两种检测技术联合揭示意大利撒丁岛栓皮栎林疫霉属(Phytophthora)物种多样性
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时间:2025年03月04日
来源:Mycological Progress 2.1
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为探究栓皮栎林Phytophthora物种多样性,意大利研究人员开展调查,发现两种检测技术联合可更准确评估。
在过去几十年里,栓皮栎(Quercus suber)森林受到衰退事件的威胁日益加剧,这些衰退事件与疫霉属(Phytophthora)物种密切相关。研究人员进行了一项为期 3 年的调查,旨在分析意大利撒丁岛六个栓皮栎林分在两个不同季节(冬季和夏季)中疫霉属物种的多样性,同时对树木的健康状况进行了目视评估。研究人员通过土壤诱饵法和代谢条码技术(metabarcoding)进行分子检测,来探究从栓皮栎树采集的土壤中疫霉属物种的发生情况和多样性。总体而言,研究人员在 3 年的时间里,于夏季和冬季采集了来自栓皮栎(51 株)、草莓树(Arbutus unedo,5 株)、树状欧石楠(Erica arborea,2 株)和海岸松(Pinus pinaster,1 株)的 354 份根际土壤样本,并利用诱饵法进行处理。此外,研究人员还对 2020 年夏季采集的 59 份样本通过代谢条码技术进行了分析。综合两种检测技术,59 棵树中有 35 棵检测出疫霉属物种呈阳性。通过土壤诱饵法检测出 6 种疫霉属物种,分别是樟疫霉(P. cinnamomi)、栎疫霉(P. quercina)、拟隐疫霉(P. pseudocryptogea)、第勒尼安疫霉(P. tyrrhenica)、嗜冷疫霉(P. psychrophila)和 × 肉生疫霉(P.×cambivora)。所有这些物种在冬季均有检测到,而在夏季仅分离出樟疫霉(P. cinnamomi)、第勒尼安疫霉(P. tyrrhenica)和拟隐疫霉(P. pseudocryptogea)。代谢条码技术检测出了恶疫霉(P. cactorum)、樟疫霉(P. cinnamomi)、栎疫霉(P. quercina)和第勒尼安疫霉(P. tyrrhenica),以及两种与恶疫霉(P. cactorum)和栎疫霉(P. quercina)密切相关的未知疫霉属分类群。总体而言,六个季节的诱饵法检测出的物种数量多于单次代谢条码技术检测。然而,在同一采样季节中,代谢条码技术检测出的阳性样本数量更多,分类群的多样性也更高。这项研究表明,整合这两种诊断技术对于更准确地评估森林生态系统中疫霉属的多样性和分布至关重要,这在植物检疫调查中具有重要意义。
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