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研究人员针对头颈鳞状细胞癌(HNSCC)开展 PI3Kα 抑制剂研究,发现 J-53,为后续药物研发提供信息。
头颈癌治疗新希望:新型 PI3Kα 抑制剂 J-53 的发现
在人体的微观世界里,癌症就像一场无情的战争,不断侵蚀着健康的机体。头颈癌(HNC)作为常见的恶性肿瘤之一,其中超过 90% 是头颈鳞状细胞癌(HNSCC)。它与吸烟、饮酒、嚼槟榔以及人乳头瘤病毒感染等多种因素相关,不仅严重影响患者的呼吸、吞咽和语言功能,还极大地降低了他们的生活质量。
目前,HNSCC 的治疗手段多种多样,手术、放疗、化疗是传统的 “主力军”,但手术难度高,会给患者的外貌和生理功能带来创伤;放疗和化疗虽能在短期内控制病情,却无法延长患者的带瘤生存期。随着医学的发展,靶向治疗和免疫治疗等新方法崭露头角。靶向治疗就像精准制导的导弹,瞄准肿瘤发生和发展相关的靶点,特异性地杀死肿瘤细胞,还能降低毒副作用。
在 HNSCC 的研究中,基因 PIK3CA 成为了关键的 “嫌疑犯”。研究发现,PIK3CA 在 HNSCC 肿瘤组织中高表达,还经常发生突变,进而导致磷酸肌醇 3 - 激酶 α(PI3Kα)过度激活,推动了 HNSCC 的发展。PI3Kα 所属的 PI3K/Akt/mTOR 信号通路,就像细胞内的一条 “高速公路”,与肿瘤的发生、发展紧密相连。
现有的 PI3Kα 抑制剂中,ATP 竞争性抑制剂如 Alpelisib 在治疗 HNSCC 时,虽然对携带 PIK3CA 突变的患者有一定疗效,但却会引发高血糖等副作用,这是因为在正常组织中,PI3K/Akt 信号通路对胰岛素依赖的葡萄糖摄取至关重要,抑制野生型 PI3Kα 信号会导致急性胰岛素抵抗,从而限制了其临床应用。变构 PI3Kα 抑制剂如 STX-478 则展现出了独特的优势,它能抑制 PI3Kα 热点突变肿瘤的生长,在治疗人 HNSCC 异种移植瘤时效果显著,还避免了代谢功能障碍等副作用。
为了找到更有效的 HNSCC 治疗药物,齐鲁师范学院等研究机构的研究人员踏上了探索之旅。他们的研究成果发表在《BMC Chemistry》上。
研究人员采用了一系列先进的技术方法。首先,利用计算机辅助药物设计(CADD)技术,这一技术结合了生物信息学、化学信息学和计算科学,就像一个智能的 “药物筛选工厂”,能加速药物发现的进程。其中,通过支架跳跃(scaffold hopping)策略对 STX-478 进行结构优化,希望找到突破专利保护的新型药物结构;运用分子对接(molecular docking)研究化合物与靶点的结合模式;借助分子动力学(molecular dynamics)模拟评估受体 - 配体结合的稳定性。此外,还利用 SuperPred 和 SwissTarget prediction 网络服务器进行靶点预测,通过 Lipinski’s rule of five 和 ADMET 分析评估化合物的药代动力学和毒性。
在研究结果方面:
- 基因相关性分析:研究人员通过在 GeneCards 数据库搜索,发现 PIK3CA 基因与 HNSCC 高度相关,其相关性得分高达 8.97,在影响 HNSCC 疾病进展的基因中排名第六。通过 COSMIC 数据库和 TCGA 数据库进一步分析,发现 PI3Kα 的突变主要集中在激酶区和螺旋区,且多为错义突变,H1047、E545 和 E542 是突变频率较高的氨基酸位点。同时,PIK3CA 在 HNSCC 等多种癌症组织中的表达明显高于正常组织12。
- STX-478 的支架跳跃优化:基于 STX-478 与 PI3Kα 的相互作用机制,研究人员进行支架跳跃优化,获得了 17834 种新化合物。这些化合物就像经过改造的 “小战士”,等待着进一步筛选3。
- 虚拟筛选与靶点预测:利用分子对接进行虚拟筛选,筛选出 12 种与 PI3Kα 结合能力较强的化合物。SuperPred 和 SwissTarget prediction 预测显示,这些化合物靶向 PI3Kα 的可能性较高,其中 J-16、J-53 等化合物的靶向概率甚至高于 STX-47845。
- 药代动力学和毒性评估:通过 Lipinski’s rule of five 和 ADMET 分析,研究人员发现多数化合物的理化性质和药代动力学特性良好,9 种化合物(除 J-16、J-32、J-47 和 J-263 外)在可接受范围内,其中 J-53 的肠道吸收能力较好,理化性质符合成药性要求67。
- 分子动力学模拟:对 PI3Kα-STX-478/J-53 系统进行分子动力学模拟,结果表明 J-53 能使 PI3Kα 更稳定,其与 PI3Kα 的结合能更低,形成的氢键数量更多,主要通过静电和范德华力相互作用。这意味着 J-53 就像一个 “强力胶水”,能更牢固地与 PI3Kα 结合89。
研究结论表明,PIK3CA 在 HNSCC 肿瘤组织中高表达且易突变,促进了肿瘤的发生和发展。研究人员通过对 STX-478 的结构优化,发现了 J-53(2 - 氧丙基脲化合物)这一潜在的变构 PI3Kα 抑制剂。J-53 结构新颖,与 PI3Kα 结合稳定,具有良好的安全性,有望成为治疗 HNSCC 的有效药物,还可能应用于其他 PI3Kα 突变高发的癌症,如乳腺癌。这项研究丰富了潜在变构 PI3Kα 抑制剂的研究数据,推动了 HNSCC 靶向药物的发展,为后续 J-53 的进一步评估指明了方向,为癌症治疗带来了新的希望。