新物种发现!泰国儿童唾液中分离出东方韦荣氏菌(Veillonella orientalis)

【字体: 时间:2025年02月28日 来源:Anaerobe 2.5

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  来自日本、泰国等多地研究人员为解决韦荣氏菌(Veillonella)属物种鉴定难题,研究发现新物种 Veillonella orientalis,增进对该属认知。

  韦荣氏菌(Veillonella)属目前有 19 个已确认的物种,隶属于韦荣氏菌科(Veillonellaceae),该属细菌是厌氧革兰氏阴性球菌,无鞭毛、芽孢和荚膜,细胞常成对或成短链状排列。部分韦荣氏菌能利用短链有机酸(如乳酸)作为能源,产生乙酸和丙酸等代谢终产物。其中,口腔韦荣氏菌是口腔微生物群的重要组成部分,其利用果糖的基因组途径的发现,加深了人们对口腔微生物代谢网络的理解。然而,韦荣氏菌属内物种的鉴定存在困难,传统的 16S rRNA 基因测序可靠性不足,目前常用看家基因(如 dnaK、gltA 和 rpoB)进行鉴别,也有研究采用多基因串联分析。
研究人员曾对 107 名泰国儿童唾液中的口腔韦荣氏菌物种分布和频率进行调查。从一名居住在泰国东部靠近泰国与柬埔寨边境的 11 岁健康男孩唾液中分离出菌株 S12025-13T,该菌株无法通过一步 PCR 法鉴定到种的水平,但使用韦荣氏菌属特异性引物能扩增出 PCR 产物。

对菌株 S12025-13T进行表型分析,其在脑心浸液血琼脂(BHI blood agar)上的菌落呈圆形、光滑、灰白色、不透明,直径约 0.5 - 2.0 毫米,无溶血圈;在含有碱性品红的韦荣氏菌琼脂(Veillonella agar)上培养时会发生脱色现象,这些特征与韦荣氏菌属其他物种的模式菌株相同。

综合表型、生化和基因组数据,能将菌株 S12025-13T与已报道的韦荣氏菌属物种的模式菌株区分开来。基于此,研究人员认为菌株 S12025-13T是韦荣氏菌属的一个新物种,命名为东方韦荣氏菌(Veillonella orientalis)。该新物种的模式菌株为 S12025-13T(JCM 33967T=CCUG 74596T),分离自泰国东部一名 11 岁健康儿童的唾液。该菌株的 16S rRNA、dnaK 和 rpoB 序列在 GenBank/EMBL/DDBJ 的登录号分别为 LC512485、LC514238 和 LC514237,其完整基因组序列和原始序列数据集的登录号分别为 AP022322 和 DRA009433。

此项研究得到了日本学术振兴会(JSPS)青年科学家资助、武田科学基金会、奥胡大学校长研究经费、2018 年泰国玛希隆大学牙科学院资助以及印度尼西亚大学 2022 年 PUTI Q1 项目的支持。研究人员声明不存在可能影响研究成果的利益冲突,并感谢廖育杰博士在系统发育树可视化方面的帮助。
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