探秘红鳍犁头鳅线粒体基因组：揭示亲缘关系，助力物种保护

研究人员开展红鳍犁头鳅（Sicyopus rubicundus）线粒体基因组研究，发现其与S. zosterophorus亲缘最近，提供保护基础。

　　红鳍犁头鳅（Sicyopus rubicundus）隶属虾虎鱼科（Gobiidae）瓢虾虎鱼亚科（Sicydiinae），具有较高的观赏价值。然而，其起源、演化及系统发育地位尚不明确。为深入了解这些方面，研究人员利用高通量测序技术获取了红鳍犁头鳅的线粒体基因组序列，该序列全长 16,499 bp，并对整个序列进行了结构分析。线粒体基因组的碱基组成表现出 AT 偏好性，包含 13 个蛋白质编码基因、22 个转运 RNA（tRNA）基因和 2 个核糖体 RNA（rRNA）基因 。除了位于负链上的烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶 6（nad6）基因外，其余蛋白质编码基因均位于正链。线粒体基因组存在基因重叠现象，排列紧密，重叠序列长度在 1 - 7 bp 之间，总长度为 21 bp，共有 6 处；基因间隔序列长度在 1 - 34 bp 之间，总长度为 58 bp，共有 11 处。研究人员基于瓢虾虎鱼亚科 29 个物种的线粒体全基因组序列，运用最大似然法和贝叶斯法构建了系统发育树，结果显示红鳍犁头鳅与带纹犁头鳅（Sicyopus zosterophorus）的遗传关系最为密切。该研究为红鳍犁头鳅的保护工作奠定了基础。