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为解决椎间盘退变(IVDD)缺乏精准治疗方案的问题,海军军医大学附属长海医院的研究人员开展了 IVDD 分子分型的研究,构建了精准分层系统,发现吉非替尼对退变软骨细胞有保护作用,为 IVDD 个性化治疗提供新方向。
椎间盘退变(Intervertebral disc degeneration,IVDD)听起来有些陌生,但它引发的腰痛却折磨着无数人。随着老龄化社会的到来,IVDD 的发病率逐渐上升,成为全球致残的主要原因之一。想象一下,许多人因为腰痛无法正常工作,不仅降低了劳动生产力,还给公共卫生带来了沉重负担。目前,IVDD 的治疗手段十分有限,保守治疗对轻度患者效果尚可,严重时则需要手术,但手术存在并发症多、费用高的问题,且约 30% 的患者术后仍会腰痛。更糟糕的是,临床上缺乏有效的分子分类和精准治疗方法,医生难以准确判断病情和制定个性化治疗方案。因此,寻找新的治疗策略迫在眉睫。
为了攻克这一难题,海军军医大学附属长海医院的研究人员挺身而出。他们开展了一项极具创新性的研究,旨在为 IVDD 的治疗开辟新道路。最终,他们成功构建了基于软骨细胞分化的 IVDD 分子分型模型(Chondrocyte differentiation based IVDD classification,CDBIVDDC),并发现吉非替尼(Gefitinib)对退变软骨细胞具有保护作用,这一成果为 IVDD 的个性化治疗带来了新希望。
在研究过程中,研究人员运用了多种先进技术方法。首先,从公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)获取单细胞测序数据和临床信息,这是研究的基础数据来源。接着,利用单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)技术对数据进行深入分析,识别细胞类型和基因表达特征。之后,通过主成分分析(Principal component analysis,PCA)构建分子分型模型,并使用免疫组化(Immunohistochemistry,IHC)技术对临床样本进行检测,验证分子分型的临床意义。最后,开展细胞实验,观察药物对退变软骨细胞的作用。
下面来详细看看研究结果:
- 细胞类型注释与分析:对两个纤维环(Annulus fibrosus,AF)样本的 scRNA-seq 数据进行严格筛选和质量控制(Quality control,QC)后,获得 27,001 个符合要求的细胞。经无监督 UMAP 聚类分析,准确识别出 6 种细胞类型,其中软骨细胞数量最多。进一步分析发现,软骨细胞中 Sox9 高表达,其在软骨细胞的生成、生长和成熟过程中发挥重要作用。同时,研究人员还对细胞间通讯网络和配体 - 受体对进行研究,发现 uPAR 通路、整合素细胞表面相互作用等与软骨细胞的炎症反应、细胞外基质(Extracellular matrix,ECM)相互作用及 IVDD 进展相关。
- 软骨细胞谱系特征:对 25,974 个软骨细胞进行 UMAP 降维分析,鉴定出 3 个主要细胞亚群。不同亚群中,如 II 型胶原基因(col2a1)、软骨连接蛋白(chad)等基因表达存在差异,这些基因与软骨细胞的功能和信号转导密切相关。通过 iTALK 细胞通讯分析,还确定了各亚群内潜在的配体 - 受体对,揭示了细胞间的通讯机制。
- 软骨细胞分化轨迹与相关基因:运用 Monocle2 软件研究软骨细胞分化轨迹,确定了 3 个软骨细胞亚群的分化顺序。发现软骨细胞 3 可能具有干细胞样特征,软骨细胞 2 分化程度相对较高。通过比较不同细胞命运分支的差异表达基因(Differential expression gene,DEG),发现早期 Pdpn、Pnrc2 和 Stmn1 等基因表达升高,晚期 Eno1 和 Pla2g2a 等基因显著高表达,这些基因在细胞分化和 IVDD 进展中发挥重要作用。
- 整合软骨细胞分化与预后相关基因:利用 DDRTress 算法鉴定出 1,058 个与软骨细胞分化轨迹相关的基因(Chondrocyte differentiation-related genes,CDGs),经单因素回归分析和 Venn 图交叉分析,得到 44 个与分化和预后相关的基因(Chondrocyte differentiation and prognosis related genes,CDPRGs)。这些基因与 IVDD 的严重程度和 Thompson 分级显著相关,如 Adcyap1 和 Pthlh 基因表达与较低的退变程度和 Thompson 分级相关,而 Mia 和 Tuba1c 基因则相反。
- 构建 CDBIVDDC:通过非参数检验和 Pearson 相关性分析建立 CDPRGs 的共表达调控网络,发现这些基因在软骨细胞分化过程中存在显著共表达。运用 ConsensusClusterPlus 算法进行一致性聚类分析,将 IVDD 分为 3 个亚型(Cluster 1、Cluster 2 和 Cluster 3 )。经分析,Cluster 2 中 CDPRGs 表达较高,且该组患者退变程度更严重,Thompson 分级更高,预后最差;Cluster 1 则相反,预后最好;Cluster 3 介于两者之间。根据软骨细胞评分和 CDPRGs 表达,将 3 个亚型分别命名为高软骨细胞评分分类(High chondrocyte scoring classification,HCSC)、低软骨细胞评分分类(Low chondrocyte scoring classification,LCSC)和中软骨细胞评分分类(Medium chondrocyte scoring classification,MCSC) ,并确定了各亚型的关键标记基因。
- 临床样本的 IHC 分析:对 60 例 IVDD 患者的临床标本进行 IHC 染色,根据 6 种标记蛋白的表达情况将样本分为 HCSC、LCSC 和 MCSC 三组。单因素分析表明,年龄、性别、Pfirrmann 分级等因素与 Oswestry 残疾指数(Oswestry disability index,ODI)评分显著相关,LCSC 组患者 ODI 评分更高,Pfirrmann 分级也更高,提示其临床症状更严重,预后更差,这进一步验证了 CDBIVDDC 的临床意义。
- 小分子靶向药物的预测与体外实验:利用 pRRophetic 软件预测各亚型对不同小分子靶向药物的敏感性,发现 LCSC 对吉非替尼敏感。体外实验中,与对照组相比,IL - 1β 刺激的软骨细胞增殖活性下降,而添加吉非替尼后,细胞增殖能力增强,形态得到恢复,COL2 和 SOX9 基因表达增加,MMP13 基因表达减少,表明吉非替尼可延缓软骨细胞退变。此外,吉非替尼还能调节 IVDD 分子分型标记基因的表达,促使 LCSC 向 HCSC 转化。
研究结论和讨论部分再次强调了这些发现的重要意义。该研究构建的 CDBIVDDC 能有效评估 IVDD 患者的病情严重程度,预测疾病预后,为临床医生进行风险评估和制定个性化治疗方案提供了有力工具。吉非替尼在体外实验中展现出的良好效果,为 IVDD 的治疗提供了新的潜在药物选择。不过,研究也存在一定局限性,如生物信息分析可能存在偏差,样本量有限,吉非替尼的临床应用还面临一些挑战等。但总体而言,这项研究为 IVDD 的诊断和治疗开辟了新方向,有望推动该领域的进一步发展,为广大 IVDD 患者带来新的希望。