基于可解释手工特征的有丝分裂事件检测与分类研究成果显著

【字体: 时间:2025年03月04日 来源:Scientific Reports 3.8

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  研究人员为解决有丝分裂事件检测难题,开展相关研究,构建模型检测准确率高,具重要意义。

  在生命科学和医学研究的微观世界里,细胞就像一个个神秘的小精灵,它们的生长、分裂等行为蕴含着无数的奥秘。细胞群体及其行为的精确分析对于生物和医学研究极为关键,比如在组织工程领域,了解细胞如何生长和分化,有助于构建更有效的人工组织;在癌症研究中,掌握癌细胞的分裂规律,能为攻克癌症提供重要线索。
然而,目前细胞行为分析主要依靠显微镜观察和成像技术,这一过程需要人工手动操作,不仅耗时费力,而且传统的图像处理方法也存在诸多弊端。由于图像中存在噪声和伪影,一些现象容易被误判为有丝分裂事件,导致检测精度低下。同时,传统细胞成像方法在高细胞密度下性能不佳。为了解决这些难题,来自比利时 KU Leuven 大学的研究人员 Panason Manorost、Thomas Deckers 等人开展了一项关于有丝分裂事件检测和分类的研究,相关成果发表在《Scientific Reports》上。

研究人员采用了多种关键技术方法。首先,利用两个不同的数据集,即公开的相衬显微镜(PCM)数据集和无透镜成像(LFI)数据集。对于 PCM 数据集,通过将图像平均强度的两倍作为自适应阈值来检测感兴趣区域(AOI);对于 LFI 数据集,结合强度图像和相位图像的信息来分割 AOI。在细胞分割方面,PCM 数据集使用特定的迭代阈值和分水岭分割方法,LFI 数据集则运用 Otsu 阈值法。此外,通过计算欧几里得距离和重叠面积来进行事件跟踪和候选检测,从 AOI 和细胞中提取 67 个相关特征,并利用互信息和方差分析(ANOVA)进行特征选择,最后使用多种分类器进行有丝分裂事件检测。

研究结果如下:

  1. 图像分割和预处理:PCM 图像背景存在梯度变化,通过自适应阈值法能有效检测 AOI,其中包含两个圆形细胞的 AOI 对检测有丝分裂后期很重要;LFI 图像虽有噪声,但通过结合强度图像和相位图像能准确检测 AOI,且有丝分裂事件在强度图像中更易识别12
  2. 事件跟踪和候选检测:对比 PCM 和 LFI 数据集,发现 LFI 数据集能更准确检测有丝分裂事件,因为其包含两种输入图像,在高细胞密度条件下优势明显。研究人员共从 PCM 和 LFI 数据集中分别提取了 3,096 和 701 个有丝分裂事件候选34
  3. 特征提取:研究提取了 67 个与细胞和 AOI 特征以及动态活动相关的特征,发现分裂帧相关特征在分类中起重要作用。PCM 数据集的前三个特征大多与 AOI 相关,LFI 数据集的则主要是细胞相关特征,且 LFI 数据集特征的类间分离更明显56
  4. 分类:多种模型用于分类,结果显示大多数模型召回率较高,但精度有待提高。规则基模型使用较少特征就能取得较好效果,且 LFI 数据集所需特征数量明显少于 PCM 数据集。特征选择方面,PCM 数据集的 AOI 相关特征和 LFI 数据集的细胞面积属性相关特征较为重要78

研究结论和讨论部分指出,PCM 和 LFI 数据集虽分辨率提供的信息相当,但图像特征不同,导致有丝分裂事件的形态变化反映不同。LFI 数据集因输入类型多样,分类得分更优。研究还发现,从 67 个提取的特征中,3 个最佳分裂特征就能有效分离数据。与文献中的神经网络模型相比,该研究的模型更简单且可解释,仅用 10 个特征就能获得高分类分数,性能与神经网络模型相当。不过,该模型在有丝分裂检测方面表现良好,但在排除假阳性方面还有提升空间,后续可通过更好的图像分割或预处理来优化。同时,对于具有不同有丝分裂形态的细胞系,建议重新训练模型以适应新形态。

总的来说,这项研究为有丝分裂事件检测提供了一种新的、有效的方法,其可解释的特征和高效的模型为后续相关研究奠定了重要基础,有望推动组织工程、癌症研究等领域的进一步发展。
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