精准锁定:非酒精性脂肪肝小鼠内脏脂肪组织中稳健内参 miRNA 的筛选策略
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时间:2025年03月04日
来源:Journal of Biosciences 2.1
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为解决 PCR 实验中内参选择问题,研究人员筛选出 C57BL/6J 小鼠相关内参 miRNA,提供可靠策略。
在 PCR 实验设计中,尤其是差异表达研究里,选择合适的参考基因和材料至关重要。本研究提出了一种方法,用于鉴定由西式饮食和对照饮食交替诱导的非酒精性脂肪肝(NAFLD)的 C57BL/6J 小鼠内脏脂肪组织中稳健的内源性对照微小核糖核酸(miRNA) 。该研究概述了一种综合方法,通过微流控芯片结合小 RNA 测序进行微小核糖核酸内源性对照分析,并随后通过定量聚合酶链式反应(qPCR)和 RefFinder 算法进行验证。所纳入的标准包括倍数变化、p 值、每百万 reads 数以及基因稳定性评估。研究鉴定出了一组 6 个假定的内源性微小核糖核酸(miR-331-3p、let-7a-5p、miR-1839-5p、miR-151a-5p、let-7d-5p 和 let-7c-5p )。随后利用 RefFinder 算法进行的验证和分析评估了所选基因的稳定性,并确定了由 3 个最稳定的内源性微小核糖核酸对照(miR-331-3p、let-7a-5p 和 miR-1839-5p )组成的组合,它们表现出一致的表达模式且变异性最小。鉴于不存在通用的内源性对照,为了准确测量微小核糖核酸的表达,针对每个实验单独评估标准化因子势在必行。这种结合多种技术和评估的方法,为微小核糖核酸研究中鉴定和验证内源性对照提供了可靠的策略。
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