探秘冠状病毒 ExoN 结构域：进化轨迹与结构保守性的深度剖析

为探究病毒基因组校对机制，研究人员开展对冠状病毒 ExoN 的研究，揭示其进化与结构特征，意义重大。

　　维持基因组完整性是病毒的基本特征，然而，依赖 RNA 的 RNA 聚合酶（RdRp）缺乏用于校对的核酸外切酶活性。为了促进病毒基因组的校对，一个独立的核酸外切酶结构域会协助 RdRp 在复制过程中维持保真度。与 DNA 病毒的高保真度不同，RNA 病毒必须通过相对精细的诱变活性进化出新的变体，以实现遗传多样性。冠状病毒科（Coronavirideae）是一类单股正链 RNA（+ ssRNA）病毒，它们精心维持着遗传多样性和大尺寸 RNA 基因组之间的平衡。在冠状病毒中，校对活性由位于非结构蛋白 14（nsp14）N 端的核酸外切酶（ExoN）结构域完成。ExoN 负责产生新的变体以及对核苷酸类似物的抗病毒耐药性。在这里，研究人员利用明确的系统发育分析流程和基于宿主及生存环境的结构分析，对 ExoN 进行了进化特征描述。研究人员对 ExoN、甲基转移酶结构域、nsp14 以及含有 ExoN 的病毒的全基因组进行了系统发育分析。此外，还对来自不同来源的 ExoN 结构域进行了三维结构比较，以了解其结构保守性。这项研究揭示了冠状病毒科中 ExoN 结构域的进化轨迹和结构保守性，突出了它独立于其他结构域的独特进化路径。结构分析显示，均方根偏差（RMSD）值的差异极小，这强调了尽管生态环境多样，但 ExoN 仍具有保守性。