性激素相关基因表达特征助力睾丸生殖细胞肿瘤精准诊疗

【字体: 时间:2025年02月27日 来源:Basic and Clinical Andrology 2.4

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  为探究性激素相关基因在睾丸生殖细胞肿瘤(TGCT)中的作用,研究人员分析相关数据库样本,发现激素簇 1 或 3 是不良预后因素,为精准治疗提供依据。

  睾丸生殖细胞肿瘤(Testicular Germ Cell Tumor,TGCT)是 20 - 40 岁男性中最常见的癌症,如同潜藏在身体里的 “定时炸弹”,严重威胁着男性健康。它主要分为精原细胞瘤(Seminomatous Germ Cell Tumors,SGCT)和非精原细胞瘤(Non - seminomatous Germ Cell Tumors,NSGCT)两种亚型。目前,虽然经典的组织病理学特征在预测 TGCT 复发方面起着关键作用,但仍存在诸多未解之谜。比如,促性腺激素失调被认为在 TGCT 的发生中可能扮演重要角色,然而具体的分子机制并不明确。同时,不同亚型的 TGCT 在性激素调节、合成和代谢方面的差异也有待深入探究,这对于开发更精准有效的治疗策略至关重要。
在此背景下,为了深入剖析性激素相关基因在 TGCT 中的奥秘,研究人员开展了一项极具意义的研究。研究成果为 TGCT 的诊疗提供了新的方向,有望推动该领域的进一步发展,相关论文发表在BMC Cancer期刊上。

在本次研究中,研究人员运用了多种先进的生物信息分析技术。他们从两个公开数据库(TCGA 和 GSE99420)获取数据,这些数据包含了大量的肿瘤样本信息,为后续分析提供了丰富的素材。随后,利用 R 语言进行生物信息和统计分析及可视化处理,对数据进行深度挖掘。同时,借助 ComBat 算法校正数据中的批次效应,以确保分析结果的准确性。此外,通过多种免疫反卷积算法评估肿瘤样本中的非恶性细胞含量,运用 GSVA 算法计算单样本基因集富集分析得分,还采用了 RIDGE 线性回归模型预测抗癌药物反应等。

研究结果如下:

  1. 性激素相关基因表达差异:对比 NSGCT 和精原细胞瘤,发现编码类固醇生物合成关键调节因子的POMC基因,以及参与性激素代谢(HSD17B1HSD17B2SRD5A1)和运输(SHBG)的基因在 NSGCT 中显著上调;而编码睾酮 - 双氢睾酮转化酶的SRD5A3基因在精原细胞瘤中上调。通过共表达分析还发现,参与类固醇生成、性激素合成、运输和分解代谢的一系列基因存在高度共调节关系,这表明睾丸癌具备完整的类固醇性激素代谢合成和调节机制。
  2. 聚类分析确定激素簇:通过硬阈值正则化 KMEANS 聚类方法,研究人员将癌症样本分为四个激素簇。激素簇 1 主要由 NSGCT(混合和畸胎瘤亚型)组成,其特征是垂体激素PRLGNRH1,性激素失活酶编码基因HSD17B2以及睾酮 - 双氢睾酮转化酶编码基因SRD5A1高表达;激素簇 2 大多是精原细胞瘤,SRD5A3高表达;激素簇 3 为 NSGCT(混合组织学、胚胎癌、卵黄囊瘤),CGA促性腺激素亚基以及参与雌激素和雌二醇合成与相互转化的基因(CYP19A1HSD17B12HSD17B1)和激素结合运输相关的SHBG高表达;激素簇 4 主要是 NSGCT(胚胎癌、混合组织学、卵黄囊瘤)伴有少量精原细胞瘤,参与类固醇和睾酮生物合成的基因(STARPOMCCYP11A1CYP17A1HSD3B2HSD17B3)表达增加。
  3. 临床和病理特征差异:不同激素簇患者的临床和病理特征存在明显差异。激素簇 2 和 3 患者的无进展生存期分别为最佳和最差,激素簇 1 患者处于中高风险,激素簇 4 患者为低中风险。在多参数建模中,S2/S3 肿瘤标志物状态、激素簇 1 或 3 以及畸胎瘤组织学与约 25 - 30% 的进展风险增加相关。
  4. 基因表达和信号通路差异:免疫反卷积和相关分析表明,激素簇 1 和 3 的成纤维细胞水平较高,激素簇 2 则被大量 T 和 B 细胞浸润。基因集变异分析显示,各激素簇的 Reactome 通路基因特征得分存在显著差异。激素簇 1 和 3 的细胞外基质(ECM)和生长因子信号相关基因特征得分较高;激素簇 2 在抗原加工、炎症信号、细胞凋亡和 DNA 修复方面表现突出;激素簇 3 的 FGFR/ERBB/PI3K/AKT、脂质代谢、类固醇激素和雌激素代谢相关特征明显;激素簇 4 主要涉及脂肪酸、核苷酸、糖和雄激素代谢,以及细胞周期、有丝分裂、RNA 周转、细胞凋亡和自噬等过程。此外,不同激素簇的转录调节子活性和信号通路也存在差异,如激素簇 1 和 3 的缺氧反应相关调节子活性较高,激素簇 4 的 EGFR 和雌激素信号通路被激活。
  5. 肿瘤微环境和代谢差异:激素簇 1 和 3 存在广泛的成纤维细胞浸润和 ECM 沉积,而激素簇 2 的基质相关基因表达较少。代谢途径分析发现,激素簇 1 和 3 的氧化糖代谢受抑制,且多个与类固醇代谢相关的反应在不同激素簇中受到显著调节。
  6. 蛋白表达和药物反应差异:蛋白质分析显示,不同激素簇的蛋白表达存在差异。激素簇 1 和 3 中,SRC 和 YAP 的磷酸化形式以及 EGFR 和 ERBB2 等促癌信号相关蛋白上调;激素簇 2 中,KIT 癌基因蛋白以及参与 DNA 修复和细胞凋亡的蛋白增加;激素簇 4 中,缺氧反应负调节因子 VHL、蛋白酶抑制剂 SEPRINE1 和黏附分子 E - cadherin 在蛋白水平上特异性上调。药物反应预测表明,激素簇 1 和 3 对干扰 DNA 合成、细胞骨架和细胞周期以及表观遗传学的药物具有抗性,但对酪氨酸激酶抑制剂(TKI)敏感;激素簇 2 和 4 则对干扰 DNA 合成等药物敏感,激素簇 2 对细胞凋亡调节剂反应最佳。

在结论与讨论部分,研究人员确定了 TGCT 的四个激素亚群,并发现它们在蛋白质和代谢分析中存在显著差异,且对药物的反应也不同,这对于治疗耐药性睾丸癌具有重要的临床意义。此外,研究还揭示了 NSGCT 和精原细胞瘤之间的差异,进一步明确了激素簇 1 或 3 与疾病进展风险的关联。同时,研究人员也指出了研究的局限性,如 TCGA 数据集分析中激素亚群分配方法的局限性。总体而言,该研究为 TGCT 的精准诊疗提供了新的视角和潜在的治疗靶点,未来有望基于激素簇开展更具针对性的个性化治疗,为患者带来新的希望。
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