综述:燕麦根际土壤中发现鞘氨醇单胞菌属新物种
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时间:2025年03月06日
来源:Current Microbiology 2.3
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研究人员从燕麦根际土壤分离出菌株 GR2756T,经分析确定其为鞘氨醇单胞菌属新物种。
从燕麦(Avena sativa L.)根际土壤样本中,分离出了一种革兰氏染色阴性、需氧、杆状且呈黄色的细菌,命名为菌株 GR2756T。该菌株 GR2756T能在 15 - 35°C、pH 值 6.0 - 8.0、NaCl 浓度 0 - 1.5%(w/v)的环境下生长。基于 16S rRNA 基因序列的系统发育分析显示,菌株 GR2756T与蚯蚓堆肥鞘氨醇单胞菌(Sphingosinicella vermicomposti)YC7378T(相似度 95.7%)、土壤鞘氨醇单胞菌(Sphingosinicella humi)QZX222T(相似度 95.6%)和蒙山鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas montis)DRJ - 4T(相似度 95.5%)聚类在一起。菌株 GR2756T的主要呼吸醌系统为泛醌 Q - 10(ubiquinone Q - 10),主要多胺为高亚精胺(homospermidine)。检测到菌株 GR2756T的主要脂肪酸为 C16:0、特征总和 3(C16:1ω7c 和 / 或 C16:1ω6c)、特征总和 8(C18:1ω7c 和 / 或 C18:1ω6c)、C17:1ω6c 和 C16:0 2 - OH。主要极性脂质为磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine,PE)、磷脂、糖脂和未鉴定的极性脂质。其基因组 DNA 的 G + C 含量为 63.2%。菌株 GR2756T与土壤鞘氨醇单胞菌(S. humi)CCTCC AB 2018030T之间的平均核苷酸同一性(ANI)和数字化 DNA - DNA 杂交(dDDH)值均低于已提出并普遍认可的物种界限。基于表型、基因型和系统发育分析,菌株 GR2756T代表鞘氨醇单胞菌属(Sphingosinicella)的一个新物种,提议将其命名为嗜根鞘氨醇单胞菌(Sphingosinicella rhizophila)sp. nov.。这个新分类单元的模式菌株为菌株 GR2756T(= CCTCC AB 2023102T = CGMCC 1.61580T = NBRC 116723T)。
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