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为解决耐药铜绿假单胞菌(P. aeruginosa)感染治疗难题,研究人员对 fMGyn-Pae01 噬菌体展开研究,发现其特性及应用潜力。
在微观的生物世界里,细菌与噬菌体的 “战争” 从未停止,而这场 “战争” 的走向,对于人类健康有着至关重要的影响。铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)作为一种机会致病菌,属于 ESKAPE 病原体(包括粪肠球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和肠杆菌属等),是医院感染的主要病原体之一,并且对抗生素具有高度耐药性 。它能引发多种感染,如肺炎、菌血症、手术伤口感染和烧伤伤口感染等,尤其在免疫功能低下的患者中更为常见。更为棘手的是,它还能形成生物膜(Biofilm),这种结构比浮游细胞更能抵抗抗生素,容易导致慢性感染。目前,治疗铜绿假单胞菌感染越来越困难,因此,寻找新的治疗方法迫在眉睫,噬菌体疗法(Phage therapy)便成为了研究的热点。
来自芬兰赫尔辛基大学和赫尔辛基大学医院的研究人员 Kira Ranta、Mikael Skurnik 和 Saija Kiljunen 等,针对铜绿假单胞菌感染治疗难题,开展了对噬菌体 fMGyn-Pae01 的研究。相关研究成果发表在《Virology Journal》上。该研究为铜绿假单胞菌感染的治疗提供了新的思路和潜在方案,对推动噬菌体疗法的发展具有重要意义。
在这项研究中,研究人员运用了多种关键技术方法。电子显微镜技术用于观察噬菌体的形态;全基因组测序(Whole genome sequencing,WGS)及生物信息学分析,对噬菌体基因组进行测序、注释和比较分析,以确定其基因特征和进化关系;通过液体培养法检测噬菌体的宿主范围;利用突变体筛选和测序技术,分离噬菌体抗性突变体并分析其基因突变情况;采用运动性测定、噬菌体吸附测定和生物膜测定等实验,研究噬菌体与宿主细菌之间的相互作用。
研究结果如下:
- 噬菌体分离与形态:从商业噬菌体鸡尾酒中成功分离出 fMGyn-Pae01 噬菌体。电子显微镜分析显示,它具有二十面体头部和可收缩尾部,属于肌尾噬菌体(Myovirus)形态,尺寸符合 Jumbo 噬菌体(基因组大小在 200kb - 500kb 的噬菌体)特征。
- fMGyn-Pae01 是类似 phiKZ 的 Jumbo 噬菌体:对 fMGyn-Pae01 进行全基因组测序,其基因组大小为 277,803bp,编码 358 个预测基因。基因组分析表明,它与 phiKZ 相似,属于 Chimalliviridae 科,且不含有与溶原性、细菌毒力或抗生素抗性相关的基因,符合治疗性噬菌体的安全要求。通过与其他噬菌体基因组的比较,发现它与 26 个最接近的噬菌体基因组序列同一性较高,与 phiKZ 和 OMKO1 的整体基因组同一性分别为 98.47% 和 99.49%,应被视为同一物种的菌株。
- fMGyn-Pae01 具有广泛的宿主范围:研究人员用 fMGyn-Pae01 对 142 种细菌菌株进行感染测试,发现它能有效感染 43% 的铜绿假单胞菌菌株,低效感染 7% 的铜绿假单胞菌菌株,且感染敏感性不依赖于 O - 血清型,表明其具有较广的宿主范围,但它仅能感染铜绿假单胞菌,不感染其他测试的细菌物种。
- fMGyn-Pae01 利用细菌鞭毛作为受体:为确定噬菌体受体,研究人员分离出 5 个 fMGyn-Pae01 抗性突变体并进行全基因组测序,发现突变体的基因突变均影响了鞭毛生物合成或相关调控基因。运动性测定和噬菌体吸附测定结果表明,fMGyn-Pae01 利用细菌鞭毛作为噬菌体受体来启动感染。
- fMGyn-Pae01 不能防止生物膜形成:研究人员评估了 fMGyn-Pae01 对生物膜形成的影响,结果显示它对生物膜形成没有抑制作用,反而在野生型菌株中略有增加生物膜形成的趋势。
研究结论和讨论部分指出,fMGyn-Pae01 是一种裂解性、类似 phiKZ 的 Jumbo 噬菌体,具有广泛的宿主范围,使用细菌鞭毛作为噬菌体结合受体,且未发现与毒力、抗性相关基因,在噬菌体疗法方面具有安全性。然而,它不能抑制细菌生物膜形成,这可能会降低其作为单一噬菌体在生物膜相关疾病治疗中的潜力。但考虑到其广泛的宿主范围、来自商业噬菌体疗法鸡尾酒以及类似噬菌体 OMKO1 已成功用于治疗的情况,fMGyn-Pae01 仍适合用于噬菌体疗法。未来,可进一步研究将其与其他噬菌体联合使用,以提高对铜绿假单胞菌感染的治疗效果,为解决耐药菌感染问题提供更有效的方案。