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空军军医大学第一附属医院的研究人员为探究肾上腺弥漫大 B 细胞淋巴瘤(DLBCL)特征,分析相关 RNA 数据,定义新亚型,为 DLBCL 研究提供新依据。
在血液系统疾病的领域中,弥漫大 B 细胞淋巴瘤(Diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)是一种常见的非霍奇金淋巴瘤,约占所有非霍奇金淋巴瘤病例的 30 - 40%。它如同一个隐藏在身体里的 “捣乱分子”,发病率在全球范围内都不低,每年都有成千上万的新病例被确诊。DLBCL 会给患者带来诸多痛苦,比如淋巴结肿大、疲劳、盗汗、不明原因的体重下降和发热等,这些症状不仅严重影响患者的生活质量,还可能引发一系列并发症。
而且,DLBCL 还是个 “善变” 的疾病,作为一种具有高度异质性的遗传疾病,它存在着广泛的遗传异常,包括染色体重排、基因突变以及其他调节细胞生长和存活的信号通路改变。尽管目前针对 DLBCL 的治疗取得了一定进展,像化疗、免疫疗法(如利妥昔单抗)和放射疗法,甚至干细胞移植也能让部分患者受益,但这种疾病仍然存在许多未知等待探索。尤其是发生在肾上腺的 DLBCL,以往对它的研究并不深入,其具体特征和相关机制还是个 “谜团”。
为了揭开这个 “谜团”,空军军医大学第一附属医院的研究人员展开了深入研究。他们通过对 10 例来自肾上腺的 DLBCL 样本进行 RNA 测序,并整合分析来自多个器官的 DLBCL RNA 数据,试图定义肾上腺 DLBCL 的新亚型,并探索其分子特征。这项研究成果意义重大,不仅扩展了器官相关的 DLBCL 数据,还为肾上腺 DLBCL 的表达谱提供了新知识,就像是为研究人员在探索 DLBCL 的道路上点亮了一盏新的明灯。
在研究过程中,研究人员主要运用了以下关键技术方法:首先是 RNA 测序(RNAseq)技术,从样本中提取总 RNA 后进行测序,获取大量数据用于后续分析;接着利用生物信息学方法,对测序数据进行处理,如去除杂质、与参考基因组比对等;还借助公共 RNA 数据集(如 TCGA 数据库)获取更多数据进行补充分析;运用 xCell 软件包计算免疫细胞浸润评分,评估免疫微环境;使用基因集富集分析(GSEA)探究相关基因集在特定通路中的富集情况 。
研究人员的探索之旅收获了不少重要成果:
- 表达模式与免疫微环境差异:研究人员分析了 58 例 DLBCL 样本(48 例来自 TCGA 数据库,10 例来自研究中心),根据器官来源分为 16 个部位。计算所有样本间的相关性后,发现存在两种表达模式。进一步计算免疫评分和微环境评分,结果显示不同部位的整体免疫评分和微环境评分呈现异质性,这表明不同器官有着特异性的免疫微环境。
- 肾上腺样本中 NKT 细胞富集:研究人员深入计算每种细胞类型的免疫评分并聚类分析,发现自然杀伤 T 细胞(NKT 细胞)亚型在肾上腺样本中显著富集,而且肾上腺样本的 NKT 细胞评分明显高于其他部位。这一发现揭示了肾上腺 DLBCL 在免疫细胞浸润方面的独特之处。
- 肾上腺与淋巴结的潜在通路差异:在 TCGA 数据库中,淋巴结是 DLBCL 最常见的发病部位。研究人员选取 10 例肾上腺和 29 例淋巴结样本进行差异基因分析,得到 24,782 个差异表达基因。基因集富集分析显示,经典的癌症通路,如程序性死亡蛋白 1(PD - 1)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路和肽抗原结合通路,与肾上腺样本呈负相关。这为理解肾上腺 DLBCL 和淋巴结 DLBCL 的差异提供了重要线索。
- 肾上腺 DLBCL 的分子亚型:基于表达模式,研究人员将肾上腺样本重新聚类为两个簇。两个簇之间有 484 个差异表达基因,簇 1 中排名前十的富集基因大多是非编码 RNA,簇 2 中则主要是蛋白质编码基因。此外,两个簇在 CD4 记忆 T 细胞评分和增殖 B 细胞评分上存在差异,GSEA 分析还表明簇 2 中富集了 KRAS 通路等经典癌症通路。这进一步细化了对肾上腺 DLBCL 分子特征的认识。
综合研究结论和讨论部分,这次研究意义非凡。研究人员通过对肾上腺 DLBCL 的深入探究,明确了其特殊的表达模式,成功定义了新的分子亚型。这不仅丰富了人们对肾上腺 DLBCL 的认知,还为后续研究提供了新的方向。NKT 细胞在肾上腺 DLBCL 中的重要作用,以及肿瘤微环境(TME)对 DLBCL 发病机制的影响,都为开发针对 DLBCL 的新疗法提供了潜在靶点。而且,研究中发现的不同分子亚型与特定通路的关联,有助于未来实现对 DLBCL 患者的精准治疗,让治疗更有针对性,提高患者的治疗效果和生活质量。总之,这项研究为 DLBCL 的研究和治疗开辟了新的道路,带来了新的希望。