ISS1-seq:开启水稻单链 DNA 研究新篇,解锁基因组奥秘

【字体: 时间:2025年02月26日 来源:TRENDS IN Plant Science 17.3

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  为解决植物 ssDNA 全面特征分析方法不足的问题,研究人员开展 ISS1-seq 技术用于水稻 ssDNA 图谱绘制的研究。结果显示该技术取得重大进展。推荐阅读,助您了解植物 ssDNA 研究新突破,把握前沿科研动态。

  
单链 DNA(ssDNA)的形成对于各种以 DNA 为模板的生命活动的执行至关重要。目前,已有多种方法用于在人类和小鼠基因组范围内对单链 DNA 进行特征分析,例如染色质免疫沉淀测序((Ch)IP-seq)、SSiNGLe-P1、高锰酸盐 / S1 核酸酶足迹分析、S1-END-seq、KAS/Opti-KAS-seq 等;相比之下,在拟南芥(Arabidopsis thaliana)单链 DNA 图谱绘制中,仅核酸酶 I 处理结合二代测序(NBS-seq)得到了应用。每种方法都有其优缺点,因此,开发更多互补技术对植物单链 DNA 进行全面特征分析很有必要。最近,第一作者单位的研究人员开发了原位 S1 测序(ISS1-seq,in situ S1-seq)技术用于水稻单链 DNA 图谱绘制,这是在全面了解单链 DNA 在基因组中的生物学功能方面取得的重大进展。

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