葡萄属单倍型解析超泛基因组：解锁葡萄演化与抗病育种新密码

为探究葡萄杂交历史及抗病机制，研究人员对 72 个葡萄品种测序分析，明确演化关系并找到 63 个与霜霉病（DM）抗性相关 SV，助力葡萄育种。

　　葡萄（Vitis）是最古老的驯化水果作物之一，兼具重要的文化与经济价值。研究人员对全球 72 个葡萄品种进行了单倍型解析基因组的组装和注释，其中包括 25 个野生葡萄和 47 个栽培葡萄，新发布了 60 个葡萄品种的基因组。单倍型感知系统发育基因组学解开了葡萄神秘的杂交历史，揭示了葡萄属巨大的遗传多样性。泛基因组分析显示，更易患毁灭性疾病霜霉病（DM）的欧洲栽培品种，在编码 TIR-NBARC-LRR 结构域的 NLR 家族中，抗性基因的种类较少。通过对 113 个葡萄品种广泛的结构变异（SV）特征分析、表型分析、霜霉病感染转录组分析，以及 SV - 表达数量性状位点分析，研究人员鉴定出超过 63 个与霜霉病抗性显著相关的 SV 及其相关基因，赖氨酸 - 组氨酸转运蛋白VvLHT8就是一个例证。这个葡萄属单倍型解析超泛基因组将加速葡萄育种进程，并丰富人们对葡萄演化和生物学的理解。