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为明确 RET 致病性变异的功能影响及致病机制,研究人员以携带 RET 变异的细胞系为对象开展研究。结果发现部分变异影响细胞增殖和迁移,且表型有差异。该研究强调功能检测的重要性,值得科研读者一读。
先天性巨结肠症(HSCR)具有广泛的遗传异质性,72% 的病例涉及 10 个基因的致病性变异,这些基因构成了对肠神经系统(ENS)发育至关重要的基因调控网络(GRN)。受体酪氨酸激酶基因RET是最为关键的致病基因,根据不同表型,12%-50% 的患者携带有该基因的变异。RET在 ENS 前体的增殖和迁移过程中发挥着关键作用,这些过程出现缺陷会导致 HSCR。然而,RET致病性变异的功能影响及其致病机制仍未完全明晰。
为解决这一问题,第一作者单位的研究人员对一种依赖RET的神经嵴来源细胞系进行了研究,该细胞系携带 5 种错义(c.166C>A [p.Leu56Met];c.532G>C [p.Glu178Gln];c.2372A>T [p.Tyr791Phe];c.2765C>A [p.Ser922Tyr];或 c.2994T>A [p.Phe998Leu])或 3 种无义(c.612C>A、c.2308C>T 或 c.2943C>G)杂合致病性RET变异中的一种。研究人员利用基于互补 DNA(cDNA)和 CRISPR 的引导反向插入机制工程(PRIME)编辑技术,结合定量增殖和迁移实验,观察到 3 种错义变异(c.612C>A [p.Tyr204?];c.2308C>T [p.Arg770?];和 c.2943C>G [p.Tyr981?])和所有无义变异均导致细胞增殖和迁移能力显著下降。值得注意的是,致病性存在争议的错义变异 c.2372A>T(p.Tyr791Phe)似乎表现为良性。重要的是,迁移能力下降的严重程度与增殖缺陷并不总是相关,而且无义变异的表型严重程度与其在 RET 蛋白中的位置无关。
该研究强调,准确评估 HSCR 相关变异的致病性需要进行针对性的功能检测,而不能仅仅依赖生物信息学预测,生物信息学预测可通过纳入功能数据加以完善。