男性肝癌复发的转录组学探秘：关键分子改变与潜在治疗靶点

为探究男性肝细胞癌（HCC）复发机制，研究人员重新分析数据，发现 MYC 靶点基因集等关键改变，助力治疗。

　　肝癌是全球第六大常见肿瘤，也是癌症死亡的第三大主要原因。肝细胞癌（HCC）占原发性肝癌病例的 75 - 85%。手术切除是治疗 HCC 的常用方法，但肿瘤切除后复发率极高。HCC 手术切除后的复发率≥10%，5 年后可达 70 - 80%。由于复发性 HCC 通常侵袭性强，对根治性切除反应不佳，因此复发性 HCC 患者的生存率极低。HCC 复发是 HCC 相关死亡的主要原因之一，此外，缺乏有效的复发性 HCC 治疗方法也是一大难题。众所周知，男性患 HCC 的几率比女性高 2 - 3 倍。而且，HCC 在男性中的死亡率排名第二，在女性中排名第六。符合米兰标准的男性比符合标准的女性更有可能接受肝移植。目前，性别医学发展尚不完善，因此需要更多关于性别的研究来探究 HCC 发病机制。通过识别男性患者复发性 HCC 相关的分子改变，这项研究有望为目前尚无有效疗法的复发性 HCC 开发高效治疗方法。

癌症转录组学是对整套转录本进行综合分析，以获得差异表达基因、识别改变的生物学通路、体细胞突变、融合转录本、可变剪接事件，并描述肿瘤组织中的免疫微环境。已有充分证据表明，在癌症治疗方案中受益于转录组分析可提高精准肿瘤学的水平。此外，许多研究尝试通过转录组分析来解读 HCC 复发与分子改变之间的联系。特别是本研究的数据基础，此前已有分析，并且 HERC5、EP400、TIA1 和金属硫蛋白基因被报道可用于预测 HCC 复发。然而，这些研究中，复发性 HCC 中失调的通路、体细胞突变、融合转录本、可变剪接事件和免疫微环境的意义仍未明确。识别这些与复发相关的分子改变，不仅有助于理解复发生物学机制，还对开发癌症疫苗、T 细胞疗法和小分子抑制剂等靶向疗法有重要意义。因此，在本研究中，研究人员重新分析了之前发表的数据，以识别复发性 HCC 中失调的通路、体细胞突变、融合转录本、可变剪接事件和免疫微环境。

数据从 NCBI 基因表达综合数据库（GSE56545；https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE56545）下载。这些数据来自 21 名患有晚期 HCC 的男性肝移植患者。在这 21 名患者中，9 名被诊断为复发性 HCC，12 名在肝移植 24 个月后未复发 HCC，即无肿瘤。患者年龄在 41 岁至 67 岁之间，这与 Xue 等人之前的研究一致。

对计数数据进行方差稳定变换，以获得可能具有同方差性的值矩阵。利用这个在均值范围内具有稳定方差的矩阵，进行主成分分析（PCA）。由于 PCA 可以降低转录组数据集的维度、提高可解释性并最大限度减少信息损失，因此它是一种广泛接受的简化包含高维度的转录组数据集的方法。

在本研究中，研究人员通过比较复发性和非复发性 HCC 男性患者的 RNA 测序数据，解读了转录组水平上复发性 HCC 特异性的分子改变。最重要的发现如下：1）MYC 靶点基因集在复发性 HCC 中富集；2）MYC 靶点（包括 CBX3、NOP56、CDK4、NPM1、MCM5、MCM4 和 PA2G4）的表达上调与不良生存率相关；3）高置信度的有害突变显著......（原文此处未完整表述，根据已有内容翻译至此）。

作者无资金披露。

研究设计：O?uzhan Karaosmano?lu；
数据收集：O?uzhan Karaosmano?lu；
统计分析：O?uzhan Karaosmano?lu；
数据解读：O?uzhan Karaosmano?lu；
手稿撰写：O?uzhan Karaosmano?lu；
文献检索：O?uzhan Karaosmano?lu；
资金筹集：无。

作者在撰写本文时未使用任何人工智能辅助技术。

作者声明，他们没有已知的可能影响本文所报告工作的竞争性财务利益或个人关系。

作者感谢作为本文基础的原始数据的提供者。