揭开拉恩氏菌属(Rahnella)的神秘面纱:比较基因组学解析R. aquatilis的进化、毒力与抗性
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时间:2025年03月06日
来源:Current Microbiology 2.3
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研究人员开展拉恩氏菌属比较基因组学研究,揭示了R. aquatilis进化等特征,意义重大。
拉恩氏菌属(Rahnella)已从人类、鱼类和水环境中分离出来。最近有研究报道,从鲫鱼(Carassius auratus)中分离出一种新型病原体 —— 水生拉恩氏菌(R. aquatilis)菌株 KCL-5,并对其进行了基因组鉴定。为探究水生拉恩氏菌(R. aquatilis)的细菌毒力和抗性特性的进化,研究人员对包括水生拉恩氏菌(R. aquatilis)、变栖拉恩氏菌(R. variigena)、布鲁氏拉恩氏菌(R. bruchi)和维多利亚拉恩氏菌(R. victoriana)在内的拉恩氏菌属菌株进行了比较基因组学分析。这项分析提供了拉恩氏菌属基因组多样性的最新信息,涵盖了毒力和抗性的比较分析、共线性分析、单核苷酸多态性分析、平均核苷酸同一性分析、核心基因分析、基因家族分析以及基因组岛分析。研究发现,与其他拉恩氏菌属物种相比,维多利亚拉恩氏菌(R. victoriana)是与水生拉恩氏菌(R. aquatilis)亲缘关系最近的姊妹种。通过比较基因组分析,研究人员还鉴定出多个编码可能有助于抗菌抗性和致病因素的功能基因,包括多药抗性外排泵、黏附、侵袭和分泌系统相关基因。据了解,这是首次对拉恩氏菌属物种的比较基因组特征进行更详细的研究,有助于深入理解该菌属的多样性和进化,以及水生拉恩氏菌(R. aquatilis)的毒力。
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