝脏组织中 MEG3 的表达,来影响 RILI 的发病机制,就像是在小鼠体内操控着一个 “发病开关”,决定着 RILI 的发展。

在讨论部分,研究人员总结了整个研究的重要发现。他们发现 m?A 修饰和 IR 诱导的细胞凋亡死亡之间存在正相关关系,METTL3 介导的 MEG3 的 m?A 修饰在 RILI 的发病过程中起着关键作用。MEG3 作为 m?A 修饰的重要靶点,通过和 YTHDC1、miR - 20b、BNIP2 之间的相互作用,影响着细胞的凋亡和 RILI 的发生。这一研究为理解 RILI 的发病机制提供了全新的视角,让我们对 RILI 有了更深入的认识。

不过,研究人员也指出,目前的研究只是一个开始。虽然发现了 YTHDC1 在这个过程中的重要作用,但还有其他 m?A 阅读蛋白的功能有待研究。而且,像 METTL14、WTAP、FTO 和 ALKBH5 这些 m?A 的调节因子,它们在 RILI 中的作用也还不清楚。此外,除了 MEG3,可能还有其他 “隐藏的选手” 参与了 METTL3 介导的调控通路。未来还需要更多的研究来进一步探索这些未知领域,就像在一片神秘的森林里,虽然找到了一条小路,但还有更多的秘密等待我们去发现。这个研究成果为后续的研究指明了方向,也为攻克 RILI 这个难题奠定了坚实的基础,相信在科学家们的不断努力下,未来一定能找到更好的方法来预防和治疗 RILI,为癌症患者带来更多的希望。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号